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熔融电颤技术使半月板结构中的胶原蛋白排列整齐
披露：作者对于本研究没有任何需要披露的信息。简介：半月板对于膝关节的负荷分布、减震和稳定性至关重要。半月板损伤会导致疼痛、活动受限和易患骨关节炎。虽然传统治疗方法不能恢复半月板功能，但生物制造有望生成具有仿生血管化和非血管化区域的半月板结构 1 。然而，这种模拟通常是通过软水凝胶或厚的应力屏蔽纤维实现的。熔融电写 (MEW) 通常用于为具有 µ m 级纤维的水凝胶提供长期机械稳定性 2 。熔融电纤颤 (MF) 使用类似原理，但通过使用牺牲材料，可以实现纳米级纤维 3 。本研究旨在通过融合 MEW 和 MF 来制造区域性半月板结构。 MEW 提供直接的机械稳定性，而 MF 引导胶原蛋白排列以刺激结构 ECM 元素的沉积，从而实现长期的机械稳定性。方法：使用 MEW（聚己内酯 (PCL)）和 MF（PCL/PVAc，比例 = 20:1（MEW:MF））打印菱形（15、30、60 °）和盒子状结构（300 x 300 µm）。通过乙醇/PBS 洗涤溶解 PVAc，并在支架上接种人源半月板祖细胞（hMPC，密度 = 5*10 6 细胞/毫升）。进行压缩和拉伸测试（动态机械分析仪，TA Q800）。用免疫荧光可视化细胞（Dapi、肌动蛋白）和 I 型胶原蛋白引导。为了将脉管系统纳入外部区域，将血管和血管周围细胞（HUVEC：2.5*10 6 细胞/ml 和 MSC：5*10 6 细胞/ml）接种到支架的外部区域。）通过免疫荧光（CD-31 和 a-SMA）研究血管网络的形成。结果部分：MF 纤维引导 MPC（肌动蛋白 +）和 I 型胶原蛋白沉积，而 MPC 聚集在 MEW 微纤维上，I 型胶原蛋白主要沉积在这些聚集体周围（图 1A）。此外，与 MEW PCL 支架或非增强凝胶相比，MF-MEW 的汇聚为半月板结构提供了更高的压缩 E 模量，尤其是随着时间的推移（图 1B）。评估血管分区显示所有结构的总血管长度保持不变，并且与非增强凝胶相比更大（图 1C）。讨论：本研究强调了 MEW 和 MF 融合以引导细胞和 ECM 引导的潜力。MEW/MF 胶原引导可能归因于随着时间的推移更好的基质弹性。此外，本研究展示了生物打印机械能力和半月板构造的第一步，其中包括仿生血管和无血管区。意义/临床意义：这些发现与生成高度多孔但机械稳定的半月板植入物有关，这些植入物可实现胶原对齐，从而实现潜在的长期稳定机械性能。此外，这些结构可用于包括半月板血管和非血管成分的体外研究，以进一步获得半月板再生的基础知识，最终改善患者护理。参考文献：
FCEB 运营网络安全协调（重点）计划
联邦民事行政部门 (FCEB) 由各机构组成，这些机构肩负着独特的使命。它们都独立建立了网络和系统架构，以推进为美国人民服务的重要工作。这种独立性产生了多种结果，为制定 FCEB 运营网络安全协调 (FOCAL) 计划提供了背景。各机构在管理网络风险方面的效率差异很大，这意味着所有 FCEB 机构之间没有统一或一致的基础安全态势。这些不同的方法并非旨在共同应对我们当前网络威胁环境的动态性质、我们数字生态系统的复杂性以及技术现代化的速度。因此，尽管做出了一致努力来适应和防范网络攻击，但 FCEB 仍然很脆弱。
一种用于机载分布式 POS 的传递对准方法...
摘要 机载分布式定位定向系统（POS）可以满足多点运动参数测量的需求。它依赖于从高精度主系统到从系统的传递对准来获得所有点的高精度运动参数。分布式POS的一个关键问题是确定适当处理飞行器挠曲的方法，实现高精度传递对准。本文首先分析了飞行器挠曲对机载对地观测传递对准精度的影响。在此基础上，建立了考虑三维挠曲角的传递对准误差模型，并提出了一种基于参数识别无味Rauch-Tung-Striebel平滑器（PIURTSS）的传递对准。仿真结果表明，基于PIURTSS的传递对准方法有效提高了估计精度。
多个序列对准工具的性能分析
多个序列比对（MSA）是对齐两个或多个序列的过程，目的是在序列或生物之间找到关系。由于未知的原因，序列可以通过插入，缺失或重排的方式具有突变。用于比对的序列可能是DNA，RNA或基因。今天，MSA是一个重要的程序，用作分子生物学，计算生物学和生物信息学的构成步骤。这些领域的结果是系统发育的结构，蛋白质二级和三级结构分析以及蛋白质功能预测分析。本文对当今可用的不同多个序列一致性工具提供了全面的比较分析。本文将首先关注不同类型的序列对准，然后再进行多个序列对齐，然后讨论算法及其技术的最新发展。后面的部分将提供比较分析中使用的一些基准和数据参数。随后的部分将讨论各种算法性能的性能和原因，后来在哪个方向上结论多个序列对齐方式可能会进行，我们认为对生物学家的理想结果是未来的理想结果。
评估伪细菌中基因表达的载体及其在Aplysina Marine Sponge研究中的应用多蛋白质结构与flodmason
蛋白质结构是超出序列的保守，这使得多重结构比对（MSTA）对于分析远距离相关的蛋白质必不可少。计算预测方法已大大扩展了我们可用蛋白质结构的存储库，需要快速准确的MSTA方法。在这里，我们介绍了一种渐进式MSTA方法，该方法利用了成对结构对准器Foldseek的结构字母，用于多次对齐数十万个蛋白质结构。foldmason计算置信度得分，提供交互式可视化，并在准确的结构预测时代提供了大规模蛋白质结构分析的必要速度和准确性。使用flaviviridae糖蛋白，我们证明了Foldmason的MSTAS如何支持暮光区下方的系统发育分析。foldmason是免费的开源软件：foldmason.foldseek.com和web服务器：search.foldseek.com/foldmason。
O（s）空间中的最佳间隙式对齐
动机：成对序列比对仍然是计算生物学和生物启发性的基本问题。基因组学和测序技术的最新进展要求更快，可扩展的算法可以应对不断增加的序列长度。基于动态程序的经典成对比对算法受到时间和记忆的二次需求的强烈限制。最近提出的波前比对算法（WFA）引入了一种有效的算法，以在OðNS的时间内执行精确的差距 - 额度对齐，其中s是最佳分数，n是序列长度。尽管有这些界限，但WFA的OðS2Þ对于基因组尺度比对在计算上是不切实际的，导致需要进一步改进。结果：在本文中，我们介绍了双向WFA算法，即能够计算Oðsmemory中最佳比对的第一个GAP-AFFINE算法，同时保留WFA的时间复杂性OðNSS。结果，这项工作改善了最低的已知内存结合OðnÞ以计算间隙 - 额定对准。实际上，我们的实施不需要超过几百MB的嘈杂的牛津纳米孔技术来读取多达1 MBP，同时保持有竞争力的执行时间。可用性和实施：所有代码均可在https://github.com/smarco/biwfa-paper上公开获取。联系人：santiagomsola@gmail.com补充信息：补充数据可从BioInformatics Online获得。
通过加强学习的偏好对齐...
学分：[1] Christiano等。，《神经》 17中的深入强化从人类的偏好中学习。[2] Ziegler等。，来自人类偏好的微调语言模型，在Arxiv'19中。[3] Ouyang等。，培训语言模型在Neurips'22中按照人为反馈的指示进行指示。[4] Rafailov等。，直接偏好优化：您的语言模型是秘密的奖励模型，在Neurips'23中。[5] Hong等。，ORPO：Arxiv'24中的无参考模型的单片偏好优化。
2月27日9：30-10：45am -Algorithmic Alignment
Zi Liang, Pinghui Wang, Ruofei Zhang, Haibo Hu, Shuo Zhang, Qingqing Ye, Nuo Xu, Yaxin Xiao, Chen Zhang, Lizhen Cui Exploring Intrinsic Alignments within Text Corpus
对重建晶片的光刻处理的模具对齐
该实验的结果证明了Liteq 500工具在置换和旋转中检测，测量和纠正大偏移的能力，在与当前工业标准保持一致的同时，提供了亚微米的准确性。分析表明，可以通过优化对齐过程来实现吞吐量的重大改进。计划进行其他实验，以验证覆盖性能，并在Liteq 500上使用重建晶片进行叠加诊断的能力。初步估计表明，当覆盖要求不太严格时，可以实现更快的吞吐量。在未来的工作中，我们计划研究当前FO-WLP过程中所需的覆盖精度级别可实现的吞吐量。