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样品制备不管哪种方法用于确定残留DNA，分析的成功都取决于初始样品的处理。每种测定在其对残留物的敏感性（例如，有机溶剂，洗涤剂，高盐浓度，乙醇或残留蛋白）的敏感性，必须考虑基质特异性预处理。为了确保使用测定和样品基质的适用性，应考虑以下预处理：有机提取，蛋白酶K处理，磁珠，无酚WAKO提取或其他基于柱的核酸结合方法，以及乙醇的降水，并添加共同体。重要的是要注意，产品纯化过程的变化会影响样品矩阵，这可能会影响分析方法。
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