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World File Search SystemGenotypic
8825医疗单
Sequencing Method: in-house Genotypic antiretroviral resistance testingof HIV using Sanger sequencing (V7270) Nucleic acid extraction: BioMérieux EasyMag automated platform, with NucliSENS extraction reagents (as per manufacturer's instructions) Amplification: Bio-RAD Dyad DNA engine thermal cycler Gel electrophoresis and PCR cleanup using ThermoFisher exoSap-it（V7255）扩增子的定量：热泡量QUBIT 2.0荧光计（V7064）为抗病毒抗性测试（V7256）核酸序列数据制备Sanger测序反应
遗传变异性，遗传力，遗传进步和水稻产量和产量成分之间的相关性（Oryza sativa L.）
这项研究是在2015年夏季在尼泊尔Dipayal的区域农业研究站进行的，以估算使用低地灌溉水稻的26个先进基因型的基因型和表型可变性，遗传力，遗传性，遗传进步和谷物产量和相关性状相关性。差异分析表明，天数与开花，成熟度，植物高度，圆锥花序长，千粒重量和谷物产量存在显着差异。估计开花的天数（0.88），成熟度（0.79），千粒重量（0.48）和植物高度（0.43）表明这些特征在高遗传控制下。观察到谷物产量（24.87％），谷物/圆锥花序数量（22.45％），圆锥花序数量/m 2（20.95％）和稻草产量（20.75％）的高表型变化（22.45％），而谷物产率的产量（12.02％）（12.02％）（12.02％）以及剩余的特征显示较低的基因型变量（<10％）。与基因型变异系数相比，估计的高表型变异系数显示出对性状表达的环境影响。谷物的产量（11.98）和开花天（10.32）显示出培养基，其余特征播下了低基因型前进，为平均值的百分比。高至低遗传力，具有中等至低基因型的进步，因为平均值的百分比表明这些特征受非添加剂基因的控制，因此直接选择无益。通过创建变异和选择，建议对这些基因型的产量潜力和产量特征的进一步提高。圆锥花序长度（r = 0.230），开花天（r = 0.247），有效的分ers（r = 0.488）和稻草产量（r = 0.846）表现出与谷物产量的显着正相关，表明如果选择有利于这些产率分量的选择，则可以提高产量。
病毒趋向性测试
HIV 向性检测 HIV 向性检测可通过表型或基因型方法进行。使用表型分析进行向性检测是一种基于细胞的分析，可功能性地确定向性，可使用增强灵敏度的 Trofile® 分析 (ESTA；Monogram Biosciences，南旧金山，加利福尼亚州)。这种表型分析使用假型病毒库，该病毒库使用源自患者血浆的包膜序列来感染经改造以表达 CCR5 或 CXCR4 HIV-2 辅助受体的细胞系。基因型向性检测基于对 HIV 糖蛋白 120 基因的第三变量 (V3) 环进行测序；这是因为 V3 环与 HIV 辅助受体相互作用，并且 V3 中的变体与 HIV 向性的可测量变化相关。使用生物信息学算法（例如 geno2pheno）从序列数据中得出向性分配。在美国，Quest Diagnostics（新泽西州麦迪逊）提供唯一可商用的基因型 HIV 辅助受体趋向性检测，该检测使用三重群体测序，如果仅检测到 CCR5 趋向性病毒，则反射性地进行超深度测序。Quest Diagnostics 还提供原病毒 DNA 趋向性测试（Trofile® DNA），该测试通过三重群体测序对已整合到受感染 T 淋巴细胞宿主基因组中的 HIV-1 DNA 的趋向性进行测序，而无需使用超深度测序。
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在流行病学和数据分析的抗菌素耐药性研究中，动物健康计划[参考。 [186/24] IRTA当前是
在流行病学和数据分析的抗菌素耐药性研究中，动物健康计划[参考。186/24] IRTA目前正在寻求一名积极进取和热情的博士后研究人员，以在动物健康计划中具有一个健康的观点，加入我们的研究团队。博士后研究人员将在EU-JAMRAI 2工作2“加入行动抗菌抗性和与医疗保健相关的感染”，旨在通过欧洲各地通过欧洲的联合行动和协调的行动来领导对AMR的斗争，促进跨学科的合作，从而促进国家，机构，机构和行业之间，以促进反杂货不动的人。The researcher will focus on setting up the basis for piloting studies in antimicrobial surveillance using phenotypic and genotypic tools, such as minimal inhibitory concentration, and next generation sequencing technologies (Illumina and Nanopore), together with the implementation of IPC measures including biosecurity in animal health to reduce the consumption of antimicrobials.我们邀请雄心勃勃的候选人的申请，具有相关的研究经验和热情，主要是在抗菌管理和AMR监视领域进行研究和创新活动。
HIV-2感染
2014年HIV诊断测试的2014年疾病控制与预防指南6建议使用HIV-1/HIV-1抗原/抗体组合免疫测定法进行初始测试，并使用HIV-1/HIV-1/HIV-1抗体分化免疫测定法进行后续测试。Geenius HIV 1/2补充测定法（Bio-Rad Laboratories）已获得美国食品和药物管理局（FDA）的批准，将HIV-1感染与HIV-2感染区分开。多螺旋体HIV-1/HIV-2快速测试不再可用。市售的HIV-1 RNA分析不能可靠地检测或量化HIV-2 RNA。7定量HIV-2 RNA测试可在华盛顿大学（UW）8和纽约州卫生部（NYSDOH）获得。9 HIV-2核酸扩增测试（总DNA/RNA）诊断测试可用于UW的临床护理。10然而，重要的是要注意，多达三分之一的未经处理的HIV-2患者的HIV-2 RNA水平将低于检测的限制（UW测试10份/ml，NYSDOH测试的7 IU/mL）；其中一些人将有临床进展和CD4计数下降。未经验证的HIV-2基因型或表型抗逆转录病毒（ARV）耐药性测定均由FDA批准用于临床使用。HIV-2基因型ARV耐药性测定可在UW上可供研究。
个人资料（Arindam Barman博士）名称
13。Barman Arindam，Nillo Yedi和Neha M. Sangma。（2023）。表型和基因型表征从传统发酵的甘蓝叶（Gundruk）中分离出来的主要乳酸细菌。in。R. V. S. Uppaluri和L. Rangan（编辑），印度东北州的生物多样性保护。新加坡施普林格自然新加坡PTE Ltd.。ISBN 978-981-99-0944-5，ISBN 978-981-99-0945-2（EBOOK），https://doi.org/10.1007/978-978-981-99-99-0945-2_8，p。 133-154。ISBN 978-981-99-0944-5，ISBN 978-981-99-0945-2（EBOOK），https://doi.org/10.1007/978-978-981-99-99-0945-2_8，p。 133-154。
PDF 1.27 M-环境，生物多样性和土壤安全
ighen引入了水稻基因型以及两个局部品种的2020年和2021年的两个局部品种，在Sakha农业研究站的实验农场，Sakha，Sakha，Kafr El-Sheikh，埃及，谷物产量和相关的农艺学特征。方差分析显示，在评估的所有生长参数中，水稻基因型之间存在非常显着的差异。大多数研究的水稻基因型的谷物产量高于支票品种，AFR0280，AFR278-2-2和AFR278-8分别在两个季节下平均产量为14.26、14.03和14.00（T/HA）。基因型方差大于环境方差。表型变异系数（PCV）接近基因型系数变异（GCV），这表明遗传因子对所研究特征表达的影响。对所有研究字符观察到的高宽义遗传力（> 85％），这表明这些特征是通过加性基因作用遗传的，并且可以通过直接选择来增强。谷物的产量与植物高度，叶（长度和宽度），叶片面积，圆锥花序长，初级分支，圆锥花序，每个圆锥花序的尖峰和每个圆锥花序填充的晶粒。根据簇分析获得的树状图将二十种水稻基因型根据产量及其成分性状分为四个簇。因此，建议这些字符可以用作在水稻育种程序中选择理想基因型的表型标记。
原始文章：
这项研究的目的是探索与异念珠菌（INH）和利福平（RIF）（RIF）抗性的频率和分布。在这项回顾性研究中，通过刺激性分型分析了173个MDR-TB菌株的基因型。KATG，INHA基因和INHA的启动子区域，其中遗传突变赋予INH抗性； RPOB基因测序遗传突变赋予RIF抗性。 还分析了不同基因型菌株之间抗性相关的核苷酸改变的百分比。 总共有90.8％（157/173）的MDR菌株属于北京基因型。 种群特征在不同基因型的菌株中没有显着差异。 总共有50.3％（87/173）的菌株在katg的密码子S315T处发生突变； 16.8％（29/173）的菌株在INHA启动子区域有突变；其中，INHA启动子区域的-15碱基（C→T）处有5.5％（15/173）的点突变。 总共有86.7％（150/173）的菌株在RPOB基因时具有突变；其中，RPOB的密码子S531L菌株有40％（69/173）的菌株。 在北京基因型MDR菌株中突变的频率没有明显高于非临界基因型。 北京基因型MDR-TB菌株正在北京扩散，并对该地区的结核病控制提出了重大挑战。 观察到了Katg Ser315THR，INHA启动子区域（-15C→T）和RPOB（S531L）突变的高患病率。KATG，INHA基因和INHA的启动子区域，其中遗传突变赋予INH抗性； RPOB基因测序遗传突变赋予RIF抗性。还分析了不同基因型菌株之间抗性相关的核苷酸改变的百分比。总共有90.8％（157/173）的MDR菌株属于北京基因型。种群特征在不同基因型的菌株中没有显着差异。总共有50.3％（87/173）的菌株在katg的密码子S315T处发生突变； 16.8％（29/173）的菌株在INHA启动子区域有突变；其中，INHA启动子区域的-15碱基（C→T）处有5.5％（15/173）的点突变。总共有86.7％（150/173）的菌株在RPOB基因时具有突变；其中，RPOB的密码子S531L菌株有40％（69/173）的菌株。在北京基因型MDR菌株中突变的频率没有明显高于非临界基因型。北京基因型MDR-TB菌株正在北京扩散，并对该地区的结核病控制提出了重大挑战。观察到了Katg Ser315THR，INHA启动子区域（-15C→T）和RPOB（S531L）突变的高患病率。基于基因突变的分子诊断是在中国北京快速检测MDR-TB的有用方法。