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扭转菌株下的抽象DNA经历了屈曲过渡，这是Plectoneme成核和超级旋转动力学的基本步骤，这对于处理基因组信息至关重要。尽管其重要性，但屈曲过渡的定量模型，尤其是解释了当前缺少单分子镊子揭示的RNA屈曲时间和DNA屈曲时间之间令人惊讶的两级差异。此外，关于屈曲过渡过程中DNA的配置知之甚少，因为它们不是直接观察到的实验。在这里，我们使用离散的蠕虫样链模型和布朗动力学来模拟DNA/RNA屈曲过渡。我们的模拟与屈曲过渡的实验确定的参数非常吻合。模拟表明，屈曲时间在很大和指数上取决于弯曲刚度，这是DNA和RNA之间测得的差异的一半以上。分析我们的模拟揭示的链的显微镜构象，我们发现了螺线管形过渡状态和卷曲中间体的明确证据。卷曲中间的具有单个环，并且在低力下越来越占人群。综上所述，模拟表明，类似蠕虫的链模型可以半定量地进行DNA和RNA的屈曲动力学。
双重屈曲过渡的动力学
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