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核苷酸还原酶，淋病的新型药物靶点
摘要 由于耐多药 (MDR) 菌的数量不断增加，抗生素耐药性淋病奈瑟菌 (Ng) 正成为一种新出现的公共卫生威胁。我们发现了两种新型口服抑制剂 PTC-847 和 PTC-672，它们对 Ng 包括 MDR 分离株表现出较窄的活性谱。通过筛选对新型抑制剂有耐药性的菌并对其基因组进行测序，我们确定了一个新的治疗靶点——Ia 类核苷酸还原酶 (RNR)。Ng 中的耐药突变位于 α 亚基的 N 端锥体结构域，我们在此显示在 β 亚基和变构效应物 dATP 存在的情况下，该结构域参与形成受抑制的 α 4 β 4 状态。酶测定证实 PTC-847 和 PTC-672 抑制 Ng RNR，并揭示变构效应物 dATP 增强了抑制作用。口服 PTC-672 可以减少小鼠模型中的 Ng 感染，并且可能对治疗对当前药物有耐药性的 Ng 具有治疗潜力。
利用分子对接和分子动力学研究释放已批准药物对原肌球蛋白受体激酶 A 变构抑制的潜力
1 苏丹杰济拉大学药学院药物化学系，2 苏丹杰济拉大学药学院药剂学系，3 苏丹喀土穆大学药学院药物化学系，4 沙特阿拉伯阿尔哈吉 Prince Sattam Bin Abdulaziz 大学药学院生药学系，5 苏丹喀土穆大学药学院生药学系，6 埃及曼苏拉曼苏拉大学药学院生药学系，7 沙特阿拉伯麦加乌姆古拉大学药学院临床药学系，8 沙特阿拉伯麦地那 Al-Munawwarah 泰巴大学药学院药理学与毒理学系阿拉伯、9 沙特阿拉伯麦地那泰巴大学药学院药剂学和制药技术系、10 沙特阿拉伯吉达巴特吉医学院化学系预科课程、11 埃及艾斯尤特大学药学院生药学系、12 沙特阿拉伯吉达阿卜杜勒阿齐兹国王大学药学院天然产物和替代医学系
1 Sanofi Research，Vitry-Sur-Seine，法国2 Sanofi Research，美国剑桥，RA123，一种新的GLS1变构抑制剂显示在体外和体内
针对RPMI8226异种移植模型的方案。 3和10mg/kg剂量似乎耐受性良好，而不会影响肿瘤体重。 20mg/kg的剂量诱导了适度的体重减轻，可以通过补充软食物凝胶来逆转。 •RA123的20mpk bid剂量导致几乎肿瘤停滞针对RPMI8226异种移植模型的方案。3和10mg/kg剂量似乎耐受性良好，而不会影响肿瘤体重。20mg/kg的剂量诱导了适度的体重减轻，可以通过补充软食物凝胶来逆转。•RA123的20mpk bid剂量导致几乎肿瘤停滞
使用功能优先的“侦察片”
摘要：分类为六个超家族的解旋酶是利用从ATP水解到重塑DNA和RNA底物的能量的机械酶。这些酶在各种细胞过程中具有关键作用，例如翻译，核糖体组装和基因组维持。解旋酶，并且许多病毒表达的旋转酶是其致病性所必需的。因此，解旋酶是化学探针和治疗剂的重要靶标。但是，开发针对构象动力学高构酶的化学抑制剂的化学抑制剂非常具有挑战性。我们认为，在化学蛋白质组学研究中使用的电力“侦察片段”可以利用用于开发共价抑制剂的解旋酶的抑制剂。我们采用了一种功能优先的方法，将酶试验与对映体探针对和质谱分析相结合，以开发一种共价抑制剂，该抑制剂有选择地靶向SARS-COV-2 NSP13中的变构位点，一种超级家庭-1解旋酶。此外，我们证明了侦察片片段抑制了与基因组维持有关的两个人类超家族酶BLM和WRN的活性。一起，我们的发现提出了一种发现在构象动态机械酶中发现共价抑制剂起点和可药物变构位点的方法。
探索肾脏丙酮酸代谢作为糖尿病肾损伤的治疗途径
急性肾损伤 (AKI) 涉及肾功能的突然恶化，包括糖尿病在内的多种情况已被确定为危险因素。尽管 AKI 通常会导致死亡，但对其详细机制的了解不足阻碍了有效治疗方法的开发。在 AKI 期间，会发生缺血-再灌注 (IR) 损伤以及随后的活性氧 (ROS) 增加和炎症，并且被认为起着关键作用 [1]。线粒体会产生大量的 ROS，其功能障碍会导致多种代谢紊乱。线粒体是产生细胞能量的主要细胞器，而丙酮酸代谢是线粒体中的关键事件。丙酮酸由细胞质中的糖酵解产生，在有氧条件下，在线粒体中进一步代谢为三磷酸腺苷 (ATP)。在此过程中，丙酮酸转化为乙酰辅酶 A (CoA)，后者可用于生成 ATP 或游离脂肪酸。丙酮酸脱氢酶 (PDH) 复合物介导丙酮酸转化为乙酰辅酶 A，该过程受到 ATP、乙酰辅酶 A 和 NADH（烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 [NAD]+ 氢 [H]）的变构抑制，以及丙酮酸脱氢酶激酶 (PDK1-4) 对 PDH 的磷酸化抑制。相反，腺苷单磷酸、CoA 和 NAD + 变构增加 PDH 活性，丙酮酸脱氢酶磷酸酶 (PDP1 和 PDP2) 对 PDH 的去磷酸化也增加 PDH 活性 [2,3]。韩国庆北国立大学 In-Kyu Lee 团队最近开展的研究表明，丙酮酸脱氢酶
计算酶模型的观点
摘要：了解酶机制对于揭示复杂的生命分子机制至关重要。在这篇综述中，我们概述了计算酶学领域，重点介绍了控制酶机制的关键原理，并讨论了当前面临的挑战和有希望的进展。多年来，计算机模拟已成为酶机制研究中不可或缺的一部分，实验和计算探索的结合现已成为深入了解酶催化的整体方法。许多研究已经证明了计算机模拟在表征各种酶的反应途径、过渡态、底物选择性、产物分布和动态构象变化方面的强大功能。然而，在研究复杂的多步反应、大规模构象变化和变构调节的机制方面仍然存在重大挑战。除了机制研究之外，计算酶建模已成为计算机辅助酶设计和合理发现用于靶向治疗的共价药物的重要工具。总体而言，酶设计/工程和共价药物开发可以从我们对酶详细机制的理解中受益匪浅，例如计算研究揭示的蛋白质动力学、熵贡献和变构效应。预计这种不同研究方法的融合将继续下去，在酶研究中产生协同效应。本综述通过概述不断扩展的酶研究领域，旨在为未来的研究方向提供指导，并促进这一重要且不断发展的领域的新发展。■ 简介
鉴定一种新型变构口服 CBL-B 抑制剂，该抑制剂可在体内和体外增强 T 细胞反应并增强 NK 细胞杀伤力
这里我们报告了我们的主要抑制剂系列中的一种，一种通过应用我们的 Smart AllosteryTM 平台识别的具有皮摩尔结合亲和力的低纳摩尔强效抑制剂。该抑制剂与 CBL-B 的非活性形式结合，其在识别的热点中的结合模式由共晶体结构证实。它抑制激酶对 CBL-B 的磷酸化，抑制 CBL-B 的 E3 连接酶活性，促进细胞因子释放并增强 T 细胞增殖以及 NK 细胞活化和杀伤。在体内，我们的 CBL-B 抑制剂有效增强了抗 CD3 治疗小鼠的 T 细胞反应。我们在此通过预测和用药重要免疫肿瘤学靶点上的调控热点，证明了我们专有的 Smart Allostery™ 平台的验证，而该靶点迄今为止很难用药。
JAB-3312，一种有效的变构 SHP2 抑制剂，可增强 KRAS G12C 抑制剂 Glecirasib 的疗效 王鹏 1 ，康迪 1 ，孙鑫 1 ，魏杰
图 3 A. 用格列西拉西、JAB-3312 或二者联合处理 SW837 细胞 2 小时后，p-ERK 的蛋白质印迹分析。B. 格列西拉西与 JAB-3312 联合用于携带 KRAS G12C 突变的一组 CDX 和 PDX 模型的体内疗效。JAB-3312：SW837 和 MIA PaCa-2 中为 0.5 mg/kg；CR6243、CR6256 和 LU6405 中为 1 mg/kg。格列西拉西：MIA PaCa-2 中为 3 mg/kg；SW837 中为 10 mg/kg；CR6243、CR6256 和 LU6405 中为 100 mg/kg。联合用药中，JAB-3312 剂量为 0.5 mg/kg，格列西拉西与单药剂量相同。 C. 在 LU6405 异种移植中，绘制了肿瘤生长随治疗时间的变化。D. 在 LU6405 异种移植中，分别通过 IHC 和 qPCR 评估 41 天联合治疗后 FFPE 组织的 p-ERK 水平和 DUSP6 mRNA 表达。E. 显示了代表性 IHC 图像（放大 200 倍）。显示了平均肿瘤体积 ±SEM。
15 I. 多项选择题。（70 分；每题 3 分）
A. 糖异生使用相同的糖酵解酶，除了开始时的两种酶外，这两种酶用于绕过放能丙酮酸激酶反应并合成 PEP。B. 糖异生调节使用变构效应物 Fru 1,6P 2 ，而糖酵解受效应物 Fru 2,6P2 调节。C. 丙酮酸羧化酶固定 CO 2 的方式与 rubisco 大致相同。D. 由于糖酵解和糖异生都只涉及细胞溶胶中的酶，因此必须对其进行协调调节。E. 果糖二磷酸酶步骤的放能性质对于帮助整个糖异生途径有利非常重要。