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抽象的微生物已经居住在海洋和土壤中已有数百万年了，并且独特地适合其栖息地。相比之下，现代城市的下水道基础设施只能追溯到还可以。 150年。下水道管道运输人类废物，并为公共卫生提供了视野，但是可能调节这些特征的常驻生物是没有探索的。在这里，我们表明，在71个美国城市未经处理的废水中测序的细菌组合在序列水平上是高度相干的，这表明由大空间距离隔开的城市基础设施可能会引起惊人的相似社区。在整个微生物群落结构中，温度对密切相关的扩增子序列变体的分布模式产生了明显的影响，从而导致温暖和冷的生态型。两个细菌属在大多数城市中都占主导地位，无论其大小或地理位置如何；平均而言，Arcobacter占整个社区的11％和10％。对六个城市的宏基因组分析揭示了这些高度丰富的居住生物具有临床上重要的抗生素耐药基因BLA CTX-M，BLA OXA和BLA TEM。相比之下，人类粪便仅考虑； 13％的社区；因此，从人类来源到下水道系统的抗生素耐药基因输入可能相对较小，这将影响使用废水监测人类种群时的测量能力。随着对这些庞大的管道网络中微生物的代谢潜力的认识，以及检查人口健康的能力，及时提高了我们对这些系统生态学的理解。
城市生态系统的肠道：下水道基础设施的微生物生态
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