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CRISPR-Cas9 载体
CRISPR/Cas9系统已被广泛应用于基因组编辑，包括基因破坏、定点诱变、表观遗传调控等。化脓性链球菌（SpCas9）是目前最常用的Cas9蛋白。通过SpCas9进行基因组编辑需要在靶位点有一个“NGG”原型间隔区相邻基序（PAM）序列，这限制了CRISPR/Cas9系统的编辑范围。为了扩大编辑位点的范围和优化编辑特异性，各种SpCas9突变体已被研究并成功应用于CRISPR系统。
血浆蛋白质组学识别缺血性心脏病的药物靶标
angptl1¼血管生成素相关蛋白1; Asgr1¼Asialogoprotoin受体1; CC4D¼心脏图ÞC4D; CCL17¼C-C基序趋化因子17; ckb¼中国kadoorie生物库； EFNA1 ephrin-a1; F2R¼蛋白酶激活的受体1; Furin¼Furin; ID¼标识； IHD¼缺血性心脏病； MAF¼小等位基因频率； mmp3¼基质金属蛋白酶-3; OBP2B¼气味结合蛋白2b; PGF¼胎盘生长因子； reg1b¼岩性磷酸1-β;排序1¼Sortilin; tchem¼t化学; tclin¼t-t-linical; TFPI¼组织因子途径抑制剂； tnc¼tenascin; UKB¼UKBIOBACE。
分析Alx1的DNA结合特性，Alx1是棘皮动物中骨骼生成的进化保守调节剂
alx1是一种含同源域的转录因子，是棘皮动物中骨骼生成的高度保守调节剂。在海胆中，ALX1在分化胚胎原代间充质细胞（PMC）中起着核心作用，并积极调节这些细胞表达的大多数生物矿化基因的转录。ALX1基因通过重复而产生，并通过41 - 氨基酸基序（D2域）获得了与其旁系同源物（ALX4）不同的骨骼发育功能。alx1和alx4含有谷氨酰胺-50成对型同源域，它们在体外优先与alindromic结合位点相互作用。染色质免疫沉淀测序（CHIP-SEQ）研究表明，ALX1在体内与腔植物和一半位点结合。为了解决这种明显的差异并探索D2结构域的功能，我们使用了与SP-MTMMPB关联的内源性顺式调节模块，SP-MTMMPB是一个编码PMC特定金属蛋白酶的基因，用于分析ALX1的DNA结合特性。我们发现，Alx1在含有一半位点的TAAT上形成了二聚体复合物，该机制与众所周知的二聚体位点上的机制不同。我们使用转基因报告基因测定法分析了一半位点在体内的功能作用，并证明了两个具有部分冗余功能的位点对于SP-MTMMPB CIS-顺式调节模块的PMC特异性活性至关重要。最后，我们表明D2结构域在体外影响了Alx1的DNA结合特性，这表明该基序的免除可能促进了新的转录靶标的获取，并因此是一种新颖的发展功能。
TIFAB通过形成与TIFA
核因子κB（NF -κB）被各种炎症和传染性分子激活，并参与免疫反应。已经阐明了ADP-β-D-甘露糖（ADP- HEP），一种革兰氏 - 阴性细菌的代谢物，通过α-激酶1（ALPK1） - TIFA -TIFA -TRAF6信号传导激活NF -κB。ADP- HEP刺激ALPK1的激酶活性用于TIFA磷酸化。 磷酸化 - 依赖性TIFA低聚物和TRAF6之间的复合形成促进了TRAF6对NF -κB激活的多泛素化。 tifab是缺乏磷酸化位点和TRAF6结合基序的TIFA同源物，是TIFA -TRAF6信号传导的负调节剂，与髓样疾病有关。 TIFAB被指出通过与TIFA和TRAF6的相互作用来调节TIFA -TRAF6信号传导。但是，对其生物学功能知之甚少。 我们认为TIFAB与TIFA二聚体形成复合物，TIFA二聚体是NF -κB激活涉及的TIFA的固有形式，而是与单体TIFA。 TIFA/TIFAB复合物以及基于生化和细胞的分析的结构分析表明，TIFAB形成具有TIFA的稳定异二聚体，抑制TIFA二聚体的形成，并抑制TIFA – TRAFAFAF6信号传导。 所得的TIFA/TIFAB复合物是缺少磷酸化位点的“伪-TIFA二聚体”，在TIFAB中缺乏TRAF6结合基序，无法形成针对NF -K -κB活化涉及的磷酸化TIFA寡聚的有序结构。 这项研究阐明了TIFAB通过TIFA-TRAF6信号进行调节的分子和结构基础。ADP- HEP刺激ALPK1的激酶活性用于TIFA磷酸化。磷酸化 - 依赖性TIFA低聚物和TRAF6之间的复合形成促进了TRAF6对NF -κB激活的多泛素化。tifab是缺乏磷酸化位点和TRAF6结合基序的TIFA同源物，是TIFA -TRAF6信号传导的负调节剂，与髓样疾病有关。TIFAB被指出通过与TIFA和TRAF6的相互作用来调节TIFA -TRAF6信号传导。但是，对其生物学功能知之甚少。我们认为TIFAB与TIFA二聚体形成复合物，TIFA二聚体是NF -κB激活涉及的TIFA的固有形式，而是与单体TIFA。TIFA/TIFAB复合物以及基于生化和细胞的分析的结构分析表明，TIFAB形成具有TIFA的稳定异二聚体，抑制TIFA二聚体的形成，并抑制TIFA – TRAFAFAF6信号传导。所得的TIFA/TIFAB复合物是缺少磷酸化位点的“伪-TIFA二聚体”，在TIFAB中缺乏TRAF6结合基序，无法形成针对NF -K -κB活化涉及的磷酸化TIFA寡聚的有序结构。这项研究阐明了TIFAB通过TIFA-TRAF6信号进行调节的分子和结构基础。
微藻基因工程的最新进展
图 1. 开发微藻作为商业产品生物制造平台的遗传工具。生物信息学算法用于分析藻类基因组序列，从而产生密码子优化和基序发现技术，这些技术允许设计用于藻类菌株遗传转化的强表达载体。启动子和转录因子等调控元件允许重组基因表达和代谢途径操纵以获得感兴趣的产品。随机诱变和基因组改组可以进一步推动藻类生产菌株向所需的表型发展。这些工具正被用于探索从微藻中工业化生产食品、燃料、材料和药物。
ATA3219：用于治疗B细胞驱动自身免疫性疾病的同种异体CD19 CAR EBV T细胞
blcl = b淋巴细胞细胞系； Bli =生物发光成像； CAR =嵌合抗原受体； EBV =爱泼斯坦 - 巴尔病毒； HLA =人白细胞抗原； IFN-γ=干扰素伽马； IL-4 =白介素4; IL-5 =白介素5; IL-6 =白介素6; ITAM =基于免疫受体酪氨酸的活化基序； ln =狼疮肾炎； MS =多发性硬化症； ntd =未转导的； PBMC =外周血单核细胞； PHAB，PHA爆炸； SCFV =单链变量片段； SLE =全身性红斑狼疮； TCR = T细胞受体； th2 = t助手2; tm-ic =跨膜构成细胞； TNF-α=肿瘤坏死因子α; VCN =矢量复制号。
X 染色体靶特异性在剂量之间有所不同……
摘要 进化视角增强了我们对生物机制的理解。通过对近缘线虫物种秀丽隐杆线虫 (Cbr) 和秀丽隐杆线虫 (Cel) 之间的性别决定和 X 染色体剂量补偿机制的比较，发现控制这两个过程的遗传调控层次是保守的，但控制 X 表达的专门凝聚蛋白剂量补偿复合物 (DCC) 的 X 染色体靶标特异性和结合模式已经出现分歧。我们在 Cbr DCC 募集位点内发现了两个在 X 上高度富集的基序：13 bp MEX 和 30 bp MEX II。在具有一个或两个基序的多个拷贝的内源性募集位点中突变 MEX 或 MEX II 会降低结合，但仅去除所有基序会消除体内结合。因此，DCC 与 Cbr 募集位点的结合看起来是附加的。相反，DCC 与 Cel 募集位点的结合是协同的：即使只突变一个基序也会消除体内结合。尽管所有 X 染色体基序都具有 CAGGG 序列，但它们在其他方面已经分化，因此一个物种的基序无法在另一个物种中发挥作用。功能分化在体内和体外均已得到证实。Cbr MEX 中的单个核苷酸位置可以决定 Cel DCC 是否结合。DCC 靶标特异性的这种快速分化可能是建立线虫物种间生殖隔离的重要因素，并且与果蝇物种间 X 染色体剂量补偿的靶标特异性的保守性以及控制发育过程（例如从果蝇到小鼠的体型特征）的转录因子的靶标特异性的保守性形成了鲜明对比。
crispr-cas9：革命性的基因组编辑及其...
Roshan Kumar和Ashima Mehta Dronacharya工程学院，印度古尔冈摘要：CRISPR-CAS9技术已成为一种用于精确基因组编辑的革命性工具，为各种生物体的基因操纵提供了前所未有的机会。本文提供了CRISPR-CAS9的全面概述，其中包括其分子机制，应用，挑战和道德考虑。我们讨论了CRISPR-CAS9的基本原理，包括指导RNA（GRNA）在将Cas9核酸酶引导到目标DNA序列中的作用，导致双链断裂和随后的基因组修饰关键词：CRISPR-CAS9，GRNA，GRNA，GRNA，GRNA，GRNA，GRNA，基因组编辑，基因编辑，基本辅助，Protospacer Aidfif（PAMENTIFF/diveme
YDAT的DNA结合的结构基础，YDAT是来自Escherichia Coli O157：H7
ydat在某些lambdoid噬菌体和预言中相当于CII阻遏物的功能。ydat可作为DNA结合蛋白起作用，并识别5 0 -TTGATTN 6 AATCAA-3 0倒置重复。DNA结合结构域是一个螺旋 - 螺旋 - 螺旋（HTH）含有POU域，其次是长螺旋（6），形成了一个反平行的四螺旋束，形成了四聚体。与典型的HTH基序相比，HTH基序中的螺旋2和识别螺旋3之间的循环异常长，并且在YDAT家族内的序列和长度高度变化。POU结构域具有相对于自由结构中的螺旋束相对于螺旋束的自由度，但是它们的方向固定在DNA结合上。
鉴定潜在的治疗靶标，以发展疾病管理中的新治疗策略
通过在1993年发现MicroRNA（miRNA），Victor Ambros1及其来自哈佛大学的群体为实现了研究领域的新里程碑做出了贡献。lin-4，其中包括与秀丽隐杆线虫的LIN-14 mRNA的3'未翻译区域（UTR）中的重复序列基序互补的序列。之后，Lin-4被视为蠕虫遗传学领域的发现。另一方面，直到发现第二个称为let-7的miRNA直到发现miRNA在包括人类在内的所有动物物种中都高度保守。