摘要:了解酶机制对于揭示复杂的生命分子机制至关重要。在这篇综述中,我们概述了计算酶学领域,重点介绍了控制酶机制的关键原理,并讨论了当前面临的挑战和有希望的进展。多年来,计算机模拟已成为酶机制研究中不可或缺的一部分,实验和计算探索的结合现已成为深入了解酶催化的整体方法。许多研究已经证明了计算机模拟在表征各种酶的反应途径、过渡态、底物选择性、产物分布和动态构象变化方面的强大功能。然而,在研究复杂的多步反应、大规模构象变化和变构调节的机制方面仍然存在重大挑战。除了机制研究之外,计算酶建模已成为计算机辅助酶设计和合理发现用于靶向治疗的共价药物的重要工具。总体而言,酶设计/工程和共价药物开发可以从我们对酶详细机制的理解中受益匪浅,例如计算研究揭示的蛋白质动力学、熵贡献和变构效应。预计这种不同研究方法的融合将继续下去,在酶研究中产生协同效应。本综述通过概述不断扩展的酶研究领域,旨在为未来的研究方向提供指导,并促进这一重要且不断发展的领域的新发展。■ 简介
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