工程细菌基因组或克隆为细菌人造染色体(BAC)的外源DNA取决于辅助质粒的使用,这些质粒的用法将所需的工具暂时输送到细菌中以进行修饰。完成了一项挑剔的作用后,需要固化辅助质粒。为了使这种有效的质粒通过条件扩增子维持或携带反选择标记。在这里,我们描述了可以通过化学诱导或抑制来维持或治愈的新条件质粒。我们的方法基于携带Ori6Kγ起源的质粒的依赖性,其复制起源于蛋白质的存在。基于ORI6Kγ的质粒是严格调控的条件构建体,但通常需要特殊的大肠杆菌菌株才能进行操作。为了避免这种情况,我们将π蛋白表达放在共表达的条件阻遏物的控制下。通过给药或去除化学物质来调节质粒的维护与迄今为止应用的任何其他条件扩增子完全兼容。在这里,我们描述了诱导位点特定重新组合的方法为例。但是,可以使用相同的策略来为基因组编辑方法(例如λred重组酶或CRISPR/CAS成分)的任何其他瞬时成分构建合适的辅助质粒。
过去十年,序列库中可商用 DNA 的数量呈爆炸式增长。在三大最大的 DNA 库:iGEM、Addgene 和 DNASU 中,此类质粒的数量从 12,000 个增加到 300,000 多个。生物设计中的一个挑战仍然是如何有效、正确和无缝地使用这些和其他基于库的序列。这项工作描述了一种质粒设计方法,其中质粒被指定为简单的 DNA 序列或特征列表。然后,所提出的软件通过 Gibson assembly ® 找到最具成本效益的合成和 PCR 制备的库片段组合来构建质粒。它在用户指定和公共 DNA 数据库中查找现有的 DNA 序列:iGEM、Addgene 和 DNASU。引入并针对 2005 年之后的所有 iGEM 复合部件和 2018 年提交的所有 Addgene 载体进行了此类软件应用程序的描述,结果发现与纯合成质粒设计方法相比,成本降低了 34%。所述软件将通过缩短设计时间、提高构建质量和降低成本来改进当前的质粒组装工作流程。
DNA:要产生mRNA,需要一个DNA模板。生物制药行业将质粒用于此目的。只有一小部分质粒DNA编码有关感兴趣的相关蛋白质,例如g。 SARS-COV-2的尖峰蛋白。大多数质粒用于将DNA塑造成所需的环形式。环形对于相关DNA序列的扩增至关重要。
1。收到PUC19质粒DNA后,立即将其存储在-20°C至-80°C下,以保持其稳定性。2。将DNA解冻在冰上或室温下,但要避免重复冻融周期,以防止对DNA损坏。3。使用前,将DNA轻轻涡流,以确保其完全重悬。4。使用前通过分光光度法和/或凝胶电泳来验证DNA的浓度和纯度。5。处理DNA时,请使用无菌技术和适当的生物安全预防措施,以避免污染或暴露于危险材料。6。将任何未使用的DNA存储在-20°C至-80°C以供将来使用。
在此方案中,我们描述了一种将质粒DNA转化为DNA微圆的新方法,该方法仅由转基因序列组成。这种方法利用了质粒的可伸缩性,同时使用标准分子生物学方法将体外转化率转化为微圆,从而规定了对特殊生产细菌菌株的需求。
使用我们的在线质粒平台,您可以设计质粒,与您的团队共享,并咨询我们的专家,他们可以从项目开始时帮助您确定您的需求。您将收到可满足您项目期望的现成的,量身定制的质粒。此外,将通过下一代测序作为质量控制措施来验证质粒的全长。
原核生物与侵入性移动遗传因素(MGE)之间的进化武器竞赛导致出现了无数的宿主防御系统,这些系统提供了免受入侵MGE的免疫力(1)。这些免疫机制包括限制性修饰(R-M),CRISPR-CAS,ARGONAUTE,CBASS,SHEDU,LAMASSU和WADJET系统(2-10)。防御系统通过限制水平基因转移(HGT)来消除入侵MGE和塑造微生物群落和生态系统的关键作用(11,12)。由于众多分子基因工程工具起源于原核基因组防御系统,因此了解原核生物免疫系统不仅对于揭开原核宿主相互作用的动力学至关重要,而且对于开发具有生物技术和药物中应用的分子工具的动力学。在重要的人类病原体弧菌霍乱中,两个DNA防御模块称为DDMABC和DDMDE合作以消除质粒,并被认为在第七大流行O1 El Tor(7pet)菌株的进化中起着关键作用(13)。ddmabc是一种类似拉马苏的防御系统,已证明质粒和噬菌体激活后会触发流产感染(7、13、14)。相比之下,DDMDE系统直接作用于小质粒,从而导致其降解(13)。结构建模表明DDME是一种核
业务活动目前涵盖塑料、EPS 树脂、化学品和食品、药品、医疗器械、电气和电子材料以及合成纤维等广泛市场。生命科学相关活动目前是 Kaneka 具有战略意义的重要领域之一。该公司一直是生命科学领域的先驱。