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特刊 - 癌症
靶向嵌合体（Protacs）是创新和令人兴奋的技术，在学术研究和制药行业中都迅速获得了吸引力。与旨在抑制或阻止有问题蛋白质活性的传统疗法不同，Protac通过降解蛋白质本身而起作用。这种独特的机制开辟了新的治疗可能性，尤其是对于以前无法使用常规抑制剂有效靶向的“不良”蛋白。，尽管他们承诺，但在Protacs可以完全过渡到临床使用之前，仍然存在一些挑战。对于本期特刊，我们邀请提交原始研究和审查文章，以探讨Protacs的最新进展。感兴趣的主题包括开发新的protac，它们在克服耐药性中的作用以及它们在各种疾病环境中的应用。我们也对专注于药物输送系统的研究特别感兴趣。提交的提交，强烈鼓励了癌症治疗和其他疾病的潜力。
通过第二种方式丰富蛋白水解靶向嵌合体：两种方式优于一种方式
摘要：蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 介导的蛋白质降解促使人们重新思考，并且正处于推动药物发现转变的关键阶段。为了充分利用这项技术的潜力，一种日益增长的模式是使用其他治疗方式丰富 PROTAC。研究人员能否成功地结合两种方式来产生具有扩展特性的多功能 PROTAC？在本期观点中，我们试图回答这个问题。我们讨论了这种可能性如何包含不同的方法，从而产生多靶点 PROTAC、光可控 PROTAC、PROTAC 结合物以及基于大环和寡核苷酸的 PROTAC。这种可能性有望进一步提高 PROTAC 的功效和选择性，最大限度地减少副作用，并击中无法用药的靶点。虽然 PROTAC 已经进入临床研究阶段，但仍必须采取额外步骤来实现多功能 PROTAC 的转化开发。需要更深入、更详细地了解最关键的挑战，以充分利用这些机会并决定性地丰富 PROTAC 工具箱。■ 简介
抗菌药物研发中新兴蛋白水解靶向策略的展望
摘要：靶向蛋白质降解是药物发现领域的一个新方面。传统上，开发抗生素包括繁琐而昂贵的过程，例如药物筛选、先导化合物优化和配方设计。蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 是新一代药物，它利用蛋白水解机制选择性地降解和消除与人类疾病有关的蛋白质。PROTAC 在癌症领域的应用得到了广泛的探索，各种 PROTAC 正在临床试验中。因此，研究人员对将 PROTAC 技术作为对抗致病病毒和细菌的新武器有着浓厚的兴趣。本综述强调了抗菌 PROTAC 和其他类似的“类 PROTAC”技术在降解致病靶蛋白（即病毒/细菌蛋白）方面的重要性。这些技术可以对致病蛋白进行特异性蛋白质降解，以避免因致病蛋白突变或异常表达而导致的耐药性。基于 PROTAC 的抗菌疗法具有高特异性和降解“不可用药”蛋白质（例如非酶蛋白质和结构蛋白质）的能力。
KRASG12C 抑制剂的耐药机制
摘要：KRAS 是人类最常见的致癌基因之一，但生产直接抑制剂的协同努力大多以失败告终，使 KRAS 获得了“无药可用”的称号。最近生产亚型特异性抑制剂的努力取得了更大的成功，几种 KRAS G12C 抑制剂已进入临床试验，包括 adagrasib 和 sotorasib，它们已显示出对患者有效的早期证据。从其他 RAS 通路抑制剂的经验教训表明，这些药物在体内的效果将因耐药性的产生而受到限制，G12C 抑制剂的临床前研究已发现这方面的证据。在这篇综述中，我们讨论了 G12C 抑制剂的当前证据、对 G12C 抑制剂的耐药机制以及克服它们的潜在方法。我们讨论了联合治疗的可能靶点，包括 SHP2、受体酪氨酸激酶、下游效应物和 PD1/PDL1，并回顾了正在进行的针对这些抑制剂的临床试验。
晚期非小细胞肺癌对 KRAS 抑制的耐药性
肺癌仍然是全球癌症死亡的主要原因。超过 50% 的新病例是在晚期或转移期被诊断出来的，因此导致这些患者的生存率很低。近三分之一的肺腺癌发生 KRAS（Kirsten 大鼠肉瘤病毒）基因突变，几十年来一直被认为是“无药可治”的靶点。然而，近年来，越来越多的小分子（如 GTPase 抑制剂）已在携带 KRAS 突变的肺癌患者的临床试验中进行研究，并取得了有希望的结果和更好的疗效。目前，只有两种获批的靶向疗法（adagrasib 和 sotorasib）用于二线治疗晚期或转移性 KRAS 突变 NSCLC。在这篇叙述性综述中，我们将重点介绍 KRAS、其分子基础、其共突变的作用、其抑制的临床证据、推定的耐药突变以及克服对 KRAS 抑制的耐药性的未来策略。
物理化学研讨会
“发现癌症免疫疗法的第一类SHP1共价抑制剂。”癌症免疫疗法是指利用患者免疫系统针对肿瘤的方法，该方法已获得了以免疫检查点阻断和收养细胞疗法为名的巨大进展。然而，当代策略的反应有限，不良副作用以及由于大分子的利用而导致的组织渗透率低，呼吁采取更有效，更安全的替代策略。SHP1是一种主要在造血细胞中表达的蛋白质酪氨酸磷酸酶（PTP），已被证明可对T细胞和天然杀伤（NK）细胞中的免疫反应负调节，这些细胞中的SHP1缺失已证明可以促进其抗肿瘤功能。最近的研究还表明，可诱导的SHP1基因敲除通过免疫激活抑制了体内肿瘤的生长。尽管作为一个有吸引力的靶标表示，但由于其不良性质，尚未报告SHP1的高质量小分子抑制剂。通过高通量筛查和广泛的药物化学，我们获得了第一类SHP1共价抑制剂M029，该抑制剂M029对SHP2的选择性> 25倍，其最接近的类似物，对其他PTPS和其他PTPS的选择性> 60倍。进一步的蛋白质组学研究表明，M029在纤维素中对SHP1具有优势。此外，M029在100倍过度的谷胱甘肽中稳定，半衰期为35小时，对健康细胞的无毒性高达100 µm，其口服生物利用度的高度也反映在其口服生物利用度中，而F％的f％的10％。M029处理在T细胞中显着激活T细胞受体信号，而NK细胞在体外杀死效果。此外，M029的口服剂量通过增强的T细胞和NK细胞浸润，激活以及T细胞耗尽的延长，显着延迟了具有MC38肿瘤的小鼠的肿瘤进展。总体而言，我们开发了第一个SHP1共价抑制剂，具有很高的选择性和强大的抗肿瘤功效。这项研究是药理学SHP1作为癌症免疫疗法的首次表征，并巩固了其作为免疫治疗靶标的潜力。M029的发展还将启发针对SHP1或其他不良PTP的药物发现策略。
2022; 12(3): 1321-1332. doi: 10.7150/thno.67889 综述 利用巨胞饮作用将药物输送到 KRAS 突变癌症中
KRAS 突变是与癌症相关的最常见基因突变之一，约占所有肿瘤的 25%，尤其是胰腺癌、肺癌和结直肠癌。突变型 KRAS 长期以来被认为是一种无法用药的靶点，多年来阻碍了直接针对 KRAS 的进展，而利用 KRAS 突变细胞转变的代谢行为将药物靶向递送到细胞中可能提供另一种机会。巨胞饮作用是一种非选择性液相内吞途径，研究发现巨胞饮作用是 KRAS 驱动肿瘤的一种代谢特征，在从细胞外液中获取营养物质方面发挥着关键作用。通过巨胞饮作用，KRAS 突变癌细胞可以吸收各种药物递送系统，利用巨胞饮作用将治疗剂递送到 KRAS 突变肿瘤细胞内正在成为一种新的药物递送方法。在本文中，我们总结了研究 KRAS 突变诱导的巨胞饮作用的癌症生物学研究，回顾了利用巨胞饮作用增强进行 KRAS 突变癌细胞选择性药物输送的最新研究，并讨论了该策略的潜在机会、挑战和陷阱。
烟花：一种自下而上的综合相结合网络分析
遗传性相位性分析是一种计算方法，它确定基因对大规模筛选数据集的细胞效果产生共同影响，已成为一种强大的工具，可以识别人类基因之间的功能关系。但是，对研究单个基因和途径的相辅相成的广泛实施受到现有相关性方法的系统偏见的限制，而没有计算专业知识的投资障碍。我们创建了烟火，这是一种方法和交互式工具，用于构建和统计分析，以围绕用户提供的基因为中心。烟花结合了一种新颖的偏见方法，以减少虚假发现，从而限制对细胞系的自定义子集的限制，并整合多素和药物 - 基因相互作用数据集，以实现和靶向上下文基因的本质。我们通过调查基因功能和专业化，间接的“不良”蛋白质靶向“不良”蛋白质以及遗传网络的上下文重新布线的情况下，揭示了烟花的广泛效用。
特刊 - EEG信号处理：新方法
摘要：尽管生物制剂量的应用数量增加，但共价抑制剂的发展仍然是药物发现中增长的领域。The successful approval of some covalent protein kinase inhibitors, such as ibrutinib (BTK covalent inhibitor) and dacomitinib (EGFR covalent inhibitor), and the very recent discovery of covalent inhibitors for viral proteases, such as boceprevir, narlaprevir, and nirmatrelvir, represent a new milestone in共价药物开发。通常，靶向蛋白质的共价键可以在目标选择性，耐药性和给药浓度方面提供不同优势。共价抑制剂的最重要因素是电力（弹头），它决定了选择性，反应性和蛋白质结合的类型（即可逆或不可逆），可以通过合理设计进行修改/优化。此外，共价抑制剂在蛋白水解中越来越普遍，靶向嵌合体（Protac）用于降解蛋白质，包括当前被认为是“不可能”的蛋白质。本综述的目的是强调共价抑制剂开发的现状，包括简短的历史概述以及Protac Technologies的应用以及SARS-COV-2病毒的某些示例。
CodeBreak 200：研究局限性和未来方向
近年来，肺癌研究的突破性进展为直接针对 KRAS 突变的创新治疗铺平了道路。长期以来，KRAS 突变一直被认为无法用药，因为它们对底物 [鸟苷三磷酸 (GTP)] 的亲和力高，达到皮摩尔水平，且缺乏已知的调节结合位点。非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的 KRAS 突变最常发生在外显子 2 和 3 的热点中，特别是在密码子 12、13 和 61 处，不同突变体的生化特性各不相同 (1)。值得注意的是，KRAS p.G12C 突变的特征是第 12 个密码子上的甘氨酸 (G) 被半胱氨酸 (C) 取代，约占非小细胞肺癌中发现的 KRAS 突变的 40%，或西半球非小细胞肺癌中已知致癌驱动因素的 13-16%，与其他 KRAS 突变相比，其内在 GTP 水解水平接近正常水平，因此能够在鸟苷二磷酸 (GDP) 结合（失活）和 GTP 结合（活性）状态之间循环。除了结构分析方面的进步外，这种基因型特异性的生化特征为产生突变选择性共价抑制剂奠定了基础，这种抑制剂可以不可逆地与 GDP 结合（失活）形式的 KRAS G12C (2) 结合。