Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组:AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
目的:描述高级神经内分泌宫颈癌(NECC)标本中的基因改变状态,并探讨独特基因改变与生存的潜在关联。方法:对神经内分泌宫颈肿瘤注册中心中高级NECC女性的标本的基于肿瘤的分子测试的结果进行了综述和分析。肿瘤标本可以来自原发性或转移性部位,并在初始诊断,治疗或复发时获得。结果:109名高级NECC女性可获得分子测试结果。最常见的基因是PIK3CA(在18.5%的患者中突变),TP53(17.4%)和MYC(14.5%)。确定的其他可靶向变化是试剂盒(7.3%),KRAS(7.3%)和PTEN(7.3%)的变化。患有RB1改变的女性(6.4%)的总生存期中位(OS)为13个月,而没有RB1改变的肿瘤女性为26个月(P = 0.003)。评估的其他基因均未与OS相关。结论:尽管在大多数肿瘤标本中没有发现高级NECC患者的肿瘤标本,但这种疾病的大部分女性至少会有一种可靶向的改变。基于这些基因改变的治疗可以为患有复发性疾病的女性提供其他有针对性的疗法,这些疗法目前的治疗方法非常有限。 携带RB1改变的肿瘤患者的OS减少。可以为患有复发性疾病的女性提供其他有针对性的疗法,这些疗法目前的治疗方法非常有限。携带RB1改变的肿瘤患者的OS减少。携带RB1改变的肿瘤患者的OS减少。
摘要。髓母细胞瘤 (MB) 是最常见的儿童恶性后颅窝肿瘤。最近的遗传、表观遗传和转录组分析将 MB 分为三个亚组,即无翅型 (WNT)、Sonic Hedgehog (SHH) 和非 WNT/非 SHH(最初称为第 3 组和第 4 组),具有不同的患者特征和预后。WNT 是最不常见但预后最好的亚组,其特征是核 β-catenin 表达、Catenin beta-1 (CTNNB1) 突变和 6 号染色体单体性。SHH 肿瘤含有 GLI1、GLI2、SUFU 和 PTCH1 基因的突变和改变,这些基因组成性激活 SHH 通路。最初,TP53 基因改变和/或 MYC 扩增的存在被认为是最可靠的预后因素。然而,最近的分子分析将 SHH MB 细分为几种亚型,这些亚型具有不同的特征,例如年龄、TP53 突变、MYC 扩增、转移的存在、TERT 启动子改变、PTEN 丢失和其他染色体改变以及 SHH 通路相关基因突变。第三个非 WNT/非 SHH MB(组 3/4)亚组在遗传上高度异质性,并显示出几种分子模式,包括 MYC 和 OTX2 扩增、GFI1B 激活、KBTBD4 突变、GFI1 重排、PRDM6 增强子劫持、KDM6A 突变、LCA 组织学、10 号染色体丢失、17q 等染色体、SNCAIP 重复和 CDK6 扩增。然而,基于
摘要:蛋白酶体抑制剂是针对蛋白酶体的蛋白水解活性的部分,在某些血液学恶性肿瘤中表现出效率,在包括胶质细胞瘤(GBM)在内的其他类型的癌症中表现出效率。它们会干扰蛋白酶体调节的蛋白质水平,并导致GBM细胞的细胞周期抑制和凋亡。细胞周期抑制剂p21和p27的积累,以及生存的分子NFKB,Survivin和MGMT的水平降低,蛋白酶体抑制剂的细胞毒性是单独使用或与抗GBM细胞固定药物替莫泽尔疗法(TMZ)相结合时的蛋白酶体抑制剂的基础。在临床前研究中收集的证据证实了采用了两种最有前途的蛋白酶体抑制剂Bortezomib和Marizomib的临床试验的设计。最初评估了药物安全性剂量,最大耐受剂量以及与其他药物的相互作用,主要是在复发性GBM患者中。在2021年设计并完成了对接受Marizomib作为Stupp方案辅助的新诊断为GBM患者的III期研究,Stupp方案将患者作为平行控制臂进行了设计和完成。这项III阶段研究的数据表明,马里佐米不能改善GBM患者的PFS和OS;但是,对每个患者肿瘤的遗传和表观遗传背景的进一步分析可能会阐明单个患者对蛋白酶体抑制的敏感性。GBM细胞的突变和表观遗传组成,例如对TP53和PTEN的遗传改变或MGMT启动子甲基化水平实际上可能决定对蛋白酶体抑制的反应。
患有肺外低分化神经内分泌癌 (EP-PD-NEC) 的患者预后不良。对于局部疾病患者可以进行手术,但大多数患者在出现症状时已处于晚期。所采用的治疗策略与肺部高级别 NEC 类似,对于晚期疾病,一线治疗建议使用铂类/依托泊苷类方案。目前尚无标准的二线疗法。对其分子和免疫途径的研究可能为新型药物的研发铺平道路。NEC 的分子驱动因素在小细胞肺癌中最为常见,其表现为 TP53 和 RB1 的近乎普遍的基因组改变。EP-PD-NEC 的遗传学仍然知之甚少;已发现 TP53 、 KRAS 、 PIK3CA/PTEN 和 BRAF 突变,此外还报告了宫颈小细胞 NEC 中 BRCA 通路的改变以及膀胱 NEC 中精氨酰琥珀酸合成酶 1 表达的缺失。我们还将探索使用细胞系和患者来源的异种移植 (PDX) 来预测 NEC 对治疗的反应以及替代生物标志物的出现,例如循环肿瘤细胞和无细胞 DNA。尽管关于 EP-NEC 免疫微环境的已发表数据有限,但仍有许多临床试验在研究免疫靶向药物在该疾病类别中的使用,迄今为止的研究数据相互矛盾。本综述将总结这种研究不足的诊断的治疗方法和可用的分子和免疫数据,并可能激发未来探索性研究的方向。
近年来,基因治疗已成为视神经损伤 (ONI) 的重要治疗方法,并在动物模型中取得了长足进步。ONI 的特征是视网膜神经节细胞 (RGC) 和轴突的丧失,可引起瞳孔对光反射异常、视野缺损甚至视力丧失。由于眼睛具有很高的可及性和一定的免疫特权,因此是基因治疗的天然靶器官。因此,正在进行许多基因治疗试验,以治疗青光眼等眼部疾病。本综述旨在介绍 ONI 基因治疗的研究进展。具体来说,我们关注基因治疗在阻止神经退行性疾病进展和保护 RGC 和轴突方面的潜力。我们涵盖了基因治疗的基本信息,包括基因治疗的分类,特别关注基因组编辑治疗,然后介绍常见的编辑工具和载体工具,如成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR) -Cas9 和腺相关病毒 (AAV)。我们还总结了脑源性神经营养因子 (BDNF)、睫状神经营养因子 (CNTF)、磷酸酶张力蛋白同源物 (PTEN)、细胞因子信号转导抑制因子 3 (SOCS3)、组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 和其他重要分子在视神经保护中的作用的进展。然而,基因治疗仍面临许多挑战,例如错位和突变、AAV 的免疫原性、所需时间和经济成本,这意味着在考虑进行临床试验之前需要解决这些问题。
放射学技术仍然是乳腺癌早期检测的主要方法,对于从癌症中获得有利的结果至关重要。但是,需要更敏感的检测方法来补充放射学技术,以增强早期检测和治疗策略。使用我们最近建立的培养方法,该方法允许传播腔原性的正常和癌性乳房上皮细胞,流式细胞仪表征和基因组测序,我们表明可以在母乳中检测到癌细胞。细胞从乳腺癌中衍生而来的乳腺癌富含CD49F+/EPCAM-,CD44+/CD24-和CD271+癌症干细胞(CSC)。这些CSC在HDAC6的细胞质保留结构域,MORF4L1中的停止/增益插入以及SWI/SNF复合物分量Smarcc2中的缺失突变。csc对HDAC6抑制剂,BET溴ab剂抑制剂和EZH2抑制剂敏感,因为已知SWI/SNF复合成分的突变会增加对这些药物的敏感性。来自其他10名未知患有乳腺癌的女性的母乳的细胞中,其中两个含有富含CSC表型的细胞,并在NF1或KMT2D中携带突变,这些突变经常在乳腺癌中突变。具有NF1突变的母乳源性细胞在CDKN2C,PTEN和REL基因中还带有拷贝数变化。此处描述的方法可以使快速癌细胞表征,包括妊娠/产后乳腺癌的驾驶员突变检测和治疗性筛查。
1, SFEBq = serum-free floating culture of em- bryoid body-like aggregates with quick aggrega- tion, CGE = Caudal Ganglionic Eminence, SS = Subpallium Spheroids, SAG = Smoothened Agonist, CXCR4 = Chemokine Receptor type 4, CO = Cortical Organoids, ALI-Cos = Air-Liquid Interface culture to Cerebral Organoids, MPCs = Mesoderm Progenitor Cells, IBA1 = Ionized calcium-Binding Adapter molecule 1, WDR62 = WD Repeat domain 62, KIF2A = Kinesin Fam- ily Member 2A, CEP170 = Centrosomal Protein 170, NARS1 = asparaginyl-tRNA synthetase 1, RGC = Radial Glial Cells, CNV = Copy Num- ber Variation, PTEN = Phosphatase and Tensin homolog, ODC1 = Ornithine Decarboxylase 1, PKB = Protein Kinase B, ASDs = Autism Spec- trum Disorders, FOXG1 = Forkhead Box G1, CHD8 = Chromodomain Helicase DNA-bind- ing protein 8, DEGs = Differentially Expressed Genes, DISC1= Disrupted-in-Schizophrenia 1, GSK3 = Glycogen Synthase Kinase 3, RTT = Rett Syndrome, MeCP2 = Methyl-CpG-binding protein 2, ERK = Extracellular signal-Regulated Kinase, MAPK = Mitogen-Activated Protein Ki- nase, MDS = Miller-Dieker Syndrome, AD = Alzheimer's Disease, APP = Amyloid Precursor Protein, PSEN = Presenilin, APOE = Apoli- poprotein E, NFT = NeuroFibrillary Tangles, MMP = Metalloproteinase, PD = Parkinson's Disease , SNCA = Synuclein Alpha, LRRK2 = Leucine Rich Repeat Kinase 2, HD = Huntigton's Disease, GSCs = Cancer Stem Cells, GBOs = Glioblastoma Organoids, TBI = Traumatic Brain Injury, CCI = Controlled Cortical撞击,NSE =神经元特异性烯醇酶。
乳腺癌(BC)仍然是女性最常见的癌症。尽管癌症生物学和治疗方面的知识增加,但卑诗省是全球癌症死亡率的第五个原因[1]。开发卑诗省管理的精密医学是一个吸引人的概念;但是,主要的科学和后勤挑战阻碍了其在诊所中的实施。突变驱动因素的识别仍然是最大的挑战,因为除少数例外,例如雌激素受体(ER)或人表皮生长因子受体2(HER2),没有其他经过验证的BC肿瘤发生的致癌驱动因素。值得注意的是,磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)/哺乳动物雷帕霉素(MTOR)途径是涉及处理失败的重要信号通路。途径放松管制的主要原因是PIK3CA突变,AKT突变或Tensin同源物(PTEN)损失[2]。途径失调是内分泌抗性的已知机制,以及抗HER2靶向剂的耐药性[3-7]。PI3K/AKT/MTOR突变在BC激素受体阳性(HR+)BC中更为频繁[5]。因此,正在研究几种靶向药物,以恢复PI3K/AKT/MTOR途径活动。目前,只有两种靶向药物用于治疗MBC患者,包括HR+/HER2阴性(HER2-)疾病。第一个是基于Bolero 2试验结果的MTOR抑制剂Everolimus,是MTOR抑制剂,并与Exemestane批准[8,9]。第二个是Alpelisib,最近在耐内分泌的PI3K突变的HR+转移性(M)BC中批准了与Fulvestrant相结合[10]。
一项 III 期双盲随机对照试验 (CAPItello-291) 表明,对于局部晚期或转移性 HR 阳性、HER2 阴性乳腺癌成人患者,如果其在转移性环境中接受至少一种内分泌方案治疗后出现进展,或者在完成辅助治疗时或完成辅助治疗后 12 个月内复发,则与安慰剂加氟维司群治疗相比,capivasertib 加氟维司群治疗可使 6 个月和 12 个月的无进展生存期 (PFS) 延长。与安慰剂加氟维司群相比,Kaplan-Meier 估计的组间 6 个月和 12 个月 PFS 概率差异分别为 |||||(95% 置信区间 [CI],|||| 至 ||||)和 ||||| (95% CI,||| 至 ||||) 有利于 capivasertib 加氟维司群,临床专家认为这具有临床意义。虽然总生存期 (OS) 数据尚不成熟,但 pERC 认为改变人群中的结果很有希望。所有患者经过约 14 个月的中位随访后,两个治疗组的中位 OS 均未达到,Kaplan-Meier 估计的 18 个月和 24 个月生存概率的组间差异分别为 ||||| (95% CI,|||| 至 ||||) 和 |||| (95% CI,|||| 至 ||||),有利于 capivasertib 加氟维司群。尽管试验表明,与安慰剂加氟维司群相比,capivasertib 加氟维司群治疗可能会导致出现严重不良反应的患者比例增加,但 pERC 认为 capivasertib 的副作用虽然显著,但还是可以控制的,因为预计治疗将由有乳腺癌治疗经验的临床医生开具和监督。