HIV 向性检测 HIV 向性检测可通过表型或基因型方法进行。使用表型分析进行向性检测是一种基于细胞的分析,可功能性地确定向性,可使用增强灵敏度的 Trofile® 分析 (ESTA;Monogram Biosciences,南旧金山,加利福尼亚州)。这种表型分析使用假型病毒库,该病毒库使用源自患者血浆的包膜序列来感染经改造以表达 CCR5 或 CXCR4 HIV-2 辅助受体的细胞系。基因型向性检测基于对 HIV 糖蛋白 120 基因的第三变量 (V3) 环进行测序;这是因为 V3 环与 HIV 辅助受体相互作用,并且 V3 中的变体与 HIV 向性的可测量变化相关。使用生物信息学算法(例如 geno2pheno)从序列数据中得出向性分配。在美国,Quest Diagnostics(新泽西州麦迪逊)提供唯一可商用的基因型 HIV 辅助受体趋向性检测,该检测使用三重群体测序,如果仅检测到 CCR5 趋向性病毒,则反射性地进行超深度测序。Quest Diagnostics 还提供原病毒 DNA 趋向性测试(Trofile® DNA),该测试通过三重群体测序对已整合到受感染 T 淋巴细胞宿主基因组中的 HIV-1 DNA 的趋向性进行测序,而无需使用超深度测序。