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FEP 2.04.02遗传性乳腺/卵巢癌综合征和其他高风险癌（BRCA1，BRCA2，PALB2）的生殖基因测试
2.04.126 - Germline Genetic Testing for Gene Variants Associated With Breast Cancer in Individuals at High Breast Cancer Risk (CHEK2, ATM, and BARD1) 2.04.128 - Genetic Testing for Fanconi Anemia 2.04.148 - Germline Genetic Testing for Pancreatic Cancer Susceptibility Genes (ATM, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, STK11, and TP53) 2.04.151 - Germline and Somatic Biomarker Testing (Including Liquid Biopsy) for Targeted Treatment and Immunotherapy in Breast Cancer 2.04.155 - Germline and Somatic Biomarker Testing (Including Liquid Biopsy) for Targeted Treatment and Immunotherapy in Prostate Cancer (BRCA1/2, Homologous Recombination Repair Gene Alterations, Microsatellite Instability/Mismatch Repair, Tumor Mutational Burden) 2.04.156 - Germline and Somatic Biomarker Testing (Including Liquid Biopsy) for Targeted Treatment and Immunotherapy in Ovarian Cancer (BRCA1, BRCA2, Homologous Recombination Deficiency, Tumor Mutational Burden, Microsatellite Instability/Mismatch Repair) 2.04.157 - Somatic Biomarker Testing for Immune Checkpoint抑制剂疗法（BRAF，MSI/MMR，PD -L1，TMB）2.04.93-使用下一代测序
神经肿瘤学
ATRX-在基因表达调节BRAF V600E中起关键作用 - 在高级神经胶质瘤中很少发现。在小儿种群TERT - 端粒酶逆转录酶中常见；突变时，允许无限的增殖激活；预后/存活率不佳所指出的EGFR - 表皮生长因子受体；在许多癌症中发现与预后不良有关的高EGFR表达 - 一种细胞中的蛋白质，当细胞准备分裂时会增加，而当过表达1p / 19q时，可能会预测预后不良 - 在寡头胶状胶质瘤中可见骨骼。与对化学疗法的更好反应和改善的生存IDH - 异位酸盐脱氢酶 - 阳性与低级肿瘤一致； Associated with a more favorable prognosis TP53 - plays a role in apoptosis and suppresses the cell cycle Involved in triggering the development and spread of glioblastoma MGMT - O6-methylguanine methyltransferase - involved in repairing DNA damage in cancer cells Tumor Mutational Burden TMB – refers to the total amount of cancer tissue in the body found in <3% of glioblastoma patients Microsatellite Instability – MSI-由MMR系统中的缺陷引起的，负责校正DNA复制过程中发生的不匹配。
P170019 SSED - accessdata.fda.gov
该检测采用单一 DNA 提取方法，从常规 FFPE 活检或手术切除标本中提取 50-1000 ng DNA，构建全基因组散弹枪文库，并基于杂交捕获 309 个癌症相关基因的所有编码外显子、1 个启动子区域、1 个非编码 RNA (ncRNA) 以及 34 个常见重排基因的选定内含子区域，其中 21 个还包括编码外显子（请参阅下表 2 和表 3，了解 F1CDx 中包含的基因完整列表）。因此，该检测总共可检测到 324 个基因的变异。使用 Illumina ® HiSeq 4000 平台，杂交捕获选定的文库可进行高均匀深度测序（目标中位覆盖率 > 500X，覆盖率 > 100X 时外显子覆盖率 > 99%）。序列数据使用定制的分析流程进行处理，该流程旨在检测所有类型的基因组变异，包括碱基替换、插入/缺失、拷贝数变异（扩增和纯合缺失）和选定的基因组重排（例如基因融合）。此外，还将报告基因组特征，包括微卫星不稳定性 (MSI)、肿瘤突变负担 (TMB) 和阳性同源重组缺陷 (HRD) 状态（tBRCA 阳性和/或 LOH 高）。
太阳镜躲在后面也可能预防眼睛黑色素
因为站点可以预测广泛的临床特征，并且可以从治疗方案中选择。皮肤中出现常见的皮肤黑色素瘤（〜90％的病例）。很少，黑素瘤（例如，胃肠道和生殖道的粘膜（约1 - 2％）出现在眼睛，眼睛（〜5％的情况）（约5％）中，在卵巢（脉络膜，iris和睫状体）中，或者在conjunctiva（conjunctiva conjunctiva scline scliends of conjunctiva and sclinies of sclinies of sclindions of sclinies of sclinies）图1）。特别关注的是，这些罕见的黑色素瘤亚型的治疗选择有限。许多流行病学和实验研究将非易纤维皮肤皮肤的常见黑色素瘤与暴露于紫外线辐射（UVR）及其基因组相结合，因此显示了直接UVR诱导的DNA损伤的证据，表现出高肿瘤突变负担（TMBS），c> t> t> t> t> t> t> t tistition 7（TMBS）的高度突变的底基7（TMBS）。2相比之下，稀有黑色素瘤通常具有较低的TMB，而C> T跃迁和SBS7的比例较低，但是具有大量的基因组结构变异（SV），具有特征性的染色体成分和损失。不同的黑色素瘤亚型也由不同的癌基因驱动。皮肤黑色素瘤通常由BRAF，NRA和NF1驱动，HTERT和TP53中有继发突变。粘膜黑色素瘤由BRAF和NRA驱动，但频率低于皮肤黑色素瘤，而Kit在该疾病中也是常见的驱动力。最后，紫veal黑色素瘤由GNAQ，GNA11和CYSLTR2驱动，BAP1，SF3B1和EIF1AX中具有次要突变。3 - 6
FEP 医疗政策手册
2.04.111 - 前列腺癌管理的基因表达谱和蛋白质生物标志物 2.04.115 - 用于选择靶向癌症疗法的综合基因组分析 2.04.151 - 用于乳腺癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（BRCA1、BRCA2、PIK3CA、Ki- 67、RET、BRAF、ESR1） 2.04.153 - 用于癌症管理的肿瘤信息循环肿瘤 DNA 检测 2.04.155 - 用于前列腺癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（BRCA1/2、同源重组修复基因变异、NTRK 基因融合） 2.04.156 - 用于卵巢癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测（包括液体活检） （BRCA1、BRCA2、同源重组缺陷、NTRK） 2.04.157 - 免疫检查点抑制剂治疗的体细胞生物标志物检测（BRAF、MSI/MMR、PD-L1、TMB） 2.04.33 - 用于前列腺癌诊断和癌症风险评估的基因和蛋白质生物标志物 2.04.45 - 非小细胞肺癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（EGFR、ALK、BRAF、ROS1、RET、MET、KRAS） 2.04.53 - 转移性结直肠癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（KRAS、NRAS、BRAF和HER2） 2.04.61 - 用于预测前列腺癌复发的基因表达谱检测和循环肿瘤DNA检测结肠癌 2.04.77 - 体细胞基因检测以选择患有黑色素瘤或神经胶质瘤的个体进行靶向治疗 (BRAF)
不可切除的肝细胞癌对免疫检查点抑制剂反应的生化预测因素
肝细胞癌 (HCC) 是全球最常见的肝癌，无法切除的患者总体生存率较低。在过去五年中，免疫检查点抑制剂 (ICI) 彻底改变了多种血液肿瘤和实体肿瘤的治疗方案，这些药物已在无法切除的 HCC 中得到积极探索。首先，I 期和 II 期临床研究报告了持久的反应和可容忍的安全性，这令人鼓舞，这促使在 III 期临床研究中对 ICI 作为单一药物进行评估；然而，后者提供了有争议的结果，ICI 单一疗法的活性似乎仅限于一小部分患者。相反，IMbrave150 试验最近表明，在之前未接受过治疗的无法切除的 HCC 患者中，与索拉非尼单一疗法相比，使用阿替利珠单抗加贝伐单抗治疗可显著延长总体生存期和无进展生存期。此外，其他几种 ICI 的活性正在研究中，如联合免疫疗法以及免疫疗法与抗血管生成药物的联合疗法。尽管如此，目前尚无经过验证的预测性生物标志物能够指导这种情况下治疗选择，而识别 ICI 反应的具体预测因子是一项重大挑战。在这篇评论中，我们旨在对不可切除性 HCC 患者 ICI 反应的生化预测因子的最新证据进行批判性概述，尤其关注 PD-L1、TMB、MSI 和其他新兴生物标志物。
FEP 医疗政策手册
2.04.02 - 遗传性乳腺癌/卵巢癌综合征和其他高危癌症的种系基因检测（BRCA1、BRCA2、PALB2） 2.04.08 - 林奇综合征和其他遗传性结肠癌综合征的基因检测 2.04.101 - 李-法美尼综合征的基因检测 2.04.111 - 前列腺癌管理的基因表达分析和蛋白质生物标志物 2.04.115 - 用于选择靶向癌症疗法的综合基因组分析 2.04.141 - 用于癌症管理的循环肿瘤DNA和循环肿瘤细胞（液体活检） 2.04.151 - 乳腺癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（BRCA1、BRCA2、PIK3CA、Ki- 67、RET、 2.04.157 - 免疫检查点抑制剂治疗的体细胞生物标志物检测（BRAF、MSI/MMR、PD-L1、TMB） 2.04.33 - 用于前列腺癌诊断和癌症风险评估的基因和蛋白质生物标志物 2.04.45 - 非小细胞肺癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（EGFR、ALK、BRAF、ROS1、RET、MET、KRAS） 2.04.53 - 转移性结直肠癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测（包括液体活检）（KRAS、NRAS、BRAF 和 HER2） 2.04.77 - 体细胞基因检测以选择黑色素瘤或神经胶质瘤患者进行靶向治疗（BRAF） 2.04.88 - PTEN 基因检测错构瘤综合征 2.04.93 - 使用下一代测序的遗传癌症易感性面板 5.01.122- Vitgrakvi (Iarotrectinib) 5.21.134- Rozlytrek (entrectiinib)
乳腺癌抗肿瘤免疫和免疫治疗反应的表观遗传调节：生物学机制和临床意义
乳腺癌 (BC) 是最常见的非皮肤癌，也是美国女性癌症死亡的第二大原因。乳腺癌的发生和发展可以通过遗传和表观遗传变化的积累来进行，这些变化使转化细胞能够逃脱正常的细胞周期检查点控制。与核苷酸突变不同，DNA 甲基化、组蛋白翻译后修饰 (PTM)、核小体重塑和非编码 RNA 等表观遗传变化通常是可逆的，因此可能对药物干预有反应。表观遗传失调是抗肿瘤免疫力受损、免疫监视逃避和免疫疗法耐药的关键机制。与黑色素瘤或肺癌等高度免疫原性的肿瘤类型相比，乳腺癌被视为免疫静止肿瘤，其肿瘤浸润淋巴细胞 (TIL) 数量相对较少、肿瘤突变负荷 (TMB) 较低，对免疫检查点抑制剂 (ICI) 的反应率适中。新兴证据表明，针对异常表观遗传修饰因子的药物可能通过几种相互关联的机制增强 BC 中的宿主抗肿瘤免疫力，例如增强肿瘤抗原呈递、激活细胞毒性 T 细胞、抑制免疫抑制细胞、增强对 ICI 的反应以及诱导免疫原性细胞死亡 (ICD)。这些发现为使用表观遗传药物与免疫疗法的组合方法作为改善 BC 患者预后的创新范例奠定了非常有希望的基础。在这篇综述中，我们总结了目前对表观遗传修饰因子如何发挥作用的理解
经济政策不确定性在可再生能源增长Nexus中的作用：Rossi-Wang因果关系测试的证据
睾丸癌的原发性肺核蛋白是一种罕见且高度攻击性的恶性肿瘤。它占原发性胸部肿瘤的约0.22％，鲜为人知，因此通常被误诊为肺鳞状细胞癌。尚未形成有效的治疗方法，预后非常差。本综述旨在总结睾丸癌原代肺核蛋白的病因，发病机理，诊断，治疗和预后，以便更好地识别它并讨论克服它的当前和创新策略。随着癌症免疫疗法和肿瘤微环境的重要性，该综述还讨论了免疫疗法和靶向肿瘤微环境是否可以改善睾丸癌原发性肺核蛋白的预后以及可能的治疗策略。 我们审查并总结了所有接受免疫疗法的原发性肺核蛋白患者的临床病理特征，这些患者接受了免疫疗法，包括初始误诊，疾病阶段，免疫组织化学标志物与肿瘤新生血管化有关 与此同时，我们总结了并分析了用PD-1（程序性细胞死亡蛋白1）/PD-L1抑制剂和可能受到免疫疗法受益的潜在群体的睾丸癌的原代肺核蛋白患者的原发性肺核蛋白蛋白患者的总生存（OS）。随着癌症免疫疗法和肿瘤微环境的重要性，该综述还讨论了免疫疗法和靶向肿瘤微环境是否可以改善睾丸癌原发性肺核蛋白的预后以及可能的治疗策略。我们审查并总结了所有接受免疫疗法的原发性肺核蛋白患者的临床病理特征，这些患者接受了免疫疗法，包括初始误诊，疾病阶段，免疫组织化学标志物与肿瘤新生血管化有关与此同时，我们总结了并分析了用PD-1（程序性细胞死亡蛋白1）/PD-L1抑制剂和可能受到免疫疗法受益的潜在群体的睾丸癌的原代肺核蛋白患者的原发性肺核蛋白蛋白患者的总生存（OS）。据我们所知，这是关于探索睾丸癌原发性肺核蛋白的肿瘤微环境和免疫疗法有效性的第一个综述。据我们所知，这是关于探索睾丸癌原发性肺核蛋白的肿瘤微环境和免疫疗法有效性的第一个综述。
Wnt/β-catenin途径中的基因组改变以及结直肠癌细胞对靶向靶向疗法的抗性
AIM：结直肠癌是最普遍的胃肠道恶性肿瘤，在转移性环境中治疗选择有限。Wnt/β-catenin/腺瘤性息肉大肠杆菌（APC）途径通常在疾病中失调，并为治疗性开发提供了合理的靶标。方法：使用癌症基因组图集（TCGA）的结直肠癌队列（TCGA）的公开基因组数据定义了与Wnt/β-catenin/apc途径的APC或其他关键基因改变的结直肠癌的组，并确定每个组感兴趣的基因组特征。针对途径的药物的体外敏感性数据是根据癌症（GDSC）项目中药物敏感性的基因组编辑的。结果：三分之三的结直肠癌具有APC改变，其中大约四分之一的情况也具有Wnt/β-catenin/apc途径的其他基因，包括RNF43，CTNNNB1和TCF7L2。结直肠癌在Wnt/β-catenin途径，RNF43，CTNNB1和TCF7L2的三个基因中有一个或多个发生变化。在三个基因中具有相同变化的癌症具有或没有APC改变的癌症表现出受体酪氨酸激酶，PI3K/AKT途径基因和DNA损伤响应基因的高频率突变。在Wnt/β-catenin/apc途径中没有突变的细胞系在体外表现出对途径抑制剂的数值敏感性。结论：Wnt/β-catenin/apc途径改变的结直肠癌群体具有不同的基因组景观，这些景观可能对途径抑制剂的合理发展具有治疗意义。