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针对Pan-Raf和垂直MAPK抑制作用BRAF激酶融合
BRAF激酶融合是基因组结构变异的一种形式，是驱动器阴性黑色素瘤中的复发事件。虽然BRAF融合可重复保存激酶结构域，但具有5'基因伴侣和特定BRAF断裂点的遗传变异性。我们研究了BRAF激酶融合的遗传多样性如何影响二聚体信号传导和ERK激活。我们与5'基因伙伴（包括AGK，ZKSCAN1，ARMC10，PPFIBP2和TRIM24）的BRAF融合过过表达，并发现依赖融合的信号传导和抑制剂敏感性。尽管有下一代RAF抑制剂的发展，但多种pan-Raf抑制剂仍存在矛盾的ERK磷酸化，在某些BRAF融合中，使用TrameTinib和Ly3009120改善了垂直RAF/MEK抑制的某些BRAF融合。共同观察到了一些融合依赖性作用，但肿瘤的生长抑制和垂直途径抑制的矛盾激活的分辨率。
基于共面卟啉的同质异形体的合成策略
相应地，强相互作用的金属位点是许多多核金属蛋白（如血蓝蛋白、[1,2] 血红蛋白、[3] 超氧化物歧化酶、[4] 一氧化碳脱氢酶 [5] 和细胞色素 c 氧化酶）独特催化活性的基础。[6] 为了进一步了解此类复合物独特的配位化学，理想情况下需要一个刚性分子系统，该系统可以调节不同金属中心之间的距离，而不会通过显著改变配体场来影响它们。然后，可以通过刚性框架的轻微变化来改变金属中心之间的相互作用，特别是那些产生协同催化效应的相互作用。在这种情况下，一个感兴趣的系统是共价连接的二聚卟啉金属复合物，它可以通过系统的结构变化进行调节，并且其协同性质可以与相应组成单体的协同性质进行比较。
跨膜信号传导和抗抑郁药诱导的受体酪氨酸激酶TRKB
神经营养受体参与了脑发育和神经塑性的调节，因此可以作为抗癌和中风恢复药物，抗抑郁药等的靶标。需要阐明各种状态下TRK蛋白结构域在各种状态下的结构，以允许合理的药物设计。然而，关于trk受体的跨膜和叶膜结构域的构象知之甚少。在本研究中，我们采用NMR光谱来解决脂质环境中TRKB二聚体跨膜结构域的结构。我们使用诱变并确认该结构对应于受体的活性状态。随后研究TRKB与抗抑郁药氟西汀的相互作用和抗精神病药物氯丙嗪提供了一种明确的自谐模型，描述了氟西汀通过与其跨膜结构结合而激活受体的机制。
B. R. Ambedkar University-Srikakulam博士
单元-V 1。羧酸和衍生物6 h命名法，羧酸的分类和结构。通过a）a）氮水解的制备方法，酰胺b）用酸和碱水解酯的水解，并具有机制c）碳化剂的碳化。通过a）侧链氧化制备芳香酸的特殊方法。b）苯二氯化物的水解。c）kolbe反应。物理特性：氢键，二聚体缔合，酸的酸度 - 三甲基乙酸和三氯乙酸的实例。芳族和脂肪族酸的酸度的相对差异。化学特性：涉及H，OH和COOH基团的反应 - 盐的形成，甲基藻形成，酸氯化物形成，酰胺形成和酯化（机制）。通过huns-diecker反应，schimdt反应，arndt-eistert合成，地狱沃尔哈德·泽林斯基反应的卤化，羧酸降解。
DDMDE消除了DNA引导的DNA靶向质粒侵袭
水平基因转移是细菌进化的关键驱动力，但它也通过引入侵入性的移动遗传元素给细菌带来了严重的风险。为了应对这些威胁，细菌开发了各种防御系统，包括原核生物Argonautes（Pago）和DNA防御模块DDMDE系统。通过生化分析，结构测定和体内质粒清除分析，我们阐明了DDMDE的组装和激活机制，从而消除了小型多拷贝质粒。我们证明了一种类似pago的蛋白DDME充当催化性，DNA引导，靶向DNA靶向防御模块。在存在引导DNA的情况下，DDME靶向质粒并募集二聚体DDMD，其中包含核酸酶和解旋酶结构域。与DNA底物结合后，DDMD从自身抑制的二聚体转变为活性单体，然后沿着并裂解质粒。一起，我们的发现揭示了DDMDE介导的质粒清除的复杂机制，从而为针对质粒入侵的细菌防御系统提供了基本见解。
桥肽异二聚体
肽异二聚体在自然界中普遍存在，它们不仅是功能性大分子，而且是化学和合成生物学的分子工具。计算方法也已被开发用于设计具有高级功能的异二聚体。然而，这些肽异二聚体通常通过非共价相互作用形成，易于解离并容易发生浓度依赖性非特异性聚集。与链间二硫键交联的异二聚体更稳定，但它对异二聚体的计算设计和二硫键配对操纵以进行异二聚体的合成和应用都是一个巨大的挑战。在这里，我们报告了通过将计算从头设计与定向二硫键配对策略相结合，具有相互正交性的链间二硫桥肽异二聚体的设计、合成和应用。这些异二聚体不仅可以用作生成功能分子的支架，还可以用作蛋白质标记和构建交联杂化物的化学工具或构建块。因此，这项研究为将这种尚未探索的二聚体结构空间用于许多生物应用打开了大门。
基因组编辑技术，机制和改善治疗性植物化学物质的产生：机会和前景
图1各种基因组编辑工具。（a）锌指核酸酶（ZFN）充当二聚体。每个单体由DNA结合结构域和核酸酶结构域组成。每个DNA结合结构域由3 - 6个锌指重复序列组成，识别9 - 18个核苷酸。核酸酶结构域由II型限制性核酸内切酶FOK1组成。（b）转录激活剂类似核酸酶（Talens）：这些是类似于ZFN的二聚体酶。每个亚基由DNA结合结构域（高度保守的33 - 34个氨基酸序列）和FOK1核酸酶结构域组成。（c）CRISPR/CAS9：CAS9核酸内切酶由SGRNA（单引导RNA：CRRNA和TRACRRNA）引导，用于靶特定裂解。二十个核苷酸识别位点存在于原始基序（PAM）的上游（来自Arora＆Narula，2017年）。版权所有©2017 Arora和Narula。这是根据Creative Commons归因许可（CC BY）的条款分发的开放访问文章。
致命的肌动蛋白崩溃，二硫酸
细胞在敌对或营养不足的环境中生存的主要挑战之一，例如肿瘤微环境，是由代谢失衡或快速增殖引起的活性氧（ROS）缓冲活性氧（ROS）。过多的ROS的细胞需要产生保护性分子，例如谷胱甘肽，以减轻破坏性作用。谷胱甘肽的产生需要半胱氨酸，通常通过SLC7A11胱氨酸 - 谷氨酸抗虫剂从细胞外环境中吸收氧化二聚体形式，胱氨酸。如果胱氨酸的摄取被阻断，细胞会经历铁毒性，这是由磷脂过氧化引起的铁依赖性死亡，尤其是多不饱和脂肪酸（PUFA），导致质膜膜中的广泛异常。铁凋亡通过白介素释放（IL-1和IL-18）激活免疫系统，并与炎症性疾病和伤害有关（1次审查1）。为了避免铁铁作用，许多癌症上调了SLC7A11，并进口大量胱氨酸以进行有效的谷胱甘肽生产。然而，这还需要准备好通过五磷酸五磷酸途径生产NADPH的葡萄糖，以便可以减少胱氨酸以降低用于谷胱甘肽生物合成（图1）。
噬菌体 - 含量可诱导的染色体岛武器竞赛设计了dutpases的抑制剂
摘要STL是金黄色葡萄球菌致病岛（SAPIS）的主要阻遏物，靶向噬菌体编码的蛋白质来进行过度加压，并同步SAPI和辅助噬菌体生命周期。为了激活其循环，一些SAPI STL靶向噬菌体二聚体和噬菌体三聚体dutpass（DUT）作为抗压迫剂，它们是结构上无关的蛋白质，这些蛋白质对噬菌体执行相同的功能。SAPI的阻遏物与噬菌体诱导剂之间的这种紧密联系对STL进行了进化优化，从而允许与无关生物体的DUT相互作用。在这项工作中，我们通过与原型Sapibov1 STL的结构与原型和真核生物三聚合物进行了结构来表征这种复杂的专业化机制。与结核分枝杆菌和智人的杂膜复合物显示了STL的分子策略，以靶向来自不同王国的三聚体。我们的结构结果证实了三聚体在STL结合中的五个催化基序的参与，包括通过拥抱STL来增加因素的C末端活跃基序V。在有机硅和体外分析中，单次DUT支持STL认识到第三个DUT家族的能力，并确认该蛋白在不同王国的生活中是一种普遍的DUT抑制剂。
分枝杆菌NDH-2的结构结合到2-Mercapto- ...
新西兰奥塔哥大学。4。澳大利亚昆士兰州技术大学生物医学科学学院。5。加拿大多伦多大学医学生物物理学系。摘要分枝杆菌II型NADH脱氢酶（NDH-2）是一个有前途的药物靶标，因为它在结核分枝杆菌和其他病原体中的能量代谢中具有核心作用，并且因为缺乏已知的哺乳动物同种同源物。然而，缺乏有关酶如何结合抑制剂的结构信息，使铅化合物具有挑战性。我们使用电子冷冻显微镜（Cryo-EM）来确定来自Smegmatis分枝杆菌的NDH-2的结构，Smegmatis是单独的结核分枝杆菌呼吸的快速增长的非疾病模型，无论是单独的还是与2- cercapto-quinazolinone抑制剂的复杂性。该结构表明，活性分枝杆菌NDH-2是二聚体的，其二聚化界面通过其他细菌属在NDH-2中未发现的延长的C末端A螺旋稳定。二聚体中单体的排列与其他原核NDH-2二聚体所描述的排列不同，而不是由NDH-2在真核生物中形成的二聚体。在甲氨酸酮结合部位中2-羟基硝基唑酮的密度密度表明，抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。 这些结果揭示了NDH-2的结构元素，可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。密度表明，抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。这些结果揭示了NDH-2的结构元素，可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。