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PRPE，一种来自枯草芽孢杆菌的PPP蛋白磷酸酶，具有异常的底物
蛋白质磷酸化或去磷酸化是在所有生物体中发现的信号传递的重要机制。多年来，蛋白激酶和磷酸酶的性质被认为在原核生物和真核生物中是不同的。证明主要发生在组氨酸和天冬氨酸残基上，而相反，通常在丝氨酸，苏氨酸或酪氨酸残基上修饰真核蛋白。然而，近年来在细菌中报道了真核样蛋白激酶和磷酸酶，相反，在真核生物中发现了原核性蛋白质的ASP酶的同源物（有关评论，请参见[1-7]）。这些研究表明，真核生物和原核生物可能具有所有类型的信号转导的相似机制。蛋白磷酸酶可以根据其酶特异性（即促磷酸酶和Tyr磷酸酶）分为两组[8,9]。ser} THR磷酸酶在ITRO中显示出广泛的特异性，并已分为四类：PP1，PP2A，PP2B和PP2C，根据保守的基序，它们对抑制剂和离子的抑制剂和离子需求的敏感性[9-11]。氨基酸序列比较表明PP1，PP2A和PP2B是同一PPP家族的成员[10]。PPP家族代表了较高的真核生物中蛋白质ser}的最大蛋白质ser} [12]。这些酶还与对称的折断氨酸四磷酸酶具有序列相似性[13]。被识别的PPP家族的第一个原核生物是噬菌体λ221的乘积[14]。目前，几个成员在ARCHEA和细菌中均已详细介绍[15-19]。但是，关于生理学的数据很少
枯草芽孢杆菌NCD-2在不同作物中的定殖能力及其对根际微生物的影响
摘要：枯草芽孢杆菌菌株NCD-2是一种有希望的土壤传播植物疾病的生物防治剂，并且显示出促进某些农作物生长的潜力。这项研究的目的是分析不同作物中NCD-2菌株的定殖能力，并通过根际微生物组分析揭示NCD-2菌株的植物生长促进机制。QRT-PCR用于确定NCD-2菌株的种群，并在应用NCD-2菌株后通过扩增子测序分析微生物群落的结构。结果表明，NCD-2菌株对番茄，茄子和胡椒具有良好的生长促进作用，并且在茄子根际土壤中最丰富。在施用NCD-2菌株后，用于不同作物的有益微生物的类型存在显着差异。PICRUST分析表明，氨基酸传输和代谢，辅酶运输和代谢，脂质转运和代谢，无机离子运输和代谢的相对丰度，以及在Pepper和Eggplant rhizospers a rhizospers of cotter somatiz somaties and somaties and somaties and somaties and somator and somaties and somaties and proplant和applant somation和sopplant somaties prosplant and somation and propplant和代谢机制。总而言之，NCD-2对五个植物的定殖能力不同。 应用NCD-2菌株后，微生物群落在不同植物的根际的结构中存在差异。 根据这项研究中获得的结果，得出的结论是，NCD-2菌株的生长促进能力与其定植量和招募的微生物物种相关。总而言之，NCD-2对五个植物的定殖能力不同。应用NCD-2菌株后，微生物群落在不同植物的根际的结构中存在差异。根据这项研究中获得的结果，得出的结论是，NCD-2菌株的生长促进能力与其定植量和招募的微生物物种相关。
bsgatlas：统一的枯草芽孢杆菌基因组和转录组注释图集，具有增强的信息访问
2020年7月29日收到； 2021年1月11日接受；于2021年2月4日出版：作者隶属关系：1个非编码RNA技术与健康中心，哥本哈根大学兽医和动物科学系，1871年，丹麦Frederiksberg，哥本哈根大学； 2荷兰荷兰癌症研究所的致癌基因组学司，荷兰阿姆斯特丹1066； 3哥本哈根大学生物学系计算和RNA生物学部分，丹麦哥本哈根1165；丹麦的Bagsværd4 Novozymes。*通信：Jan Gorodkin，Gorodkin@rth。DK关键字：B。uttilis;基因组注释；非编码和结构化RNA；操纵子。缩写：Asrna，反义RNA； CD，编码序列；去，基因本体论； GRNA，导向RNA； Ji，Jaccard索引； ncRNA，非编码RNA； SRNA，小RNA； TMRNA，转移Messenger RNA； TSS，转录开始站点； TTS，转录终止位点； TU，转录单元； UTR，未翻译区域。†目前地址：英国索尔福德大学科学，工程与环境学院。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用四个补充表和九个补充数据。000524©2021作者
生物信息学分析L-天冬酰胺酶结构（枯草芽孢杆菌），中嗜（Kibdelosporangium）和嗜热（Thermoco
抽象背景：L-天冬酰胺酶在治疗急性淋巴细胞白血病（ALL）方面用作抗癌药。此外，它在医学，食品和制药行业中广泛应用。方法：源自枯草芽孢杆菌的L-天冬酰胺酶的核苷酸和氨基酸序列最佳7613，kibdelosporangium sp。MJ126-NF4和kodakarensis kod1是从GenBank和NCBI数据库中获得的。使用Clustalw 1.83进行了浮雕水的成对序列比对。使用瑞士模型软件进行了研究的不同L-天冬酰胺酶分子的二级和三级蛋白质结构的预测。此外，使用Prosite软件分析了源自三种细菌的L-天冬酰胺酶的蛋白质结构域。使用蛋白质PI计算器（http：// isoelectric.ovh.org/）预测理论等电点（PI），分子量和氨基酸组成。结果：尽管三种细菌菌株中L-天冬酰胺酶的结构差异，但其功能特征没有差异，包括分子量，PI和功能域。结论：分析结构差异并找到功能相似性可用于设计具有较高稳定性和生物半衰期的药物。我们的分析表明，具有不同结构的蛋白质可能具有相似的功能特征，这证明了密码子使用假设。关键字：天冬酰胺酶，淋巴细胞白血病，生物信息学
通过微型DNA核酸酶ISCB
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637773 doi：Biorxiv Preprint
抗螺旋内乳房蛋白质抗螺旋体ZEA菌株的染色体规模基因组组装蛋白
Helicoverpa Zea（鳞翅目：夜养科）是北美洲和南美主要种植作物的害虫。该物种适应了不同的宿主植物，并对几种杀虫剂产生了抗性，包括苏云金芽孢杆菌（BT）杀虫蛋白在转基因棉和玉米中。Helicoverpa Zea种群在热带和亚热带地区全年持续存在，但是季节性迁移到温带地区增加了相关作物损害的地理范围。为了更好地了解这些生理和生态特征的遗传基础，我们为来自BT抗性菌株的单个H. Zea雄性HAZSTARK_CRY1ACR生成了高质量的染色体水平组装。HI-C数据用于将最初的375.2 MB重叠组装脚手架成30个常染色体和Z性染色体（支架N50 = 12.8 MB和L50 = 14）。SCAF折叠组件是通过新型管道PolishClr对错误校正的。线粒体基因组通过改进的管道组装并注释。对该基因组组装的评估表明，鳞翅目基准通用单拷贝直系同源物集的98.8％是完整的（98.5％作为完整的单副本）。重复元素约占组装的大约29.5％，其多数（11.2％）被归类为恢复元素。这个针对H. Zea的染色体规模参考组件，Ilhelzeax1.1，将促进未来的研究，以评估和增强可持续的作物生产实践。
促进芽孢杆菌的芽孢杆菌D19培养条件对Neoscytalidium dimidiatum
摘要 - 真菌Neoscytalidium dimidiatum是一种病原体，可引起各种植物中的疾病，特别偏爱火龙果。在寻求对火龙果中二二孢菌疾病的安全有效控制时，重点是针对生物控制的研究。这项研究研究了针对n个二二硫代的有利的抗真菌活性的促进杆菌D19培养条件。在由0.5 g/l MGSO 4组成的定义培养基中，在45 o C的培养中达到了最高的抗真菌活性，持续21 rpm。7 H 2 O，3.0 g/l nah 2 PO 4。2 H 2 O，3.0 g/L Na 2 HPO 4。 12 h 2 O，10 g/l蔗糖和10 g/l肽的初始pH 6.0。 此外，发现细菌培养的抗真菌活性在小于60 O C的温度下是稳定的，pH条件范围为7.0至9.0。 总体而言，这项研究的结果为将来研究生物拮抗剂在控制植物中的N. dimidiatiatum疾病中的应用奠定了基础。 关键词：抗真菌，杀菌杆菌，培养条件，火龙果，Neoscy-talidium dimidiatum。2 H 2 O，3.0 g/L Na 2 HPO 4。12 h 2 O，10 g/l蔗糖和10 g/l肽的初始pH 6.0。此外，发现细菌培养的抗真菌活性在小于60 O C的温度下是稳定的，pH条件范围为7.0至9.0。总体而言，这项研究的结果为将来研究生物拮抗剂在控制植物中的N. dimidiatiatum疾病中的应用奠定了基础。关键词：抗真菌，杀菌杆菌，培养条件，火龙果，Neoscy-talidium dimidiatum。
风险和技术评估 - GM枯草芽孢杆菌的应用A1282用作加工援助
B.枯草厂已被欧洲食品安全局（EFSA）授予合格的安全性（QP），并具有缺乏细胞毒性活性的资格（EFSA Biohaz Panel等，2023年）。QP评估微生物的分类学身份，知识的相关体，潜在的安全问题和抗菌素耐药性。除了EFSA的认证外，枯草芽孢杆菌还根据美国环境保护署（EPA）法规具有1级豁免（EPA，1997年）。从枯草芽孢杆菌中得出的加工辅助工具先前已被美国FDA普遍认为是安全（GRA）的状态。食品添加剂联合专家委员会（JECFA）对枯草芽孢杆菌进行了技术审查，证实了其用作酶生产的安全菌株（Jecfa，2006年）。
磷酸盐溶解和新的根际微生物的鹰嘴豆生长增强龙舌兰杆菌和trichoderma Orientale
摘要：从阿尔及利亚健康鹰嘴豆的根际分离出的两种甲状腺素菌菌株和三个芽孢杆菌菌株的体外磷酸盐溶解能力以及对池塘实验中鹰嘴豆幼虫的生长影响进行了评估。所测试的微生物具有较高的磷酸盐溶解活性，溶解度指数范围为2.41至7.40。溶解化磷酸盐的浓度从30.17到157.44μg/ml不等。在龙舌兰杆菌BT1（157.44μg/ml）和Trichoderma Orientale T1（143.33μg/ml）的两种培养滤液中观察到了最大磷酸盐 - 溶解活性，并伴随着4.51至5.75的pH降低。分别使用菌株（B.龙舌兰B. tequilensis bt1和T. t. t.），结合使用，通过促进种子的发展并有效增强植物生长，对发芽产生有益的作用。鹰嘴豆幼苗与单独的治疗相比，用B.龙舌兰芽孢杆菌BT1和T. Orientale T1的混合物一起处理，表现出更好的营养生长。据我们所知，这是组合微型iSms b的磷酸盐溶解潜力的第一份报告。Tequilensis和T. Orientale及其促进鹰嘴豆植物生长的能力。
补充芽孢杆菌法属芽孢杆菌对断奶猪的性能，全身免疫和肠道菌群的影响，并用致病性的肠毒素大肠杆菌F18
这项研究的目的是研究饮食补充芽孢杆菌的影响（B.）淀粉菌对断奶猪的生长性能，腹泻，全身免疫和肠道菌群的实验感染了F18肠毒素大肠杆菌（ETEC）。单独容纳50只断奶猪（7.41±1.35 kg bw），并随机分配给以下五种治疗方法之一：假控制（con-），Sham B. amyloliquefaciens（bam-）（BAM-），受到挑战的控制（con +），受到挑战的B. amyloliquefiquefaciens（B. amyloliquefiquefaciens）（BAM +）（BAM +）和挑战Carbadex（agp）（agp + carbadex）。实验持续了28天，适应7天，第一次ETEC接种后21天。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。 与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。 ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。 与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。在回肠摘要中，BAM +中的香农指数高于AGP +中的div>。bray-curtis pcoa在第21 pi pi中从假猪与ETEC感染的猪收集的卵植物中显示了细菌群落组成的不同。但是，用BAM +中的猪的富度（p <0.05）的相对丰度更大，但在卵形 +猪中，放线菌和杆菌的相对丰度（p <0.05）的相对丰度低于AGP +中的猪。iLeal Digesta具有比BAM +中的Pig较高（p <0.05）的塞梭菌strictu stricto 1，但比猪更低（p <0.05）。总而言之，补充淀粉芽孢杆菌倾向于增加ADG，并且对ETEC感染的猪腹泻的影响有限。