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新西兰奥塔哥大学。4。澳大利亚昆士兰州技术大学生物医学科学学院。5。加拿大多伦多大学医学生物物理学系。摘要分枝杆菌II型NADH脱氢酶(NDH-2)是一个有前途的药物靶标,因为它在结核分枝杆菌和其他病原体中的能量代谢中具有核心作用,并且因为缺乏已知的哺乳动物同种同源物。然而,缺乏有关酶如何结合抑制剂的结构信息,使铅化合物具有挑战性。我们使用电子冷冻显微镜(Cryo-EM)来确定来自Smegmatis分枝杆菌的NDH-2的结构,Smegmatis是单独的结核分枝杆菌呼吸的快速增长的非疾病模型,无论是单独的还是与2- cercapto-quinazolinone抑制剂的复杂性。该结构表明,活性分枝杆菌NDH-2是二聚体的,其二聚化界面通过其他细菌属在NDH-2中未发现的延长的C末端A螺旋稳定。二聚体中单体的排列与其他原核NDH-2二聚体所描述的排列不同,而不是由NDH-2在真核生物中形成的二聚体。在甲氨酸酮结合部位中2-羟基硝基唑酮的密度密度表明,抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。 这些结果揭示了NDH-2的结构元素,可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。密度表明,抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。这些结果揭示了NDH-2的结构元素,可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。

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