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合成脂质纳米粒子-RNA复合物并验证其生物学功能。
总之，我们能够成功转录修饰的 eGFP mRNA、Cas9 mRNA 和 sgLuc 和 sgEGFR 并将它们封装在 LNP 中。我们通过加入假尿苷并利用 CleanCap 技术引入 5' 帽来修饰 RNA，因为它不仅可以增强 RNA 的稳定性，还可以提高翻译率并最大限度地降低在细胞内转染时的毒性。我们取得的另一个有希望的结果是关于 LNP 大小、Zeta 电位和 PDI，这似乎适合在体内实验中使用。以前的研究中还没有发现利用 LNP 作为载体（除 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗外）的基因治疗方法。更具体地说，利用安全批准的可电离 Moderna SM-102 脂质和辉瑞 ALC-0315 脂质（我们在研究中用于生成 LNP）的体内基因治疗方法至今仍不得而知。因此，我们希望将来能开发出结合这些可电离脂质的新型基因疗法。此外，目前还没有关于将 Prime editor 包装在 LNP 中的研究。我们相信可以包装 prime editor mRNA，因为我们已经证明其他小 mRNA 也可以包装在 LNP 中。其他研究通过展示 DNA 和 RNP 的封装进一步支持了这一点。再说一遍，很难找到成功将 Piezo1 mRNA 包装在 LNP 中的研究。这可能是因为长 mRNA 的体外转录很难进行，因为 RNA 的二级结构会出现，因为进行载体线性化不是一件容易的事。因此，我们无法成功转录 Piezo1 mRNA，目前正在排除故障。然而，我们相信，一旦我们成功转录 Piezo1 mRNA，这将为治疗开辟许多可能性，例如治疗脂肪肝或肝脏组织再生，后者将有助于器官捐赠后的恢复过程。
t-dNA插入肉胶中的brocaim brocae结果...
收到2022年9月14日； 2023年3月23日接受； 2023年4月17日出版作者分支：1广州林业与景观建筑研究所，广州510405，中国公关； 2广东工业理工学院的生态环境技术学院，纳海校区，佛山528225，中国公关； 3州生物控制和广东植物资源主要实验室的国家主要实验室，生命科学学院，孙子森大学，广州510275，公关中国。*通信：changchao Xu，Xuchangchao12345@aliyun。com关键字：磷酸盐溶解化； T-DNA插入；烯醇酶。缩写：AD，任意退化底漆； ATMT，农杆菌Tumefaciens介导的转化；棒，伴侣抗性基因；凸轮，醋酸纤维素膜；挖掘，二高氧素蛋白； DW，干重； EGFP，增强的绿色荧光蛋白； GCD，葡萄糖脱氢酶基因； GFP，绿色荧光蛋白； GUS，β-葡萄糖醛酸酶； HPH，Hygromycin B磷酸转移酶基因； HPLC，高性能液相色谱； IM，感应培养基； LB，Luria – Bertani培养基； MES，2-（N- morpholino）乙磺酸； NCM，硝酸纤维素膜； PDA，马铃薯葡萄糖琼脂； PDB，马铃薯葡萄汤； PEG，聚乙烯乙二醇； PQQ，吡咯喹啉喹酮合成基因； PSM，磷酸盐溶解微生物； PVK，Pikovskaya Medium;尾-PCR，热不对称交错PCR； T-DNA，转移DNA。已将核苷酸烯醇酶基因的核苷酸序列和相应的cDNA序列沉积在国家生物技术信息中心（NCBI）核苷酸数据库（https://wwwww.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/nuccore/）无访问量表上的核苷酸数据库（https://wwwww.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/）。001325©2023作者†这些作者同样为这项工作做出了同样的贡献，三个补充数据和本文的在线版本提供了两个补充表。
解锁 loxP 来追踪体内基因组编辑
摘要：CRISPR 相关蛋白（如 Cas9）的开发提高了基因组编辑的可及性和易用性。然而，需要额外的工具来量化和识别活体动物中成功的基因组编辑事件。我们开发了一种快速量化和监测活体动物中基因编辑活动的方法，该方法还有助于共聚焦显微镜和核苷酸水平分析。在这里，我们报告了一种新的 CRISPR“指纹识别”方法，用于激活小鼠中的荧光素酶和荧光蛋白作为基因编辑的功能。该系统基于我们之前的 cre 重组酶 (cre) 检测系统的经验，专为能够靶向 lox P 的 Cas 编辑器而设计，包括 SaCas9 和 ErCas12a 的 gRNA。这些 CRISPR 专门在 lox P 内切割，这种方法不同于以前靶向相邻终止序列的体内基因编辑活动检测技术。在这种传感器范例中，在肌肉或静脉内流体动力质粒注射后，在活体 cre 报告小鼠（FVB.129S6(B6)-Gt(ROSA)26Sortm1(Luc)Kael/J 和 Gt(ROSA)26Sortm4(ACTB-tdTomato,-EGFP)Luo/J，本文中将称为 LSL-luciferase 和 mT/mG）中非侵入性地监测 CRISPR 活性，证明了其在两种不同器官系统中的实用性。通过共聚焦显微镜在特定组织的细胞水平上检查了相同的基因组编辑事件，以确定成功基因组编辑细胞的身份和频率。此外，SaCas9 诱导的靶向编辑效率与 cre 相当，证明了在整个动物中具有高效的传递和活性。这项研究建立了基因组编辑工具和模型，以非侵入性方式追踪体内 CRISPR 编辑并识别目标细胞。这种方法还使之前生成的数千种 lox P 动物模型中的任何一种都具有类似的实用性。
使用tsukuba系统矢量
使用遗传转化方法评估在果树种类中表达的基因的功能是一个漫长的过程，因为这些树木通常是对遗传转化的顽固性，并且在较长的幼年相中不能忍受果实。果实中的瞬时基因表达能够对与果实性状相关的基因进行功能分析，从而加速了果实生理的研究。在这里，通过使用最近开发的“ tsukuba系统”，我们成功地建立了收获的水果组织中有效的瞬态表达系统。“ tsukuba系统”利用了双子病毒复制系统和双终止仪的组合，从而确保了足够的转基因表达水平。我们使用蓝莓水果作为模型来表征该系统在果组织中瞬时表达的适用性。PTKB3- EGFP载体是通过浸润到几种蓝莓品种的水果组织中引入的。我们发现，果实灌注后4-6天，果实中的瞬时GFP荧光。农杆菌悬浮液很容易注入柔软的成熟果实，GFP强烈表达。然而，硬质果实无法通过农业悬浮液渗透，很少检测到GFP。然后，我们测试了开发系统对其他果树的适用性：六个家庭，17种和26种品种。GFP荧光。在蓝莓，鸟莓，甜樱桃，杏子和卫星普通话中，GFP高度表达并以很大一部分的肉体观察到。在Kiwifruit，Hardy Kiwifruits，柿子，桃子，苹果，欧洲梨和葡萄中，GFP荧光仅限于某些部分水果。最后，对蓝莓中的瞬态VCMYBA1过表达进行了测试，作为水果中基因功能分析的模型。瞬态VCMYBA1过表达诱导肉中的红色色素沉着，这表明VCMYBA1表达引起花青素的积累。这项研究为在水果中表达的基因的快速评估提供了技术基础，这对于长期幼年阶段的水果作物的基因功能评估研究非常有用。
敲低胎盘主要的促进剂超家族域，含有2A的孕妇小鼠降低了胎儿脑的生长和磷脂docosahexaenoic Acid
摘要：简介：Docosahexaenoic Acid（DHA）是n -3长链多不饱和脂肪酸，对于胎儿发育至关重要，胎盘通过胎盘从母亲传输到胎儿。含有2A（MFSD2A）的主要促进剂超级家族型溶血磷脂酰胆碱（LPC）转运蛋白位于人胎盘的合成型胞植物细胞的基础质膜中，人胎盘的胎盘膜细胞和MFSD2A表达与人类表达的人类表达与昏迷的corn lumbilical Corncly lppc-lpc-lpc-dha相关。我们假设孕妇小鼠中MFSD2A的胎盘特异性敲低会减少胎儿脑中的磷脂DHA的积累。方法：用表达EGFP的慢病毒（E3.5）的小鼠胚泡（E3.5），该慢病毒含有靶向MFSD2A或非编码序列（SCR）的shRNA，然后转移到假孕妇中。在E18.5时，称重胎儿，并收集其胎盘，大脑，肝脏和血浆。MFSD2A mRNA表达通过QPCR在大脑，肝脏和胎盘中测定，以及通过LC-MS/MS量化磷脂DHA。结果：与SCR对照相比，在E18.5（n = 45，p <0.008）时，靶向MFSD2A的shRNA在E18.5（n = 45，p <0.008）时将胎盘mRNA MFSD2A的表达降低了38％。MFSD2a在胎儿脑和肝脏中的表达不变。胎儿脑体重减少了13％（p = 0.006）。体重，胎盘和肝脏重量不受影响。胎儿脑磷脂酰胆碱和磷脂酰乙醇胺DHA含量较低，胎盘特异性MFSD2A敲低的胎儿含量较低。这些数据提供了机械证据，表明胎盘MFSD2A介导LPC-DHA的母体 - 饮食转移，这对于大脑生长至关重要。结论：LPC-DHA转运蛋白MFSD2A表达表达的胎盘特异性减少导致胎儿脑体重降低，胎儿大脑中磷脂DHA含量降低。
化脓性链球菌 Cas9 核糖核蛋白递送，用于在锥虫和利什曼原虫中进行高效、快速和无标记的基因编辑
图 1 布氏锥虫 PCF 中的 GFP 失活。（a）对组成性表达胞浆 eGFP 的布氏锥虫进行荧光流式细胞术分析。在用 20 μ g（无 Cas9、Cas9/gRNA GFP1、Cas9/gRNA GFP2、Cas9/gRNA GFP3）或 60 μ g（Cas9/gRNA GFP2）来自 IDT 的 RNP 复合物转染后 24 至 72 小时随时间监测 GFP 荧光，条形图显示用不同向导转染后 72 小时 GFP 阴性细胞的百分比（n = 3）。采用 Prism 软件进行统计分析，采用 t 检验（非配对、正态分布、参数检验和双尾）。显着性水平（p 值）用星号表示。 （b）上图显示了允许 e Sp Cas9 在大肠杆菌中表达的质粒的示意图。蓝色框表示蛋白质 N 端和 C 端的两个多组氨酸序列，红色框表示 TEV 和肠激酶 (EK) 蛋白酶的切割位点，灰色框表示三个核定位信号 (NLS)，黑色框表示 FLAG 表位的三个重复，橙色框表示 e Sp Cas9 编码序列。下图显示了在用来自 IDT 或实验室纯化 (Lab) 的 RNPs 复合物 (无 Cas9、20 μ g Cas9/gRNA GFP2、40 μ g Cas9/gRNA GFP2、40、60 和 80 μ g Cas9/gRNA GFP2) 转染后 72 小时监测的表达 GFP 的 T. brucei 的荧光流式细胞术分析。（c）不再表达 GFP 的克隆中 GFP 基因的一部分的序列比较。该序列仅显示 GFP2 向导 RNA 所针对的区域。灰色框（H1 和 H2）突出显示可能用于 MMEJ 修复的同源区域。由实验室纯化的 Cas9 失活产生的序列和来自商业 Cas9 的序列分别标记为 Lab 和 IDT。下面显示了 Dc6 和 Ba10 克隆的相应色谱图（置信区间 95%— p 值样式：0.1234 (ns)；0.0332 (*)；0.0021 (**)；0.0002 (***)；< 0.0001 (****)）。
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目的：帕金森氏病（PD）是最普遍的神经退行性疾病之一，其特征是底虫nigra pars compacta中多巴胺能神经元的丧失。PD治疗旨在通过替换减少的内源性多巴胺来减轻运动症状。当前，没有用于治疗PD的疾病改良剂。斑马鱼（Danio Rerio）已成为转化研究时代新药发现和筛查的有效工具。已知神经毒素1-甲基-4-苯基-1-甲基-4-苯基-1-2,3,6-四氢吡啶（MPTP）在人中脑中会导致类似的多巴胺能神经元损失，并具有相应的帕金森尼症状。L型钙通道（LTCC）与线粒体氧化应激的产生有关，这是PD发病机理的基础。因此，我们研究了LTCC抑制在MPTP诱导的斑马鱼PD模型中的神经滋补作用，并提出了可能改变PD进展的药物候选者。方法：所有实验均使用转基因斑马鱼（DAT：EGFP）系进行，其中绿色荧光蛋白（GFP）在多巴胺能神经元中表达。实验组在受精后1至3天暴露于500μmolMPTP（DPF）。候选药物：左旋多巴1 mmol，硝苯地平10μmol，nimodipine3.5μmol，二乙基苯甲酸酯0.3μmol，叶酸酯100μmol和钙钙醇100μmol，降钙素0.25μmol从3到5 dpf暴露于3至5 dpf。运动活性，并通过共聚焦显微镜在体内观察到多骨神经元。结果：左旋多巴，二莫迪平，二乙基苯甲醇和骨化三醇对运动行为的恢复具有显着的积极影响，该行为受到MPTP的损害。nimodipine和Clacitiri对多巴胺能神经元的恢复具有显着的积极作用，而多巴胺能神经元通过MPTP降低。通过运动分析和多巴胺能神经元定量，我们鉴定了二摩氨基氨酸和钙三醇在斑马鱼MPTP诱导的PD模型中的神经摄影作用。结论：本研究确定了Nimodipine和Clacitiri在MPTP诱导的PD模型中的神经滋补作用。他们恢复了由于MPTP的影响并使运动活性归一化的多巴胺能神经元。LTCC在神经发育和神经退行性疾病中具有潜在的病理作用。斑马鱼高度适合高通量药物筛查，因此可能是致力于鉴定PD疾病治疗的有用工具。需要进一步的研究，包括斑马鱼遗传模型，以通过研究多巴胺能神经元中的Ca2+涌入和线粒体功能来阐明疾病修饰候选者的作用机制，以揭示PD的发病机理并发展PD的疾病治疗方法。
细胞对CDK4抑制剂palbociclib的长期暴露会导致染色体像差
抽象的乳腺癌通常是由突变，细胞周期调节蛋白的变化和激活驱动的，包括视网膜细胞瘤肿瘤抑制蛋白（RB），细胞周期蛋白E和细胞周期蛋白依赖性激酶（CDKS），尤其是细胞周期蛋白D：CDK4/6复合物。目前有三种FDA认可的CDK4/6抑制剂（CDK4I）用于治疗乳腺癌。标准治疗方案是连续CDK4I治疗的21天，然后进行7天的停止期，然后重复28天的方案。我们询问了在7天CDK4I停止期间重新进入细胞周期的细胞会发生什么问题。使用含有视觉报道器内源性组蛋白2B和p27基因的RPE1细胞标记为EGFP和MCHERRY，我们用CDK4I，palbociclib处理了1至42天的细胞，跨越了临床暴露，通过药物释放（PARKOPIC）的释放，我们发现了临床暴露的时间。在微核和多核细胞中，已重新进入细胞周期。峰值染色体畸变发生在14到35天之间，这个时间跨越了临床给药方案。这些观察结果提出了有关循环患者在CDK4抑制剂中的循环和关闭的潜力，可能会导致染色体细胞对肿瘤细胞的总体变化，从而在7日临床上产生临床的临床范围，从而使肿瘤循环逐渐增加。关键词palbociclib，CDK4/6抑制剂，CDKN1B在美国女性引入，乳腺癌仍然是癌症的最常见形式，也是癌症第二常见的死亡原因[1]。乳腺癌通常是由突变，细胞周期调节蛋白的变化和激活驱动的，包括视网膜细胞瘤肿瘤抑制蛋白（RB），细胞周期蛋白E和细胞周期蛋白依赖性激酶（CDKS）[2,3]。以前，Cyclin d：CDK4复合物被认为通过低磷酸化灭活RB [4,5]；然而，我们实验室和其他人的最新证据现在表明，在细胞周期的G1早期，细胞周期蛋白D：CDK4仅定量单磷酸化RB，并且14个单磷酸化的RB同工型每个选择性地结合细胞靶标[6-8]。 相反，限制点的细胞周期蛋白E：CDK2复合物的激活通过高磷酸化进行初始RB灭活，触发E2F转录因子的释放，进展为G1晚期，然后进入S相[6,7]。 尚不清楚Cyclin d：Cdk4的非RB靶标在G1早期以驱动细胞周期进展，但很明显，连续的细胞周期蛋白D：CDK4活性是许多乳腺癌（包括乳腺癌）早期G1细胞周期进展的必需驱动器[9]。 FDA批准了第一个CDK4抑制剂（CDK4I），Palbociclib（IBRANCE），是2015年的突破性治疗方法，用于治疗雌激素受体阳性（ER+）乳腺癌[10]。 在2017年进行了此跟踪，并批准了CDK4I在ER+/HER2阴性乳腺癌中使用[11]。 鉴于细胞周期蛋白D：CDK4在驱动癌症中的重要性，现在有三种FDA批准的抑制剂[12]也就不足为奇了。 标准的CDK4I治疗连续21天与抗雌激素药物结合使用，然后进行7天的戒烟，然后重复28以前，Cyclin d：CDK4复合物被认为通过低磷酸化灭活RB [4,5]；然而，我们实验室和其他人的最新证据现在表明，在细胞周期的G1早期，细胞周期蛋白D：CDK4仅定量单磷酸化RB，并且14个单磷酸化的RB同工型每个选择性地结合细胞靶标[6-8]。相反，限制点的细胞周期蛋白E：CDK2复合物的激活通过高磷酸化进行初始RB灭活，触发E2F转录因子的释放，进展为G1晚期，然后进入S相[6,7]。尚不清楚Cyclin d：Cdk4的非RB靶标在G1早期以驱动细胞周期进展，但很明显，连续的细胞周期蛋白D：CDK4活性是许多乳腺癌（包括乳腺癌）早期G1细胞周期进展的必需驱动器[9]。FDA批准了第一个CDK4抑制剂（CDK4I），Palbociclib（IBRANCE），是2015年的突破性治疗方法，用于治疗雌激素受体阳性（ER+）乳腺癌[10]。在2017年进行了此跟踪，并批准了CDK4I在ER+/HER2阴性乳腺癌中使用[11]。鉴于细胞周期蛋白D：CDK4在驱动癌症中的重要性，现在有三种FDA批准的抑制剂[12]也就不足为奇了。标准的CDK4I治疗连续21天与抗雌激素药物结合使用，然后进行7天的戒烟，然后重复28