使用NF核心工作流程的NF核/Ampliseq版本2.8.0进行了使用,利用Bioconda和Biocontainers项目的可重复的软件环境[35-38]。使用FASTQC(版本0.12.1)评估数据质量,并用MultiQC(版本1.18)进行汇总[39]。序列,以消除Phix污染,修剪读数(以275 bp为单位读取和265 bp的反向读数;丢弃的读数短于265 bp),以> 2的预期错误,以更短的读数,以纠正错误,以纠正poirors real paie paik&remoge paik&remoge paike&删除paike&remaas chimeras chimeras chimeras chimeras。最终,在所有样品中获得了3880个扩增子测序变体(ASV)[40]。保留了每个样品读数的29.81%和44.06%(平均36.8%)。ASV计数表包含