尽管迄今为止已描述了数百种 RNA 修饰,但只有 RNA 编辑会导致 RNA 分子的核苷酸序列与基因组相比发生变化。在哺乳动物中,迄今为止已描述了两种 RNA 编辑,即腺苷到肌苷 (A-to-I) 编辑和胞苷到尿苷 (C-to-U) 编辑。RNA 测序技术的最新改进导致发现越来越多的编辑位点。这些方法功能强大但并非没有错误,因此必须对新描述的编辑位点进行常规验证。在对 DDX58 mRNA 进行其中一次验证时,除了 A-to-I RNA 编辑位点外,我们还遇到了假定的 U-to-C 编辑。这些 U-to-C 编辑存在于几种细胞系中,并且似乎受到特定环境刺激的调节。在人类长基因间非编码 RNA p21 (hLincRNA- p21) 中也观察到了同样的发现。更深入的分析表明,假定的 U-to-C 编辑是由从相同基因座转录的重叠反义 RNA 上的 A-to-I 编辑引起的。此类编辑事件发生在以相反方向转录的重叠基因上,最近已被证明具有免疫原性,并与自身免疫和免疫相关疾病有关。我们的发现也得到了深度转录组数据的证实,表明此类基因座可以通过同一基因座内 A-to-I 和 U-to-C 错配的存在来识别,在正义转录本和顺式天然反义转录本 (cis-NAT) 中都存在反射性 A-to-I 编辑,这意味着此类簇可能是功能相关的 ADAR1 编辑事件的标志。
Ritesh Haldar,Hongye Chen,Antoine Mazel,Dong-Hui Chen,Gaurav Gupta等人。天线:实现晶体化的伪装性果皮中实现良好的光波长转化的关键。高级材料界面,2021,8(10),pp.2100262。10.1002/admi.202100262。hal-03384232
hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
CHD3 33 中的新生变异和遗传变异。CHD3 蛋白中几处基因突变位置的示意图(图 1a)。使用上海交通大学医学院新华医院获得的一名 SNIBCPS 儿童及其未受影响的父母的基因组 DNA 进行全外显子组测序,我们在 CHD3 基因中发现了一个新生 SNV(c.C3073T,NM_001005271.3;p.R1025W,NP_001005271.2),并使用 Sanger 测序进行了验证(图 1b)。新生变异引起的氨基酸变化(R1025W)位于 CHD3 蛋白的解旋酶 ATP 结合结构域和解旋酶 C 末端结构域之间(图 1a)。 gnomAD 数据库 (http://gnomad.broadinstitute.org) 中的数据表明,该变异 (CHD3,17号染色体:7803967) 在东亚人群中不存在,这表明它是一种罕见变异。
1 苏黎世大学药理学和毒理学研究所,瑞士苏黎世。2 Acuitas Therapeutics Inc.,加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华。3 Oncode 研究所,马克西玛公主儿科肿瘤中心,荷兰乌得勒支。4 苏黎世功能基因组学中心,苏黎世联邦理工学院/苏黎世大学,瑞士苏黎世。5 苏黎世联邦理工学院分子健康科学研究所生物系,瑞士苏黎世。6 苏黎世大学医院和大学病理学和分子病理学系,瑞士苏黎世。7 苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系,瑞士苏黎世。8 Synthego Corporation,美国加利福尼亚州雷德伍德城。9 苏黎世大学生物化学系,瑞士苏黎世。10 苏黎世联邦理工学院基因组工程与测量实验室,瑞士苏黎世。 11 宾夕法尼亚大学医学系,美国宾夕法尼亚州费城。12 苏黎世大学儿童医院代谢与儿童研究中心分部,瑞士苏黎世。13 苏黎世综合人体生理学中心,瑞士苏黎世。14 苏黎世神经科学中心,瑞士苏黎世。15 苏黎世大学分子生命科学研究所,瑞士苏黎世。✉ 电子邮件:ssemple@acuitastx.com;schwank@pharma.uzh.ch
1 法国巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所染色质和发育过程中基因调控实验室;2 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗临床研究中心;3 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所人类淋巴造血实验室;4 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗系;5 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所生物信息学平台;6 意大利米兰圣拉斐尔科学研究所 (IRCCS) 里维埃拉与克拉特雷松基因治疗研究所 (SR-TIGET); 7 生命健康圣拉斐尔大学,米兰,意大利
摘要 虽然斑马鱼正在成为研究人类疾病的新模型系统,但仍然缺乏高效产生精确点突变的有效方法。在这里,我们展示了碱基编辑器可以高效地产生 C 到 T 的点突变,而不会产生其他不必要的靶向突变。此外,我们建立了一种识别 NAA 原型间隔区相邻基序的新编辑器变体,扩展了斑马鱼的碱基编辑可能性。利用这些方法,我们首先在 ctnnb1 基因中产生了碱基变化,模仿已知会导致内源性 Wnt 信号组成性激活的人类基因致癌突变。此外,我们精确靶向了包括 cbl 在内的几种癌症相关基因。利用最后一个目标,我们创建了一种新的斑马鱼侏儒症模型。我们的研究结果共同扩展了斑马鱼作为模型系统的潜力,为内源性调节细胞信号通路和生成人类遗传疾病相关突变的精确模型提供了新方法。
协调化学的演变受到Schiff碱基的极大影响,Schiff碱是一个很容易与大多数过渡金属形成稳定复合物的家族。众所周知,随着金属络合物的增加,某些药物的消耗会提高其功效1。有趣的是,研究表明某些金属螯合物可能会预防肿瘤发育2。除了它们在有机合成和催化中的重要功能外,据报道,Schiff碱配体的金属络合物具有广泛的工业,生物学,治疗性,分析性和其他用途3-7。Schiff倒数金属络合物由3-羟基苯甲酰呋喃-2-甲醛制成,具有特定方式破坏DNA的能力。Furan衍生物的有效抗菌特性是众所周知的。此外,含有杂环分子的Schiff碱金属络合物具有药物承诺为10,11。因此,一个共同的问题是新的Schiff基础和相关复合物的合成12。制备化学也依赖于知道物质的质子化常数13。此外,新合成化合物的质子化也可以提供有关其结构14的支持性信息。如果理论上计算的质子化常数符合实验值,则建议的结构可能是正确的15-17。
本研究报告了一种前所未有的现象,具有相似结构的水溶性聚合物混合物(注 10)通过两个连续的 LLPS 事件以同心模式分离,即液相中的第一个 LLPS 和固液界面处的第二个 LLPS(图 2,顶部)。这种有趣的分离是通过使用高浓度的高离子强度盐(例如硫酸铵)实现的。 硫酸铵因其对水溶性生物聚合物的有效和非破坏性的盐析而闻名。研究小组在研究分子量(MW)为5,000Da的染料封端PEG存在下蛋白质的盐析行为时发现了PEG的同心分离现象。一般来说,蛋白质很难盐析,因此本实验采用了高浓度的硫酸铵。将此溶液滴到玻璃板上,用共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)观察时,发现了意想不到的现象:玻璃表面形成了无数发出黄绿色荧光的环。
糖原累积病 Ia 型 (GSD-Ia) 患者缺乏葡萄糖-6-磷酸酶-α (G6Pase-α 或 G6PC),表现为葡萄糖稳态受损,并伴有标志性的空腹低血糖症。我们生成了人源化敲入小鼠模型 huR83C,该模型对致病性 G6PC-R83C 变异体为纯合子,并表现出 GSD-Ia 表型。我们评估了 BEAM-301(含有指导 RNA 和编码新设计的腺嘌呤碱基编辑器的 mRNA 的脂质纳米颗粒)在 huR83C 小鼠中纠正 G6PC-R83C 变异体的功效,并监测了一年的表型纠正情况。接受 BEAM-301 治疗的小鼠在肝脏中表现出最大碱基编辑效率 ~60%,并且仅以 ~10% 的碱基编辑率达到肝脏 G6Pase-α 活性的生理水平。经过编辑的小鼠表现出了改善的代谢表型,能够持续 24 小时禁食,并能长期存活。相比之下,未经治疗的小鼠则表现出禁食低血糖症并过早死亡。碱基编辑在 huR83C 小鼠中具有持久的药理学效果,支持开发 BEAM-301 作为携带 G6PC-R83C 变体的 GSD-Ia 患者的潜在治疗方法。