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基因变体多态性和子宫平滑肌
子宫平滑肌瘤通常称为肉鸡，是一种良性肿瘤，在子宫的肌肉壁中发展。这些生长是非癌性的，大小可能会有所不同，范围从微小的结节到较大的质量。子宫平滑肌瘤通常发生在女性的生殖年中，并可能导致症状，例如月经出血，骨盆疼痛和附近器官的压力。虽然确切的原因尚未完全理解，但据信荷尔蒙因素，尤其是雌激素和孕激素，在其发育中起作用。探索遗传变异与子宫平滑肌瘤之间的联系已吸引了多年的科学关注。调查的结果仍然是科学界的阴谋。迄今为止，有关单核苷酸多态性（SNP）和子宫平滑肌瘤之间关系的发现表现出一些不一致。然而，在这些不一致之处，出现了一些有希望的结果，具有塑造未来研究努力的潜力。这些有希望的铅可能为开发创新的靶向疗法和新颖的预后生物标志物铺平道路。本综述特定地集中于强调有关遗传变异的现有文献数据，这些数据因其与子宫平滑肌的潜在联系而被探索。此外，它强调了使用遗传变异作为诊断为子宫平滑肌瘤的个体的诊断和预后生物标志物的前景。
Bi-Callelic ACBD6变体导致神经发育
©作者2023。由牛津大学出版社（Oxford University Press）代表大脑的担保人出版。这是根据Creative Commons Attribution许可条款（https://creativecommons.org/licenses/4.0/）分发的一篇开放访问文章，该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用，分发和再现，前提是适当地引用了原始工作。1
RB1序列变体中的视网膜母细胞瘤。分析数据库中的RB1变体，以与PRB蛋白质结构域和临床表现相关性
视网膜母细胞瘤（RB）是由于RB1肿瘤抑制基因的双重失活而发生的最常见的小儿眼肿瘤。rb可能是单侧的或双侧的，在50％的病例中是遗传性的。RB1基因的灭活可能是由于总重排（20％）或小长度变化（80％）而发生的：单核苷酸取代（SNV）和插入/缺失（Indels）。我们分析了在数据库中注释的生发起源的SNV和Indels，http://rb1-lovd.d-lohmann.de，以找到不同变体的频率，它们与蛋白质PRB功能领域的相关性和临床表现。分析的突变变体的数量为2103，其中34％是胡说八道，34％的indels，22％的剪接场所和10％的错位。所有这些变体主要产生双侧RB（88％），它们与PRB结构域相关的频率和分布在双侧（BI）和单侧遗传（UG）RB之间有所不同。无意义的变体在BI与UG中更频繁地发生，而在UG与BI中，错义变体更为频繁。indels和剪接位点变体没有显着差异。突变变体的最常见的PRB位置是在袖珍域（E2F转录因子的结合位点），胡说八道的58％，64％的失误，50％的剪接位点和45％的Indels。最突变的共有序列的切片位点是供体的第一个核苷酸，这是剪接过程的驱动力。关键词双侧 /单侧视网膜母细胞瘤，RB1变体，PRB结构域，简介视网膜细胞瘤（RB）是最常见的眼科小儿肿瘤。2024）。结论：RB中变体的最高百分比对应于胡说八道和indels，主要影响口袋结构域，这是PRB调节过程的主要功能部位，这些结果表明视网膜母细胞瘤中最具致病性变体的占主导地位。它是通过双重抑制RB1基因在一个或多个视网膜前体细胞中抑制RB1基因而发生的，从而诱导了不受控制的细胞分裂。rb是发育肿瘤的原型，因为它发生在产前年龄到5岁。它可以显示为单侧（60％）或双侧（40％），很少像三边形（在眼睛中，大多在松果腺中）。rb的发生率大约为每年在世界上活着的约20,000名儿童（Dimaras 2012），据报道，美国和欧洲的发病率分别为每百万分之12和4.0（Fernandes等人（Fernandes等）2018; Gianni Virgili等。视网膜母细胞瘤肿瘤在50％的病例中是遗传性的，包括所有双侧病例和15-25％的单侧病例，其中大多数是非遗传性的。在遗传性RB中，第一个RB1突变是种系，第二个是躯体的，在非遗传性RB中，这两个突变都是躯体。遗传RB的百分之十是继承，而30％的“从头”出现，平均年龄为
并发组织和液体活检中的可靶向变异...
肺癌是世界各地（包括印度）死亡的重要原因（Sung et al.，2020）。临床医生面临的一个重大挑战是可用的治疗方案有限，因为大多数病例都是在晚期才被诊断出来的，这使得几乎不可能覆盖广泛的治疗方法。因此，当务之急是要找到一种有效且具体的方法来检测治疗上可行的分子靶点，以便在疾病晚期阶段获得靶向治疗的好处。由于这一事实，将组织学诊断与分子检测结合起来以识别治疗相关的生物标志物（如 EGFR、ALK、ROS1、MET、BRAF 等）几乎是必不可少的，因为这对患者具有巨大的临床和预后意义。酪氨酸激酶抑制剂等靶向疗法对遗传性患者有显著益处
表征无血浆细胞的DNA变体与肿瘤的表征
结果中有39.5％的114例患者在可报告的临床基因中至少提出了一种致病性或可能的致病性CH变体。我们发现所有BRCA2变体的79.9％是CH起源的，占CHEK2的79.4％，BRCA1的68.5％，41.9％的ATM，6.3％NRA，6.2％BRAF，2.4％KIT，2.3％KRAS，2.3％KRAS和1.8％的EGFR。对于65-69岁的患者，CH变体分类的中位数率为17％，而70-74岁的患者为29％，75-79岁的患者为33％，80岁以上的患者为50％。我们发现，在许多通常用PARP抑制剂治疗的癌症类型中，否则可吸毒靶标的CH速率很高，包括乳腺癌，女性生殖道，卵巢，胰腺，胰腺，前列腺和子宫内膜癌。
病原FMR1变体的基因检测（包括...
具有脆弱X综合征特征或脆弱X相关疾病的个体，包括：O智障人士，发育延迟或自闭症谱系障碍； o怀疑X-相关的原发性卵巢不足的40岁以下原发性卵巢不足的妇女； o具有易碎X相关震颤或共济失调综合征一致的神经系统症状的个体。具有脆弱X综合征的个人或家族史的个人正在寻求生殖咨询，包括：o具有脆弱X综合征家族史或未经诊断的智力残疾家族史的个人； o患有积极的细胞遗传学易碎X检测结果的受影响的个体或亲戚正在寻求有关载体状态的信息； o已知载体母亲的胎儿产前测试。FMR1变体的基因测试对所有其他用途进行了研究，因为没有足够的证据支持有关与此程序相关的健康结果或益处的一般结论。
biallelic Med27变体导致可变的ponto-cerebello- ...
随访17±12。4年，范围为0.1-45）。随访和迄今未报告的临床特征是从已发表的12个家庭中获得的。审查了34例病例的大脑MRI扫描。MED27相关疾病表现为一种广泛的表型连续体，从发育和癫痫性 - 动物动态性脑病到具有运动异常的可变神经发育障碍。其特征是轻度至深远的全球发育迟缓/智力残疾（100％），双侧白内障（89％），婴儿性低下（74％），小头畸形（62％），小共济失调（63％）（63％），肌张力障碍（61％），epyly epyrbly coniably coniably coniably（51％），51％（50％），limbasitions，limbasitions，limbsise，limbasitions，limbsise（50％），（50％）（50％）（50％）（50％）（50％）（50％）（50％）（50％）（50％） （38％）和成年之前的死亡（16％）。脑MRI揭示了小脑萎缩（100％），白质体积损失（76.4％），蓬蒂恩下炎（47.2％）和基底神经节萎缩，具有信号改变（44.4％）。以前未报告的39个受影响的个体有7种纯合致病MED27变体，其中5种复发。OB提供了新兴的基因型 - 表型相关性。这项研究提供了对Med27相关疾病的全面临床 - 放射学描述，建立了Geno类型 - 表型和临床 - 放射学相关性，并提出了与CER EBELLO EBELLO诊所神经变性综合症的差异诊断，以及其他'Neuro-Medopopaties'的子类型。
470000 个外显子组中罕见编码变异的分析...
先前的一项研究使用 200,000 名经过外显子组测序的英国生物银行参与者对罕见编码变异进行了基于基因的加权负荷分析，确定了三个与 2 型糖尿病 (T2D) 在外显子组范围内显著相关的基因，即 GCK 、 HNF4A 和 GIGYF1 [ 1 ]。尽管 GCK 、 HNF4A 已被公认为是年轻人成年型糖尿病 (MODY) 的病因，但 GIGYF1 的含义是新的，尽管另一项研究很快证实了这一点，该研究使用了 379,000 名英国生物银行参与者的序列数据[ 2 - 4 ]。虽然这三个基因是唯一达到全外显子组显著性的基因，但共有 32 个基因具有显著性，未校正的 p 值 < 0.001，而鉴于有 20,384 个信息基因，只有 20 个是偶然出现的。此外，从生物学的角度来看，这些基因中有许多似乎具有潜在的意义。值得注意的是，许多其他在 2 型糖尿病中发挥了明确作用的基因未能通过加权负担分析产生强有力的关联证据，这些基因包括 HNF1A 、 HNF1B 、 ABCC8 、 INSR 、 MC4R 、 SLC30A8 和 PAM 。随后，使用多种不同表型对来自同一英国生物银行队列的大量外显子组测序参与者进行了罕见变异分析，所研究的一些表型包括 2 型糖尿病和相关疾病 [ 5 , 6 ]。全套 470,000 名参与者的外显子组序列数据现已更广泛地开放，本研究在新样本中对先前研究中 p < 0.001 时显著的基因以及上面提到的其他与 2 型糖尿病有关的基因进行了加权负担分析。本研究旨在检测关联证据，并将结果与上述多重表型研究的结果进行比较，以及描述不同类别的编码变异对相关基因风险的影响。本研究的目的是使用 270,000 个新获得的外显子组来测试一些在早期研究中经过多重检验校正后结果不显著的基因是否可以提供与新样本关联的证据。此外，拥有 470,000 个更大的样本意味着可以更准确地模拟相关基因中不同类别变异对疾病风险的影响。
Z-Flipon变体揭示了Z-DNA和...
鉴于Z-DNA的作用，鉴于其染色性质仍然具有挑战性。在这里，我们对在实验鉴定的Z-DNA形成序列（Z-lipons）上训练的DNABERT变形金刚算法进行全基因组审查。该算法对现有方法产生了较大的性能增强（F1 = 0.83），并实现了计算诱变，以实现基础替代对Z-DNA形成的影响。我们表明Z- iPons富含启动子和端粒，过度扎根定量性状基因座，用于RNA表达，RNA编辑，剪接和与疾病相关的变体。我们在许多正交数据库和定义的junction基序中进行了跨估算。令人惊讶的是，我们描述的许多效果可能是通过Z-RNA形成介导的。在Scarf2，Smad1和Cacna1转录本中鉴定了共享的Z-RNA图案，而非编码RNA中存在其他基序。我们为Z-RNA折叠提供了证据，该折叠通过替代krab域锌纤维蛋白的剪接来促进适应性免疫。对OMIM和推定的GNOMAD功能丧失数据集的分析表明，Z流iPon的重叠在8.6％和2.9％的Mendelian病基因中，Mendelian疾病基因的重叠，大大扩展了映射到Z- iPons的表型的范围。
改进的 LbCas12a 变体具有改变的 PAM 特异性......
Cas12a（以前称为 Cpf1）核酸酶在基因组工程中的广泛使用受到它们需要相当长的 TTTV 原型间隔区相邻基序 (PAM) 序列的限制。在这里，我们旨在放宽这些 PAM 限制，并通过将其相应的 RR 和 RVR 变体的突变与改变的 PAM 特异性相结合，生成了在哺乳动物和植物细胞中活跃的四种 Cas12a 直系同源物的新型 PAM 突变变体。选择表现出最高活性的 LbCas12a-RVRR，使用基于质粒的测定法深入表征其在哺乳动物细胞中的 PAM 偏好。LbCas12a-RVRR 的共识 PAM 序列类似于 TNTN 基序，但也包括 TACV、TTCV CTCV 和 CCCV。经发现，改良的 LbCas12a (impLbCas12a) 中的 D156R 突变以 PAM 依赖的方式进一步提高了该变体的活性。由于 impLbCas12a 和最近报道的 enAsCas12a 变体的 PAM 偏好重叠但仍有差异，它们相互补充，为基因组编辑和转录组调节应用提供了更高的效率。