XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System亮氨酸
基于脂质聚合物混合纳米粒子的可吸入制剂，用于罗氟司特的巨噬细胞靶向递送
摘要：本文研究了针对肺巨噬细胞的新型脂质-聚合物混合纳米粒子 (LPHNPs)，将其作为罗氟司特治疗慢性阻塞性肺病 (COPD) 的潜在载体。为此，将基于聚天冬酰胺-聚己内酯接枝共聚物的载罗氟司特荧光聚合物纳米粒子与由 1,2-二棕榈酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱和 1,2-二硬脂酰-sn-甘油-磷酸乙醇胺-N-(聚乙二醇)-甘露糖制成的脂质囊泡通过两步法适当结合，成功获得载罗氟司特的混合荧光纳米粒子 (Man-LPHFNPs@Roflumilast)。它们表现出胶体大小和负 ζ 电位、50 wt % 磷脂和核-壳型形态；它们在模拟生理液体中缓慢释放被包裹的药物。表面分析还显示了它们的高表面 PEG 密度，这赋予了它们粘液穿透特性。Man-LPHFNPs@Roflumilast 对人支气管上皮细胞和巨噬细胞表现出高细胞相容性，并通过主动甘露糖介导的靶向过程被后者吸收。为了实现可吸入制剂，应用了纳米到微米的策略，通过喷雾干燥将 Man-LPHFNPs@Roflumilast 封装在聚乙烯醇/亮氨酸基微粒中。■ 简介纳米医学方法在治疗许多严重疾病方面具有不可思议的潜力，因为智能纳米结构系统能够优化生物利用度并实现各种治疗或诊断剂的靶向递送。1
ustekinumab降低了溃疡性结肠炎中循环的Th17细胞
摘要：客观T助手（Th）细胞在溃疡性结肠炎（UC）的发病机理中起着核心作用。本研究分析了通过ustekinumab（UST）的介导T细胞的变化，USTEKINUMAB（UST）是白介素12/ 23p40抗体。在UST治疗后0和8周从外周血中分离CD4 T细胞，我们通过流式细胞仪分析了CD4 T细胞的比例。在0、8和16周中获取临床信息和实验室数据。患者我们评估了13名UC患者，他们因2020年7月至2021年8月之间的诱导缓解而接受UST。结果中值部分Mayo评分从4（1-7）提高到0（0-6）（p <0.001）。在序列参数，白蛋白浓度，C反应蛋白浓度，沉积速率和富含亮氨酸的α2糖蛋白浓度中显示出明显改善的UST。对循环CD4 T细胞的流式细胞量分析表明，所有患者的UST治疗都显着降低了Th17细胞的百分比（1.85％至0.98％，p <0.0001）。Th1细胞通过UST治疗显着增加（9.52％至10.4％，p <0.05），但TH2和调节性T细胞没有显着差异。高分17亚组的部分蛋黄酱得分明显优于UST治疗后16周的低TH17亚组（0 vs. 1，p = 0.028）。用UST的结论处理降低了循环的Th17细胞，这表明这种变化可能与UC的抗炎作用有关。
通过 CRISPR-Cas9 敲除斯氏按蚊免疫基因 LRIM1 揭示了其在繁殖和媒介能力方面的意外作用
PfSPZ 疟疾疫苗由使用无菌饲养的按蚊制造的恶性疟原虫 (Pf) 子孢子 (SPZ) 组成。按蚊的免疫反应基因，例如富含亮氨酸的蛋白质 (LRIM1)，通过支持动合子的黑化和吞噬作用来抑制蚊子体内的疟原虫 SPZ 发育 (孢子生殖)。为了增加 PfSPZ 感染强度，我们通过使用 CRISPR-Cas9 进行胚胎基因组编辑，生成了 A . stephensi LRIM1 敲除系 Δ aslrim1 。Δ aslrim1 蚊子的中肠细菌负荷显著增加，微生物组组成发生改变，包括共生乙酸菌的消除。微生物组的改变导致蚊子死亡率增加，并且出乎意料地显著减少了孢子生殖。通过对蚊子进行抗生素治疗，Δ aslrim1 蚊子的存活率及其支持 PfSPZ 发育的能力得到部分恢复，而当 Δ aslrim1 蚊子在无菌条件下生产时，其存活率和支持 PfSPZ 发育的能力则完全恢复到基线。LRIM1 的缺失也会影响生殖能力：产卵、生育力和雄性生育力受到严重损害。生育力的减弱与改变的微生物组无关。这项研究表明，LRIM1 对微生物组的调控对 A . stephensi 的媒介能力和寿命有重大影响。此外，LRIM1 的缺失还发现了该基因在生育力和减少雄性精子转移方面的意外作用。
果蝇中的微生物组 - 肠脑轴对氨基酸缺陷的响应
均衡的大量营养素（蛋白质，碳水化合物和脂肪）对于生物的福祉至关重要。足够的热量摄入量，但蛋白质消耗不足会导致多种疾病，包括kwashiorkor 1。味觉受体（T1R1 -T1R3）2可以检测环境中的氨基酸，而细胞传感器（GCN2和TOR）3监测细胞中氨基酸的水平。当剥夺饮食蛋白时，动物会选择一种食物来源，其中包含更大比例的蛋白质或必需氨基酸（EAAS）4。这表明，在EAA特异性饥饿驱动的反应的帮助下，食物选择旨在实现特定的大量营养素的目标量，这是鲜为人知的。在这里，我们在果蝇中表明，微生物组 - 脑轴轴检测到EAA的不足并刺激EAAS的补偿性食欲。我们发现，在蛋白质剥夺期间，神经肽CNMAMID（CNMA）5在前肠的肠细胞中高度诱导。CNMA-CNMA受体轴的沉默阻止了被剥夺的果蝇中EAA特异性饥饿驱动的反应。此外，带有EAA共生微生物组的gnotobiotic果蝇表现出对EAAS的食欲减少。相比之下，没有产生亮氨酸或其他EAA的突变体微生物组的gnotobiotic果蝇显示出更高的CNMA表达和EAAS的补偿性食欲更大。我们提出肠道肠细胞感知饮食和微生物组衍生的EAA的水平，并通过CNMA将EAA剥夺状态传达给大脑。
诱饵受体Leeix1的基因编辑增加了宿主对Trichoderma Bio-Control的接受度
真菌和细菌病原体会引起毁灭性的疾病，并在全球范围内造成明显的番茄作物损失。由于损害环境和人类健康的化学农药，包括微生物生物控制剂（BCAS）在内的替代性疾病控制策略在农业中越来越引起人们的追求。生物控制的微生物，例如trichoderma spp。已显示可激活宿主中的全身电阻（ISR）。然而，仍然缺乏在农业环境中高度活跃的生物控制微生物的例子，这主要是由于生物控制效率的不一致，通常导致宿主所需的ISR诱导之前引起广泛的疾病。作为其植物殖民策略的一部分，Trichoderma spp。可以分泌各种化合物和分子，这可以影响宿主启动/ISR。这些分子之一合成并从几种毛d虫物种中分泌的是11二甲化酶酶，称为乙烯诱导二甲那酶Eix。eix充当特定植物物种和品种的ISR引起的。烟草和番茄品种中对EIX的反应由一个称为Leeix的单个主要基因座控制，其中包含两个受体Leeix1和Leeix2，均属于一类富含亮氨酸的重复细胞表面糖蛋白。两种受体都能够结合EIX，但是，Leeix2介导植物防御反应时，Leeix1充当诱饵受体，并减弱EIX诱导的Leeix2受体的免疫信号传导。通过使用CRISPR/CAS9突变Leeix1，在这里，我们报告了对番茄中Harzianum介导的ISR和疾病生物控制的接受能力的增强。
天然化合物Oridonin和shikonin对小胶质细胞的精选功能具有潜在的有益调节作用
摘要：积累证据表明，小胶质细胞的不良神经免疫性激活，支持神经元的脑免疫细胞，有助于包括阿尔茨海默氏病在内的一系列神经炎性疾病。纠正小胶质细胞的异常功能是这些疾病的潜在策略。核苷酸结合结构域富含亮氨酸的重复和含有吡啶结构域的受体（NLRP）3炎症体与不良的小胶质细胞活化有关及其抑制剂，例如天然化合物oridonin和shikonin，减少微胶质细胞免疫重新弹药。我们假设Oridonin和shikonin对小胶质细胞的某些有益作用独立于其对NLRP3炎症体的抑制。鼠和人类小胶质细胞样细胞，这些细菌脂多糖（LPS）不会诱导NLRP3炎症 - 某些激活或由此产生的互鲁金（IL）-1β的分泌，从而允许鉴定其他抗炎作用。在这些实验条件下，Oridonin和Shikonin均降低了一氧化氮（NO）分泌以及BV-2鼠小胶质细胞对HT-22鼠神经元细胞的细胞毒性，但上调了BV-2细胞吞噬活性。只有Oridonin抑制了刺激的BV-2小胶质细胞抑制肿瘤坏死因子（TNF）的分泌，而只有Shikonin抑制了人HL-60小胶质细胞样细胞的呼吸爆发反应。这种观察到的差异表明这些天然化合物在小胶质细胞中可能具有不同的分子靶标。总体而言，我们的结果表明，应该进一步研究Oridonin和shikonin作为能够纠正功能障碍小胶质细胞的药理学剂，从而支持其在神经炎性疾病中的潜在用途。
乌司奴单抗可减少溃疡性结肠炎中的循环 Th17 细胞
摘要：目的 T 辅助细胞 (Th) 在溃疡性结肠炎 (UC) 的发病机制中起着核心作用。本研究分析了使用白细胞介素 12/23p40 抗体乌司他丁 (UST) 后循环 T 细胞的变化。方法在 UST 治疗后 0 周和 8 周从外周血中分离 CD4 T 细胞，并通过流式细胞术分析 CD4 T 细胞的比例。在 0、8 和 16 周获取临床信息和实验室数据。患者我们评估了 2020 年 7 月至 2021 年 8 月期间接受 UST 诱导缓解的 13 名 UC 患者。结果使用 UST 后，中位部分 Mayo 评分从 4 (1-7) 提高到 0 (0-6) (p<0.001)。在血清学参数中，白蛋白浓度、C反应蛋白浓度、沉降率和富含亮氨酸的α2糖蛋白浓度在UST治疗后均显示出显著改善。循环CD4T细胞的流式细胞术分析显示，所有患者的Th17细胞百分比在UST治疗后均显著降低（1.85%至0.98%，p<0.0001）。Th1细胞在UST治疗后显著增加（9.52%至10.4%，p<0.05），但Th2和调节性T细胞没有显著差异。在UST治疗16周后，高Th17亚组的部分Mayo评分明显优于低Th17亚组（0 vs. 1，p=0.028）。结论 UST治疗会减少循环中Th17细胞，提示这种变化可能与UC的抗炎作用有关。
大米注释项目数据库（RAP-DB）更新2025我们如何维护稻米基因的最新功能信息
大米注释项目数据库（RAP-DB）已为水稻基因提供了20多年的功能注释。在过去的一年中，我们通过彻底审查相关文献手动策划和更新了有关大约700个基因座外显子内结构和功能的信息。迄今为止，我们已经为大约6,000个基因座策划了大米基因信息。值得注意的是，为了响应用户反馈，我们最近修改了1,000多个核苷酸结合亮氨酸重复的基因注释，其中包含Gottin等人报道的含有受体基因。（2021）。此外，为了提高文献策划的效率，我们将自然语言处理技术集成到了工作流程中。一个新开发的系统利用AI模型来识别包含水稻基因相关信息的出版物，从而大大加快了策展过程。以下数据和功能将在不久的将来提供。1）基于氨基酸序列的相似性和同步的模型作物（例如小麦，玉米和大豆）的直系同源基因候选基因。这些信息将可以通过每个基因页面访问，从而可以在物种之间使用农艺上重要的基因信息。2）用户反馈系统：将启动一个反馈系统，以允许用户贡献其他文献参考，功能注释或对基因结构提出的更正。这将促进社区驱动的更新，并确保RAP-DB仍然是大米基因的全面资源。我们希望这些更新将使RAP-DB成为水稻基因组学研究的用户友好和可靠的资源。请遵循我们的X帐户（@rapdbjp），我们在其中发布有关水稻相关研究的信息，RAP-DB上的更新等。
使用计算机筛选 lrrk2-wdr 域抑制剂...
计算命中查找实验 (CACHE) 挑战系列的关键评估重点是使用计算方法识别蛋白质靶标的小分子抑制剂。每个挑战包含两个阶段，即命中查找和后续优化，每个阶段之后都会对计算预测进行实验验证。对于 CACHE 挑战 #1，亮氨酸富集重复激酶 2 (LRRK2) WD40 重复 (WDR) 域被选为计算机命中查找和优化的靶标。LRRK2 突变是家族性帕金森病最常见的遗传原因。LRRK2 WDR 域是一个研究不足的药物靶标，没有已知的分子抑制剂。在此，我们详细介绍了我们在 CACHE 挑战 #1 中获胜提交的第一阶段。我们开发了一个框架，用于对化学多样性小分子空间进行高通量基于结构的虚拟筛选。使用大规模深度对接 (DD) 协议，然后进行绝对结合自由能 (ABFE) 模拟，进行命中识别。使用基于自动分子动力学 (MD) 的热力学积分 (TI) 方法计算 ABFE。使用 DD 筛选了来自 Enamine REAL 的 41 亿个配体，然后通过 MD TI 为 793 个配体计算 ABFE。76 个配体被优先考虑进行实验验证，成功合成了 59 种化合物，并确定了 5 种化合物为命中物，命中率为 8.5%。我们的结果证明了组合 DD 和 ABFE 方法对于没有先前已知命中物的目标的命中识别的有效性。该方法广泛应用于超大化学库的有效筛选以及利用现代计算资源的严格蛋白质-配体结合亲和力估计。
多功能细胞穿透肽，用于原代干细胞中的多模态 CRISPR 基因编辑
CRISPR 基因编辑提供了前所未有的基因组和转录组控制，可精确调节细胞功能和表型。然而，将必要的 CRISPR 成分递送至治疗相关的细胞类型且不产生细胞毒性或意外副作用仍然具有挑战性。病毒载体存在基因组整合和免疫原性的风险，而非病毒递送系统难以适应不同的 CRISPR 载体，而且许多系统具有高度的细胞毒性。精氨酸-丙氨酸-亮氨酸-丙氨酸 (RALA) 细胞穿透肽是一种两亲性肽，它通过与带负电荷的分子的静电相互作用自组装成纳米颗粒，然后将它们递送到细胞膜上。与其他非病毒方法相比，该系统已用于将 DNA、RNA 和小阴离子分子递送至原代细胞，且细胞毒性较低。鉴于 RALA 的低细胞毒性、多功能性和有竞争力的转染率，我们旨在将这种肽建立为一种新的 CRISPR 递送系统，适用于各种分子格式，适用于不同的编辑模式。我们报告称，RALA 能够有效地封装 DNA、RNA 和核糖核酸蛋白 (RNP) 格式的 CRISPR 并将其递送至原代间充质干细胞 (MSC)。RALA 与市售试剂之间的比较表明，其细胞活力更佳，可导致更多的转染细胞并维持细胞增殖能力。然后，我们使用 RALA 肽将报告基因敲入和敲除到 MSC 基因组中，以及转录激活治疗相关基因。总之，我们将 RALA 确立为一种强大的工具，可以更安全有效地以多种货物格式递送 CRISPR 机制，用于广泛的基因编辑策略。