1. 引言 为了更详细地了解基因多态性及其意义,有必要定义叶酸-蛋氨酸循环和甲基化的概念。叶酸-蛋氨酸循环是确保体内甲基化所必需的。甲基化是向物质中添加甲基以激活它们。甲基化是一个非常重要的过程,它影响基因表达(活性)、解毒-激活肝脏解毒的II期、维持能量代谢、提供膜结构、髓鞘、乙酰胆碱代谢、免疫调节、神经递质代谢-合成多巴胺、血清素、去甲肾上腺素、乙酰胆碱;褪黑激素的合成、衰老(“表观遗传时钟”-DNA甲基化越少,衰老越快),确保各种基因的开启和关闭、DNA分子的复制(加倍)、DNA修复和重组、蛋白质生物合成、DNA分子的保护和恢复。甲基化是清除体内毒素的关键方法。完善的甲基化过程使毒素和重金属更容易被清除,从而降低患癌症的风险。与异常甲基化有关的一些疾病包括:心血管疾病、骨质疏松症、糖尿病、行为障碍、早产、宫颈癌、肠癌和肺癌。甲基化还负责通过控制同型半胱氨酸水平来调节炎症过程。在甲基化障碍的情况下,血液中的同型半胱氨酸水平会升高,从而增加患心血管疾病的风险。甲基化是将甲基基团附着到某些分子上以激活它们的过程。首先,一种非常重要的氨基酸——蛋氨酸进入人体时会
映射人蛋白质组中所有蛋白质的可辅助性或潜在的可药用性是基于质谱的共价化学蛋白质组学的核心目标。实现这一雄心勃勃的目标需要高吞吐量和高覆盖样品制备以及液相色谱串联质谱分析,以进行数百至数千种反应性化合物和化学探针。在此规模上进行化学蛋白质组学筛选从实现增加样品吞吐量的技术创新中有益。在这里,我们通过建立用于同位素标记的蛋白质组学串联质量标签(SCIP-TMT)蛋白质组学平台的基于硅烷的可切合连接器来实现这种愿景,该平台通过早期样品池的区别,从而增加样品制备吞吐量。SCIP-TMT配对一种自定义兼容的SCIP捕获试剂,该试剂易于使用市售的TMT试剂以高产量功能化。一组SCIP-TMT的合成和基准测试显示样品制备时间的大幅度减少,高覆盖范围和高精度定量。通过筛选一组聚焦的四个半胱氨酸反应性电力,我们证明了SCIP-TMT对化学蛋白质组靶狩猎的实用性,从而确定了789个总配体半胱氨酸。以其与已建立的富集和量化协议的兼容性区分,我们预计SCIP-TMT很容易转化为广泛的共价化学蛋白质组应用。
这些变化可能包括改变酶活性,氧化应激,炎症和细胞损伤。ZnO-NP已显示可诱导活性氧(ROS)产生,引起肾脏和肝脏的氧化应激和细胞的破坏(Hussain等,2016; Wang等,2017; Moatamed et al。In the kidney, exposure to ZnO-NPs has been (Hussain et al., 2016; Wang et al., 2017; Moatamed et al., 2019; Khan et al., 2020; Pei et al., 2023 ), linked to nephrotoxicity, which can manifest as impaired renal function, glomerular damage, tubular injury, and inflammation.在肝脏中,ZnO-NP暴露与肝毒性有关,其特征是肝炎,氧化应激,脂质过氧化和肝细胞损伤。Vitamin C和N-乙酰半胱氨酸是自然存在的化合物,以众多的水果,蔬菜和草药为生,以其抗炎特性以及抵消由多种剂所引起的毒性而闻名,由重金属,农药和纳米粒子(例如Ay et ay et ay等)。鉴于ZnO-NP对肾脏和肝脏健康的潜在有害影响,探索潜在的保护性干预措施至关重要(Hashim等,2022; Ali等,2024)。有限的发现重点是评估NAC和维生素C对ZnO-NP诱导的肾脏和肝毒性的保护作用。因此,本研究的目的是找出N-乙酰半胱氨酸和维生素C对锌 - 氧化物纳米颗粒诱导雄性Wistar大鼠的肝肾毒性的改善作用
糖尿病性肾病(DN)是2型糖尿病(DM2)的主要微型病变并发症。这是慢性肾脏疾病(CKD)和肾衰竭的主要原因。糖尿病患者在保加利亚和欧洲的所有透析患者中有25%至45%。需要透析的一组糖尿病患者是最大的。许多研究提到了CKD发展之前的不同生物标志物的使用。这样的生物标志物是:用于遗传,血清,管状血管 - 内皮功能障碍的生物标志物。[1-5]甲基化二氢叶酸还原酶(MTHFR)是一种酶,可将转化为5-甲基二酸 - 水叶酸盐cosubstrate,以使同型半胱氨酸对甲氨酸的甲基化。[6] MTHFR基因位于1p 36.3染色体中。MTHFR的基因多态性,C677T(rs1801133),外显子4中核苷酸677的C→T转变是MTHFR的常见基因变体。MTHFR基因的多态性最常见的变化是mthfr c677c = normal mthfr Gene,mthfr c677t =杂合muttation,mthfr t677t =纯合突变。这些遗传多态性可以扮演限制MTHFR酶产生的“缺陷”的作用。这种转变导致氨基酸丙氨酸变成瓣膜。结果是MTHFR的热图变体,具有催化活性,可以通过叶酸稳定。MTHFR T677T纯合突变降低了50%的酶活性,是家族性中度高层结构血症的最常见原因。这种聚合物决定了酶的催化结构域和热质蛋白的形成。同型半胱氨酸在必需氨基酸和蛋氨酸的代谢中起关键作用。升高的同型半胱氨酸水平被确定为DM2中DN的危险因素。根据Moczulski等人的说法,677期多态性是DM2男性DN的危险因素。根据日本研究人员进行的研究,他们在血液透析上的CT和TT基因型率高于DM2的男性和DM2的CT和TT基因型,这与存在与存在的DM2和DN的DN相关。[7] Chen等。[8],总结了几个基于13项含有891人的研究的荟萃分析(894个患有二磷肾病的人和糖尿病的糖尿病和1261个),评估MTHFR C677T多态性和2型糖尿病的MTHFR C677T多态性和/或二氧化碳的关联。他们发现667T等位基因与糖尿病性肾病具有显着关系
K-Ras 是人类癌症中最常见的突变致癌基因,但直到最近,直接针对 K-Ras 突变体的小分子靶向治疗大多未取得成功。在 Switch-II 下发现具有共价半胱氨酸交联分子的变构口袋,这为开发靶向疗法提供了可能,这种疗法可以选择性地与 K-Ras(G12C) 突变中反应性极强的获得性半胱氨酸结合,而不会影响野生型蛋白质。Sotorasib 和 adagrasib 是两种先进的 Switch-II Pocket 抑制剂,已获得 FDA 批准用于治疗 K-Ras(G12C) 驱动的非小细胞肺癌。然而,最常见的 K-Ras 突变 G12D(尤其常见于胰腺导管腺癌)由于体细胞天冬氨酸残基的亲核性较差,因此共价药物无法靶向该突变。这里我们介绍了一组基于马来酸内酯的亲电试剂,它们利用环张力将 K-Ras(G12D) 与突变天冬氨酸交联,形成稳定的共价复合物。通过 X 射线晶体学的结构洞察和对亲电试剂攻击的立体电子要求的利用,开发出了一种取代的马来酸内酯,它能抵抗水性缓冲液的攻击,但能与 GDP 和 GTP 状态下的 K-Ras 的天冬氨酸-12 迅速交联。信号传导能力强的 GTP 状态靶向可以有效抑制下游信号传导和携带 K-Ras(G12D) 突变的癌细胞的增殖,以及小鼠细胞系衍生异种移植瘤的肿瘤生长。我们的研究结果表明,共价抑制剂的设计合理,可以靶向 K-Ras(G12D) 中非催化羧酸侧链,而这种侧链一直受到传统药物发现工作的阻碍。
摘要:半胱氨酸在植物的硫代谢网络中起关键作用,密切影响有机硫的转化率以及植物承受非生物胁迫的能力。在茶厂中,丝氨酸乙酰转移酶(SAT)基因出现是半胱氨酸代谢的关键调节剂,尽管显然缺乏全面的研究。利用隐藏的马尔可夫模型,我们确定了茶叶基因组中的七个CSSSAT基因。生物信息学分析的结果表明,这些基因的平均分子量为33.22 kd,簇分为三个不同的组。关于基因结构,CSSSAT1在十个外显子中脱颖而出,比其家庭成员高得多。在启动子区域中,与环境反应性和激素诱导相关的顺式作用元素占主导地位,分别占34.4%和53.1%。转录组数据显示,在各种应力条件下(例如PEG,NaCl,Cold,Meja)及其在茶厂中的组织特异性表达模式,CSSSAT的复杂表达动力学。值得注意的是,QRT-PCR分析表明,在盐应力下,CSSSAT1和CSSSAT3表达水平显着增加,而CSSSAT2表现出下调趋势。此外,我们克隆了CSSSAT1 -CSSSAT3基因,并构造了相应的原核表达载体。产生的重组蛋白在诱导后显着增强了大肠杆菌BL21的NaCl耐受性,这表明CSSSATS潜在的应用在增强植物抗性抗性的抗性中。这些发现丰富了我们对CSSSATS基因在压力耐受性机制中扮演的多方面角色的理解,为未来的科学努力和研究追求奠定了理论基础。
产品的窗口,如多项研究所示。2 - 12中的ADCELD,现场特定类型的所有类型的技术,如今已统治了进入临床试验的新ADC。然而,比较产生相同代谢物的同质和杂质ADC的免疫原的最新工作表明,特定部位的技术可能并不总是会增强该药物的小脂肪动物,并且也可能有害地改变其毒性。13 - 15实际上,几个标准,例如有效载荷的性质,链接器,结合化学,药物抗体比(DAR),ADC的疏水性可能会影响结合物的体内特性,这是在很快被预测的。即将进行的现场特定准备的ADC的大量临床研究可能有助于阐明是否存在单一的共轭化学物质会广泛使用,或者其他方法是否也适用。 因此,开发各种技术是为了进一步进步而有意义的。 由于大量暴露于溶剂的亲核氨基酸,尤其是赖氨酸,与抗体结合的位点可能具有挑战性。 尽管很困难,但通过开发多种技术,可以将其总结为工程性半胱氨酸,disul de 。即将进行的现场特定准备的ADC的大量临床研究可能有助于阐明是否存在单一的共轭化学物质会广泛使用,或者其他方法是否也适用。因此,开发各种技术是为了进一步进步而有意义的。与抗体结合的位点可能具有挑战性。尽管很困难,但通过开发多种技术,可以将其总结为工程性半胱氨酸,disul de
摘要:由于表面暴露的赖氨酸的固有反应性低且在整个蛋白质组中普遍存在,因此对其进行靶向共价修饰具有挑战性。优化可逆结合抑制剂 ( k inact ) 共价键形成速率的策略通常涉及提高亲电试剂的反应性,这会增加离靶修饰的风险。在这里,我们采用了一种替代方法来提高赖氨酸靶向共价 Hsp90 抑制剂的 k inact ,而不依赖于可逆结合亲电性 ( K i ) 或固有亲电性。从非共价配体开始,我们附加了一个手性、构象受限的连接体,它使芳基磺酰氟与 Hsp90 表面的 Lys58 快速且对映选择性地发生反应。共价和非共价配体/Hsp90 复合物的生化实验和高分辨率晶体结构提供了有关配体构象在观察到的对映选择性中的作用的机制见解。最后,我们展示了细胞 Hsp90 的选择性共价靶向,尽管共价配体/Hsp90 复合物同时降解,但仍会导致热休克反应延长。我们的工作突出了设计配体构象约束的潜力,可以大大加速蛋白质靶标表面远端、亲核性较差的赖氨酸的共价修饰。■ 简介共价抑制剂作为药物、细胞生物学工具和化学蛋白质组学探针具有广泛的用途。不可逆的共价修饰导致药物-靶标停留时间与靶蛋白的寿命相匹配,通常与药物清除率无关。 1、2 此外,共价抑制剂可以通过与配体结合位点内或附近的非保守亲核氨基酸反应来区分密切相关的旁系同源物。3 − 8 目标亲核试剂的选择性修饰由两步反应机制决定,其中配体的可逆结合先于共价修饰。可逆结合亲和力和最初形成的非共价复合物内共价键形成的速率 ( k inact ) 都会影响共价抑制剂的效力。9 增加 k inact 的一个明显方法是增强亲电试剂的固有反应性。这种方法的缺点是它增加了发生不良的脱靶反应的可能性。因此,共价抑制剂的优化主要依赖于最大化非共价识别元素的可逆结合亲和力。 10,11 迄今为止,快速作用、高选择性共价配体的设计主要集中在半胱氨酸上,部分原因是其高内在反应性允许使用相对不活泼的亲电试剂(例如丙烯酰胺)。12 − 14 然而,半胱氨酸是蛋白质组中最不常见的氨基酸之一,许多配体结合位点缺乏近端半胱氨酸。
先兆子痫之前看到的生化和生理变化包括高同型半胱氨酸水平,甘油三酸酯升高和LDL胆固醇水平。先兆子痫的妇女在怀孕前似乎处于氧化应激状态,然后因怀孕而加剧。这些女性通常有其他患心血管和/或肾脏疾病的危险因素,并且在以后的生活中面临这些问题的高风险。这些危险因素包括肥胖,高甘油三酸酯,预先存在的高血压,胰岛素抵抗,糖尿病和代谢综合征。一次怀孕高血压的妇女在另一次怀孕中患高血压的风险更高。
大蒜素(diallthiosulfinate)是一种有效的抗菌物质,是由大蒜组织在损伤中产生的,作为防御病原体和害虫的防御。大蒜素是一种反应性硫种(RSS),可氧化谷胱甘肽和蛋白质中的可及性半胱氨酸。我们使用了差异同位素标记方法(OXIXAT)来鉴定细菌蛋白质组中的大shic氏靶标。我们比较了大鼠素荧光症的蛋白质组织PF 0-1和丙酸s耐鼠素暴露后的PF AR-1。在暴露于大蒜素之前,蛋白质主要降低,其中约77%的蛋白质表现出小于20%的半胱氨酸氧化。蛋白氧化在暴露于大蒜素后增加,仅来自大蒜素敏感的PF 0-1的蛋白质中只有50%,但来自大丙酸酯耐受性PF AR-1的蛋白质仍低于20%的氧化。DNA回旋酶被鉴定为大蒜素靶标。Cys 433大约6%。在大蒜素处理后,易感PF 0-1的CYS 433氧化程度增加到55%,但在耐受性PF AR-1中仅增加至10%。大蒜素在体外抑制了大肠杆菌DNA旋转酶的活性,其浓度与纳利迪酸相同的浓度范围。纯化的PF AR-1 DNA回旋酶在体外抑制比PF 0-1酶更大程度地抑制。将PF AR-1 Gyra替换为PF 0-1,使交换突变体比PF 0-1野生型更容易受到大种呼吸的影响。在一起,这些结果表明,在耐大slic蛋白耐sap的PF AR-1背景中,GYRA免受体内的氧化保护,而不是PF AR-1 Gyra亚基本质上比PF 0-1 gyra subunit在本质上易于抗原氧化。DNA回旋酶是药物重要的抗生素的靶标。因此,大蒜素及其类似物可能具有单独或与其他治疗剂结合的旋酶抑制剂的潜力。