解锁 loxP 来追踪体内基因组编辑
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摘要:CRISPR 相关蛋白(如 Cas9)的开发提高了基因组编辑的可及性和易用性。然而,需要额外的工具来量化和识别活体动物中成功的基因组编辑事件。我们开发了一种快速量化和监测活体动物中基因编辑活动的方法,该方法还有助于共聚焦显微镜和核苷酸水平分析。在这里,我们报告了一种新的 CRISPR“指纹识别”方法,用于激活小鼠中的荧光素酶和荧光蛋白作为基因编辑的功能。该系统基于我们之前的 cre 重组酶 (cre) 检测系统的经验,专为能够靶向 lox P 的 Cas 编辑器而设计,包括 SaCas9 和 ErCas12a 的 gRNA。这些 CRISPR 专门在 lox P 内切割,这种方法不同于以前靶向相邻终止序列的体内基因编辑活动检测技术。在这种传感器范例中,在肌肉或静脉内流体动力质粒注射后,在活体 cre 报告小鼠(FVB.129S6(B6)-Gt(ROSA)26Sortm1(Luc)Kael/J 和 Gt(ROSA)26Sortm4(ACTB-tdTomato,-EGFP)Luo/J,本文中将称为 LSL-luciferase 和 mT/mG)中非侵入性地监测 CRISPR 活性,证明了其在两种不同器官系统中的实用性。通过共聚焦显微镜在特定组织的细胞水平上检查了相同的基因组编辑事件,以确定成功基因组编辑细胞的身份和频率。此外,SaCas9 诱导的靶向编辑效率与 cre 相当,证明了在整个动物中具有高效的传递和活性。这项研究建立了基因组编辑工具和模型,以非侵入性方式追踪体内 CRISPR 编辑并识别目标细胞。这种方法还使之前生成的数千种 lox P 动物模型中的任何一种都具有类似的实用性。

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