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过去十年，序列库中可商用 DNA 的数量呈爆炸式增长。在三大最大的 DNA 库：iGEM、Addgene 和 DNASU 中，此类质粒的数量从 12,000 个增加到 300,000 多个。生物设计中的一个挑战仍然是如何有效、正确和无缝地使用这些和其他基于库的序列。这项工作描述了一种质粒设计方法，其中质粒被指定为简单的 DNA 序列或特征列表。然后，所提出的软件通过 Gibson assembly ® 找到最具成本效益的合成和 PCR 制备的库片段组合来构建质粒。它在用户指定和公共 DNA 数据库中查找现有的 DNA 序列：iGEM、Addgene 和 DNASU。引入并针对 2005 年之后的所有 iGEM 复合部件和 2018 年提交的所有 Addgene 载体进行了此类软件应用程序的描述，结果发现与纯合成质粒设计方法相比，成本降低了 34%。所述软件将通过缩短设计时间、提高构建质量和降低成本来改进当前的质粒组装工作流程。
基于存储库的质粒设计
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