人类阴道具有多种微生物(细菌,病毒和真菌)对妇女健康的深刻影响。对多个王国的阴道微生物组的基因组水平分析仍然有限。在这里,我们利用元基因组测序数据和真菌培养来建立阴道微生物基因组收集(VMGC),其中包括33,804个微生物基因组,涵盖786种原核生物,11种真菌物种和4,263个病毒性分类学单元。值得注意的是,超过25%的原核生物和85%的病毒性分类单元仍未进行。该收集显着丰富了基因组多样性,特别是对于普遍的阴道病原体,例如BVAB1(未培养的细菌性阴道病相关细菌)和杏仁核菌群。(BVAB2及相关物种)。利用VMGC,我们表征了原核生物的功能性状,尤其是sacCharofermentanales(一种不流动的但普遍的秩序),以及原核生物和真核生物病毒,为他们的壁co适应和潜在的角色提供了洞察力。VMGC是研究阴道菌群及其对阴道健康的影响的宝贵资源。