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下一代测序（NGS）基于靶向基因面板，外显子组测序（ES）和基因组测序（GS）现在通常用于询问大量基因以供诊断使用。否则对所选的测定法，具有高序列同源性的基因仍然是短读技术的主要挑战，并且可能导致假阳性和假阴性诊断错误。长阅读测序有可能解决许多基因的问题，但是对同源序列的分析通常需要先进的生物信息学管道，这些管道尚未验证用于临床使用。传统上，实验室使用了靶向的Sanger测序和/或远程PCR技术来解决这些基因。这些方法是基因特异性的，难以设计，并且在临床环境中执行昂贵。具有同源性的目标区域是复杂的，可以通过不同程度的同源性，医学相关性和同源性类型（功能同源性，已知的假基因，部分或基因同源性，未表征的非编码区域）进行划分。为了满足这种未满足的需求，我们描述了使用CRISPRCHEAN®技术的概念证明，该技术利用CRISPR-CAS9系统的特异性来降低了下一代测序库中丰富的，无信息的序列。
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