XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemdsDNA
化学科学-RSC出版
对于所有CAS蛋白和基于CAS蛋白的效果，第一个关键步骤是在复杂的细胞环境中将其正确的目标定位在众多非核C和o效位点之间。一般而言，DNA结合蛋白在溶液中结合了三维（3D）差异，并沿DsDNA轮廓沿溶液和一维（1D）差，并有效地在基因组DNA上搜索其认知位点。28 - 31个先前的研究已经确定了CAS9和Cas12a都结合了3D和1D差异，以有效地促进其目标搜索过程。32 - 36 1D在DsDNA上的蛋白质的1D差异通常是由重复的瞬态结合事件介导的，这是由它们之间的非特定C静电相互作用驱动的。尽管已经解决了其APO态或具有DNA和RNA的复合物中CAS蛋白的许多结构，但已解决了37 - 47瞬时CAS蛋白DNA结合结构域介导的1d DI驱动靶向搜索量较低。因此，工程介导的残留物介导1D CAS蛋白的1D差异从未被使用，甚至被测试为
单元 - MDC 存储库
嵌合抗原受体 (CAR) 重定向 T 细胞是治疗血液系统恶性肿瘤的有效选择。目前，CAR T 细胞的主要制造方法依赖于逆转录病毒转导。随着基因编辑的出现，使用腺相关病毒进行基因转移将 CD19-CAR 插入 T 细胞受体 (TCR) α恒定区 (TRAC) 基因座已得到证实，并且这些 CD19-CAR T 细胞比逆转录病毒转导的细胞表现出更好的功能性。然而，临床级病毒生产很复杂，而且成本高昂。在这里，我们优化了一种无病毒基因组编辑方法，使用 CRISPR-Cas 和双链模板 DNA (dsDNA) 通过核酸酶辅助同源性定向修复 (HDR) 将 CAR 有效地插入原代人类 T 细胞的 TRAC 基因座。我们评估了 DNA 传感器抑制和 HDR 增强作为两种药物干预措施，分别以提高细胞活力和相对 CAR 敲入率。虽然转染的 dsDNA 的毒性无法完全预防，但两种干预措施的结合显著提高了 CAR 敲入率和 CAR T 细胞产量。由此产生的 TRAC 替代 CD19-CAR T 细胞在体外表现出抗原特异性细胞毒性和细胞因子产生，并在异种移植小鼠模型中减缓了白血病进展。扩增子
泛素 - 蛋白酶体系统是杀死抗顺铂的膀胱癌细胞
摘要。同源重组修复（HRR）是双链DNA（dsDNA）断裂无错误修复的细胞机制。在编码HRR的蛋白质（例如BRCA1和BRCA2）的基因等位基因中具有突变的癌细胞在修复过程中都有缺陷。 因此，这些细胞用替代机制（例如非同源末端连接）修复DsDNA破裂。 在BRCA1和BRCA2基因中具有种系突变的乳腺癌中，HRR缺陷会导致对PARP抑制剂的敏感性，这些药物干扰PARP酶功能并促进酶在DNA上的捕获以及修复单链断裂的过程。 HRR缺陷也导致对DNA损害化学疗法的敏感性，因为细胞无法修复化学疗法诱导的DNA病变。 除了BRCA1和BRCA2中的种系突变外，这些基因或种系中的体细胞突变以及体细胞突变，或其他涉及同源重组（HR）的基因的其他遗传和表观遗传变化可能会产生HRR缺陷，从而导致对PARP抑制剂的敏感性。 然而，研究的结论较少，这一事实可能与这些情况下通常缺乏双行性功能丧失有关，而不是通常会损失双行性功能的癌症BRCA1或BRCA2缺陷的癌症。 in癌细胞在修复过程中都有缺陷。因此，这些细胞用替代机制（例如非同源末端连接）修复DsDNA破裂。在BRCA1和BRCA2基因中具有种系突变的乳腺癌中，HRR缺陷会导致对PARP抑制剂的敏感性，这些药物干扰PARP酶功能并促进酶在DNA上的捕获以及修复单链断裂的过程。HRR缺陷也导致对DNA损害化学疗法的敏感性，因为细胞无法修复化学疗法诱导的DNA病变。除了BRCA1和BRCA2中的种系突变外，这些基因或种系中的体细胞突变以及体细胞突变，或其他涉及同源重组（HR）的基因的其他遗传和表观遗传变化可能会产生HRR缺陷，从而导致对PARP抑制剂的敏感性。然而，研究的结论较少，这一事实可能与这些情况下通常缺乏双行性功能丧失有关，而不是通常会损失双行性功能的癌症BRCA1或BRCA2缺陷的癌症。in
epinext™DNA库制备套件（Illumina）
用途：EPINEXT™DNA库制备试剂盒（Illumina）适合使用Illumina Sequencer制备下一代测序应用的DNA库，其中包括基因组DNA-SEQ，chip-seq，chip-seq，medip/hmedip-seq，bisulfite-seq，bisulfite-seq，bisulfite-seq，targeted reparted reqe reqecencess。该套件的优化协议和组件允许使用偏置减少的偏差快速构建非标语（单个复合）和条形码（多重）DNA库。起始材料和输入量：起始材料可以包括从各种组织或细胞样品中分离出的碎片dsDNA，从芯片反应，MEDIP/HMEDIP反应或外显子捕获中富集的dsDNA。DNA应该相对不含RNA，因为大的RNA部分会损害末端修复和DA尾巴，从而降低了连接能力。DNA的输入量可以从5 ng到1 ug。为了获得最佳准备，输入量应为100 ng至200 ng。对于无扩增，需要500 ng或更多。预防措施：避免交叉污染，将样品或溶液仔细移液管中。使用气溶胶式移液器尖端，并始终在液体转移之间更改移液器。在整个过程中戴上手套。如果手套与样品之间接触，请立即更换手套。
自噬受体NDP52改变DNA构象以调节RNA聚合酶II转录
NDP52是一种自噬受体，涉及入侵病原体和受损细胞器的识别和降解。尽管NDP52是在核中首次识别的，并在整个细胞中表达，但迄今为止，NDP52尚无明显的核功能。在这里，我们使用多学科方法来表征NDP52的生化特性和核作用。我们发现，NDP52在文档启动位点具有RNA聚合酶II（RNAPII）的簇，并且其过表达促进了其他转录簇的形成。我们还表明，NDP52的耗竭会影响两个模型哺乳动物细胞中的总体基因表达水平，并且转录抑制作用会影响核中NDP52的空间组织和分子动力学。这将NDP52与依赖性转录中的角色联系起来。此外，我们还表明，NDP52与双链DNA（DSDNA）结合，并具有高度的a（DSDNA），并且这种相互作用会导致体外DNA结构的变化。这与我们的蛋白质组学数据一起表明与核小体重塑蛋白和DNA结构调节剂相互作用富集，这表明NDP52在染色质调节中的可能功能。总的来说，我们在这里发现了NDP52在基因表达和DNA结构调节中的核作用。
IDT xGen DNA Library Prep EZ Kit 和 xGen DNA Library Prep EZ UNI Kit 方案 (RUO21-0413_002 06/24)
xGen DNA 文库制备 EZ 试剂盒简化了 NGS 样本制备，用于在 Illumina ® 平台上进行测序。该试剂盒提供快速 DNA 片段化和文库构建，以生成用于测序的文库（图 1）。提供了获取 350bp 或 200bp 平均比对插入片段的详细说明，用于直接或靶向测序。针对更大的插入片段大小（最多 550 bp），提供了协议修订版，以指导您使用 xGen 减速模块。
利用多种 V 型 CRISPR 进行无 PAM 诊断
V 型 CRISPR-Cas 效应子通过促进核酸生物标志物的检测，彻底改变了分子诊断。然而，它们依赖于目标双链 DNA (dsDNA) 上原间隔区相邻基序 (PAM) 位点的存在，这极大地限制了它们作为诊断工具的灵活性。在这里，我们提出了一种名为 PICNIC 的新方法，该方法只需对当代 CRISPR 检测方案进行约 10 分钟的简单修改，即可解决基于 CRISPR 的诊断的 PAM 问题。我们的方法包括通过高温和高 pH 处理将 dsDNA 分离成单个单链 DNA (ssDNA) 链。然后，我们以无 PAM 的方式使用多种 Cas12 酶检测释放的 ssDNA 链。我们通过成功将 PICNIC 用于 Cas12 家族的三种不同亚型（Cas12a、Cas12b 和 Cas12i）的无 PAM 检测，展示了 PICNIC 的实用性。值得注意的是，通过将 PICNIC 与含有 crRNA 的截短 15 核苷酸间隔区相结合，我们证明了使用 CRISPR 进行临床上重要的单核苷酸多态性的 PAM 独立检测。我们采用这种方法检测 HIV-1 的耐药变体（特别是 K103N 突变体）的存在，该变体在突变附近缺乏 PAM 位点。此外，我们成功地将我们的方法应用于临床样本，通过在 HCV 基因组中无 PAM 位点以 100% 特异性检测和基因分型 HCV-1a 和 HCV-1b 变体。总之，PICNIC 是一种简单但具有突破性的方法，它通过消除 PAM 序列的限制提高了基于 CRISPR-Cas12 的诊断的灵活性和精确度。
国际生物大分子杂志
脱氧核糖核酸（DNA）是小有机和无机药物分子的重要靶标。在站立的DNA相互作用机制下，这些分子对于新药物设计至关重要。在这项工作中，通过实验和理论方法监测了带有小腿 - 硫脲双链DNA（dsDNA）的黄氨酸（XT），茶碱（TP）和Theobromine（TB）之间的teractions。在实验上，在NIO/MWCNT/MWCNT/NNAM/PGE电化学平台的体外，使用了环状伏安Metry（CV）和差异脉冲伏安法（DPV）技术。动力学参数，包括扩散系数，表面浓度和标准异质速率常数。在存在DNA的情况下，观察到动力学参数显着降低。使用CV和DPV技术计算了每个分子的热力学参数，例如DNA结合常数和标准游离Gibbs能量。两种技术都建议XT> tb> tp的结合亲和力顺序。从理论上讲，XT，TP和TB的密度功能理论用于几何优化，自然键分析以及分子轨道能。实验和理论结合亲和力相互证实。最稳定的配体-DNA复合物表达，XT，TP和TB通过小凹槽结合模式与DSDNA相互作用，主要是使用氢键。
wenn dna警报auslöst
背景信息•背景信息•背景信息背景信息，用于分配Paul Ehrlich-和Ludwig Darmstaedter奖2025年教授博士。 Andrea Ablasser，博士教授格伦·巴伯（Glen Barber）和博士教授当DNA警报触发我们身体的细胞时，Zhijian J. Chen暴露于许多不同的威胁。这包括例如病毒感染，癌症和其发电厂（线粒体）中的事故。所有这些威胁共同表明它们在没有生意的细胞等离子体中显示了DNA双链（DSDNA）。那里信号外国遗传信息。也不应出现在细胞核和线粒体之外。随着我们先天的免疫系统承认并消除了错误位置的DNA的危险，长期以来一直是一个谜。这三名获奖者在2008年至2013年之间解决了这一问题，从那以后，它得到了越来越广泛的通知。他们在开头发现了一个信号路径，酶传感器为。一旦他在细胞等离子体中跟踪dsdna，他就会抓住她。这会改变其形状，从而可以催化分子信使的形成。该使者控制着一个细胞内受体，该受体通过使某些基因对齐在细胞核中接受并转换信使的信息：立即产生干扰素。这些干扰素散布在周围的组织中，并寻求帮助。这违反了我们的免疫系统“奇怪”和“本身”必须明确区分的规则。区别于所谓的CGAS-sting-Pathway是其普遍性：它的传感器没有区分外部和人体自己的DSDNA。这种违反规则的行为是有风险的，因为它具有无意自我毁灭的可能性。它提供了一种双重方法来干预此信号路径。每天我们受到数千种细菌和病毒的攻击。在大多数情况下，我们的身体成功地抵御了这些攻击。这要归功于其先天的免疫系统，入侵者在国际象棋中持有它，直到他的信号激活了获得的免疫系统，抗体和T细胞以关闭攻击者。在此之前可能需要几天。没有天生的免疫力，如今我们几乎无法生存。尽管如此，他们的研究长期以来一直在阴暗的存在。虽然20th世纪非常精确地知道，很长一段时间以来，先天性免疫系统如何感知微生物攻击。仅通过朱尔斯·霍夫曼（Jules Hoffmann）和布鲁斯·贝特勒（Bruce Beutler）的发现而改变
细胞治疗应用的基因修饰
细胞 从 3 名健康人类供体的新鲜白细胞分离物中分离出的 PBMC 电穿孔期间的细胞浓度 5 x 10 7 个细胞/mL 有效载荷 CTS TrueCut Cas9 蛋白 120 µg/mL 定制 TRAC sgRNA 30 µg/mL 线性 CAR 供体 dsDNA 240 µg/mL 电穿孔方案 氖系统电穿孔方案 #24 1,600 V；10 毫秒；3 个脉冲 CTS 氙气系统电穿孔方案 2,300 V；3 毫秒；4 个脉冲