本文档描述了使用Illumina技术请求库排序时要遵循的过程。本指南中提供了准备工作,图书馆提交,运输要求以及任何其他信息的详细说明。要避免请求处理的任何延迟,必须仔细遵循本指南中提供的说明。请注意,库的处理延迟将根据项目的大小而有所不同。建议与客户管理办公室联系以获取有关处理时间的信息。本指南中提到的要求还适用于图书馆质量控制项目。绘制流动池上群集边界并进行基本调用的Illumina软件取决于末端的序列复杂性,尤其是在插入的任一端,尤其是第一个十二左右的碱基对。因此,必须正确识别在这些区域中表现出足够序列复杂性的任何类型的库,否则测序数据将不足以最佳。这包括但不限于:•扩增子•BD狂想曲单细胞库•减少了基因组表示方法,例如限制性与位点相关的DNA(RAD)标记库•具有较低核苷酸复杂性(如双硫酸盐)的库中的库。为了通过低复杂性库克服此问题,可以在车道的10-50%处将控制库(例如,由Illumina提供的控制PHIX174库)升入,具体取决于初始库的复杂性。将PHIX添加到车道中将导致感兴趣的库的读数较低。上述相同的核苷酸复杂性问题适用于多路复用库时的索引序列。为了获得最佳结果,在多路复用库时,每条车道应至少使用3个索引。将按原样提供测序结果。CES对与库的设计,质量或序列复杂性有关的问题负责。
美国西部的抽象季节性积雪(WUS)对于满足夏季水文需求,降低野火的强度和频率以及支持雪道经济体至关重要。虽然积雪(SD)的频率和严重程度(即,在持续的全球变暖下都会增加雪的雪带,但内部气候变异性的不确定性仅通过观察结果来量化。使用30人的大型集合,来自现状的全球气候模型,预测和地球系统研究(SPEAR)的无缝系统以及基于观测的数据集,我们发现WUS SD的变化已经很大。到2100年,Spear Project SDS在共享的社会经济途径5-8.5(SSP5-8.5)下的频率近9倍,而SSP2-4.5的频率则高出5倍,而1921- 2011年的平均平均水平则高出5倍。通过研究SD的两个主要驱动因素,温度和降水量的影响,我们发现平均WUS SD会变得更温暖和潮湿。为了评估这些变化如何影响未来的夏季水的可用性,我们跟踪了遍布Wus流域的冬季和春季雪带,发现区域之间“无诺夫”阈值的发作时间和整体内部的较大内部变异性的差异。我们将区域间可变性归因于区域平均冬季温度和区域内变异性的差异,这是不可减至的内部气候变异性,仅由温度变化很好地解释。尽管有强大的场景强迫,但内部气候变异性将继续驱动SD和NO -NOW条件的变化。
安迪·斯特林教授是萨塞克斯大学科学政策研究部的科学技术政策教授。他特别关注科学和社会中的权力、不确定性和多样性问题,曾担任英国、欧盟和联合国能源政策、有毒物质、转基因作物、科学建议、公众参与、科学建议和社会转型机构的成员。除了过去在绿色和平组织工作外,他还为皇家学会、纳菲尔德理事会和欧洲科学基金会提供咨询。作为英国社会科学院院士,他曾担任 ESRC 研究委员会成员和 2021 年英国“研究卓越框架”成员。他最近担任英国政府核创新计划官方评估的独立顾问。菲尔·约翰斯通博士是萨塞克斯大学科学政策研究部 (SPRU) 的高级研究员。他目前从事深度转型实验室项目,并担任萨塞克斯首席研究员,该项目与金融投资者合作,帮助开发可持续发展的变革性投资方法。多年来,菲尔研究过许多主题,包括能源转型、逐步淘汰政策、国家理论、战争和军事等冲击在社会技术变革中的作用,以及长期研究核政策,特别是与军民相互依存相关的核政策。他参与了许多政府调查,包括威尔士核政策、深层地质处置和欣克利角 C 核电站。2024 年 3 月 英国约克大学 封面照片:英国萨默塞特欣克利角 C 核反应堆的建设。
下一代测序(NGS)技术的进步已大大改变了进行生命科学和临床研究的速度。随着测序速度的提高和成本降低,生成数据的能力将超过从数据中提取生物学和临床见解的能力。应对管道开发和实施的挑战,扩展信息学工作流以及主要的安全数据管理需要灵活而全面的平台。Illumina Connected Analytics允许用户在保持数据隐私,安全性和合规性的同时构建,版本和部署灵活的分析管道。
血浆中的循环游离DNA(cfDNA)已被证明是癌症、心血管疾病和器官移植中重要的非侵入性可检测生物标志物。在癌症研究领域,对液体活检样本中的 cfDNA 进行测序可以提供关于肿瘤异质性的宝贵见解,实现生物标志物分析,并且在组织不易获得时可作为组织活检样本的补充或替代。由于血浆样本通常含有少量来自目标细胞的cfDNA,因此需要可靠且灵敏的检测方法来检测罕见的体细胞变异。固定基因组可用于确定变异。然而,它们对于研究新目标和检测感兴趣基因的变化的作用有限。
本文档描述了使用Illumina技术请求库排序时要遵循的过程。本指南中提供了准备工作,图书馆提交,运输要求以及任何其他信息的详细说明。要避免请求处理的任何延迟,必须仔细遵循本指南中提供的说明。请注意,库的处理延迟将根据项目的大小而有所不同。建议与客户管理办公室联系以获取有关处理时间的信息。本指南中提到的要求还适用于图书馆质量控制项目。绘制流动池上群集边界并进行基本调用的Illumina软件取决于末端的序列复杂性,尤其是在插入的任一端,尤其是第一个十二左右的碱基对。因此,必须正确识别在这些区域中表现出足够序列复杂性的任何类型的库,否则测序数据将不足以最佳。这包括但不限于:•扩增子•BD狂想曲单细胞库•减少了基因组表示方法,例如限制性与位点相关的DNA(RAD)标记库•具有较低核苷酸复杂性(如双硫酸盐)的库中的库。为了通过低复杂性库克服此问题,可以在车道的10-50%处将控制库(例如,由Illumina提供的控制PHIX174库)升入,具体取决于初始库的复杂性。将PHIX添加到车道中将导致感兴趣的库的读数较低。上述相同的核苷酸复杂性问题适用于多路复用库时的索引序列。为了获得最佳结果,在多路复用库时,每条车道应至少使用3个索引。将按原样提供测序结果。CES对与库的设计,质量或序列复杂性有关的问题负责。
GSPARX GSPARX Sdn Bhd 站在马来西亚太阳能行业的前列,利用创新技术和可持续实践为各种客户提供全面的太阳能解决方案。该公司在五年内获得了 340MWp 的屋顶太阳能光伏 (PV) 系统。除了安装之外,其投资模式也为其带来了竞争优势。GSPARX 董事总经理 Elmie Fairul Mahsuri 表示,该公司专门为商业、工业和住宅物业提供定制屋顶太阳能解决方案,了解当地法规并提供电力购买协议 (PPA) 等创新融资。Elmie 告诉《马来西亚储备银行》(TMR):“我们的投资承诺表明了对太阳能长期潜力的信心,与客户建立了超越单纯供应商-客户关系的伙伴关系。”他补充说,GSPARX 团队的专业知识源于其在 Tenaga Nasional Bhd (TNB) 的行业经验,这使他们对能源行业有了深刻的了解,并且凭借 GSPARX 来自 TNB 的可靠性和创新文化,他们提供的解决方案超出了行业标准。GSPARX 专注于电池储能系统 (BESS) 和压缩储能系统 (CESS) 的创新。他补充道:“我们的目标是通过将业务战略与可持续性相结合、提供可再生解决方案、投资屋顶太阳能以及推行与政府净零目标相一致的绿色政策,增加太阳能的采用率,并支持到 2050 年实现净零排放。”Elmie 表示,GSPARX 在 77MW AEON 连锁项目上取得的成功展示了其在太阳能领域的卓越和创新,这得益于技术专长、创新的项目管理、强大的行业合作伙伴关系以及以客户为中心的方法。他表示,该项目还证明了 GSPARX 提供价值和推进可再生能源解决方案的能力,并且该公司已成功在大学和教育机构投资了 40MW 峰值 (MWp) 的太阳能光伏系统。
Illumina* DNA无PCR PREP应用模板使库的生成与Illumina测序平台兼容。应用模板允许用户在单个批处理中生产4至24个库之间。用户可以利用基因组DNA(GDNA)作为起始材料。血液和唾液输入。此应用程序支持具有GDNA输入范围内的标准输入协议。在25-99 ng范围内的输入不受此标准输入应用程序的支持。用户可以选择指定起始材料的浓度以实现归一化以及洗涤后的珠干时间。80%乙醇洗涤量已从180 µL减少到100 µL。在协议末尾的自动池不支持。
来自Illumine基因分型微阵列的原始基因分型数据以图像格式(IDAT文件)上传到Genomestudio软件中。此软件通过基于荧光强度的相似性来确定样品的自动聚类来确定等位基因的身份。但是,由于异常强度模式,默认聚类算法可能无法识别有效的簇,也可以将错误的基因型分配给样品。可以通过手动审查和回忆SNP来解决数据的可靠性,信心和整体质量,从而使其成为非常关键的质量控制(QC)程序,然后再使用PLINK或遗传解释进一步QC。此过程可以按; - =几周,具体取决于项目的大小(SNP的数量)。GenomeStudio软件需要至少提供的VWW样品来准确地群集数据,并且如果样本超过= www,我们必须在批处理中进行,以便花费更多的时间。此外,更大的芯片也需要更多的时间,因此成本更高。
人群和连接分析中的附加模块通过启用更好的研究设计,可以加速从基因组发现到有意义的研究的路径。使用集成的同类浏览器,开箱即用的汇总统计数据和图表,并与下游分析工具集成在一起,可以使您可以在几分钟而不是几周内构建研究。