对于每个DiDail omni-c文库,将染色质与甲醛固定在原子核中,然后提取。用DNase I消化了固定的染色质,将染色质末端修复并连接到生物素化桥适配器,然后将含有末端的衔接子接近粘合。接近连接后,将交联后逆转并纯化了DNA。纯化的DNA以去除未结扎片段内部的生物素。使用NEBNEXT Ultra酶和Illumina兼容适配器生成测序文库。在每个文库富集之前,使用链霉亲和素珠分离含生物素的片段。库是在Illumina Hiseqx平台上测序的,以产生约30倍的序列覆盖率。然后Hirise使用MQ> 50读脚手架的读数(有关数字,请参见上面的“读取对”)。