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World File Search SystemFFPE
福尔马林固定石蜡嵌入心脏组织分析的方法
在FFPE过程中，通过交联蛋白保留了组织样品，然后将其嵌入石蜡蜡块中，从而可以轻松切割适合的切片，以安装在显微镜载玻片上进行检查。对于这个实验室，组织是普渡大学研究人员的FFPE。对于他们的方法，从鼠模型中获取了短轴心脏梗塞样品。切除后立即将组织浸入10％中性缓冲甲醛的溶液中。这种浸入过程发生24小时。在此过程中组织变硬。使用70％乙醇洗涤的组织脱水的组织。洗涤后，样品被嵌入石蜡中。重要的是要适当地脱水，并且鉴于要固定的24小时，否则将无法保留组织。然后通过邮件将这些样本发送到田纳西大学，在那里使用各种准备方法为MALDI-MSI的样本做准备[10,11]。
肿瘤的染色体微阵列分析
SNP微阵列分析是使用Affymetrix Oncoscan（TM）FFPE测定试剂盒进行的，其唯一目的是识别DNA拷贝数的收益和损失以及杂合性丧失的区域。该测定法利用了分子反转探针（MIP）技术，该技术已针对高度降级的FFPE样品（仅40个碱基对的探针询问位点）进行了优化。对于拷贝数，该测定法在选定的900个癌症基因中的分辨率为50-100 kb，在癌症基因之外的300 kb分辨率。镶嵌的检测阈值是可变的，具体取决于段的大小。CNV。收益和损失包括已知的临床意义癌症基因，或者在临床肿瘤学之外的3MB重要区域大于3MB，杂合性的丧失大于10MB。分析基于GRCH37组件。
肿瘤微环境： - 3D Genomics
单细胞多组学技术 • 空间转录组学（10X Visium，通常与 10X Genomics 单核 RNAseq 集成） • 具有大量和少量细胞的单细胞转录组学（分别为 10X Genomics 和 SmartSeq）。 • 来自新鲜冷冻和 FFPE 包埋组织的单核 RNAseq。 • IHC 成像（宽视野/共聚焦、显色/荧光） • 高内涵成像（细胞绘画、HCS） • 单细胞免疫组库分析、B 细胞/T 细胞克隆型研究，通过 FACS 和 MACS 分离细胞类型。 批量细胞技术 • 使用患者来源和对照细胞系在多个治疗领域进行基因表达和药物反应研究的 3D 类器官模型 • 具有多种模态读数的定制细胞检测开发和化合物研究。 • 毛细管印迹 (ProteinSimple) 用于空间转录组学的组织 • 脑、肾、肺、心脏等。 • FFPE 样本即将推出 参考文献
kingfisher-instruments-experience-brochure.pdf
特色仪器应用 9 癌症研究 9 无细胞核酸分离 9 用于癌症研究的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本 10 血液癌症研究 11 外泌体和细胞器分离 12 循环肿瘤细胞 (CTC) 分离 13
免疫检查点抑制剂结肠炎（ICIS结肠炎）
•IHC是护理标准•在福尔马林固定的，石蜡包裹的（FFPE）肿瘤组织•活检和/或被切除的手术样品•内部控制和外部控制•PCR•如果DMMR/MSI-H，则如果dmmr/msi-h•遗传•遗传：lynch综合征：lynch综合症：lynch cyndrome•s-s draff in n ngs ng/ng ng/ng/ng ng/ng ng/ng/ng。
基因组学
☐ 质粒纯化配件 菌落筛选柱再生 无内毒素质粒分离 快速质粒分离 标准高纯度质粒分离 酵母质粒分离 ☐ 基因组 DNA 纯化柱再生 来自生物膜的 DNA 来自血液的 DNA 来自 FFPE 的 DNA 来自真菌的 DNA 来自昆虫和无脊椎动物的 DNA 来自植物的 DNA 来自唾液和法医样本的 DNA 来自土壤、粪便和水的 DNA 来自组织和细胞的 DNA 来自酵母和细菌的 DNA ☐ RNA 纯化 真菌、酵母和细菌 miRNA/mRNA 分离 来自生物膜的 RNA 来自血液的 RNA 来自 FFPE 的 RNA 来自昆虫、无脊椎动物和植物的 RNA 来自土壤的 RNA 来自组织和细胞的 RNA RNA 稳定化 RNA 合成试剂 总 RNA 试剂 ☐ 高通量 DNA/RNA 纯化提取系统 滤板高通量试剂盒 ☐ DNA 和 RNA 存储
使用高清晰的空间分析
图1。使用visium HD对CRC和NAT样品进行分析。串行组织切片。选择了样品子集并用visium HD测定法（n = 3 CRC和n = 2 Nat）进行分析。切片。串行切片，并通过v2分析（n = 1 CRC和n = 2 Nat）进行测定。单细胞数据用于创建用于单元类型注释的参考数据集。原位数据用于验证visium HD数据和后续分析的发现。使用匹配数据集的数据进行了技术性能比较。
个性化癌症护理中的分子诊断
cfDNA，无细胞的DNA； CTC，循环的肿瘤细胞； ctDNA，循环肿瘤DNA；电动汽车，细胞外囊泡； FFPE，福尔马林固定，石蜡包裹； LOD，检测极限； TEP，受肿瘤教育的血小板； TME，肿瘤微环境。图像改编自Alba-Bernal A等人。ebiomedicine。2020; 62：103100。
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MiniGenomics ® DNA 分离试剂盒旨在从多种样本类型中快速提取和纯化高质量、即用型基因组 DNA，包括但不限于全血、FFPE 组织、粪便、唾液、口腔拭子、生殖道拭子、组织/培养细胞和外周血白膜。
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Minigenomics®DNA隔离试剂盒设计用于从多种样本类型中快速提取和纯化高质量的，现成的基因组DNA，包括但不限于全血，FFPE组织，粪便，粪便，唾液，乳房拭子，颊拭子，生殖器拭子，组织/培养的细胞和植物/培养的细胞和毛皮血液Budy。