元生物研究为我们对微生物及其宿主之间的相互作用以及它们的共同进化做出了重大贡献。大多数研究目前都集中在细菌群落上,而古细菌通常保留在与元素相关的研究中。在这里,我们描述了整个生命的系统发育树中总共有11种古典和新兴的多细胞模型生物的考古。为了确定每个宿主的微生物群落组成,我们利用了古细菌和细菌特异性16S rRNA基因扩增子的组合。在每个多细胞宿主中,描述了两个原核生物领域的成员。此外,确定了针对海洋模型的细菌和古细菌群落之间的特定宿主和可能的相互作用伙伴的关联。我们的数据表明,海洋中的考古宿主主要由硝基脂肪科和纳米章,这代表了Porifera中的Keystone分类单元。陆地宿主中的考古存在差异很大。关于大量的古细菌分类单元,它们在水生环境中具有更高比例的甲烷藻。我们发现,古细菌社区的多样性要比其细菌的多样性要少得多。古细胞扩增子序列变体通常是宿主特异性的,表明通过与宿主共进化来适应。我们的数据显示了很大的比例虽然水生细菌的丰富度比陆地宿主高,但在古细菌数据集中无法观察到这些群体之间的多样性和丰富性的显着差异。