XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System糖基化
flap核酸内切酶1通过ADP-核糖基化Yilun Sun 1*，Lisa M. Jenkins 2，Lara H. El Touny 3，Ukhyun Jo 1，Xi Yan
抽象的DNA-蛋白交联（DPC）是最普遍和有害的DNA病变之一，是由于暴露于代谢应激，药物或交联药物（如甲醛（FA））而引起的。fa是甲醇代谢，组蛋白脱甲基化，脂质过氧化和环境污染物的细胞副产品。无法修复FA诱导的DPC几乎所有基于染色质的过程，包括复制和转录，导致免疫缺陷，神经变性和癌症。然而，它在很大程度上仍然未知细胞如何维修DPC。由于缺乏鉴定DPC的技术，我们不理解FA的蛋白质类型会阻碍DPC修复的研究。在这里，我们通过将氯化葡萄球菌差异超速离心与HPLC-MAS-MAS光谱法（MS）耦合，从而设计了一种新型的生物测定法，以介绍FA诱导的DPC。使用该方法，我们揭示了FA诱导的人类细胞中FA诱导的DPC的蛋白质组，发现形成DPC的最丰富的蛋白质是PARP1，拓扑异构酶I和II和II和II，甲基转移酶，DNA和RNA聚合酶，组蛋白，组蛋白，以及核糖体蛋白。为了鉴定修复DPC的酶，我们进行了RNA干扰筛选，发现皮瓣核酸内切酶1（FEN1）的下调使细胞对FA过敏。由于Fen1具有5'-FLAP内切酶活性，因此我们假设FA诱导了DPC偶联的5'-FLAP DNA片段，可以通过Fen1处理。的确，我们证明了FA会损坏通过碱基切除途径（BER）转化为5'-FLAP的DNA碱基。我们还观察到受损的DNA碱基与DPC和FEN1共定位。从机械上讲，我们显示了FEN1在体内修复FA诱导的DPC和裂解5'-FLAP DNA底物，这些DNA具有模拟于体外的DPC。我们还发现，FEN1修复酶拓扑异构酶II（TOP2）-DPC，由其抑制剂依托泊苷和阿霉素诱导的诱导的酶促蛋白酶和阿霉素独立于BER途径，而FEN1和FEN1和DPC靶向的蛋白酶sprtn是对两种FA诱导的非Zym Zym Zym Zymations sprapterations spr的可行途径top2-dpcs。值得注意的是，我们发现FA诱导的非酶DPC和酶ToP2-DPC迅速通过聚辅助核糖基化（ParyLation）迅速修饰，这是一种由PARP1催化的翻译后修饰，由PARP1催化的，这是一种由Paryling DNA损伤损害蛋白和DNA Reparion Reparte resation and DNA损伤蛋白的关键DNA损伤效应器和DNA Reparte resation and dna Reparte stotes和DNA Reparte stotes。，我们用HPLC-MS的抗PAR抗体进行了免疫沉淀（IP）测定，并将Fen1鉴定为parylation底物。接下来，我们表明DPC底物的填充信号发出了Fen1，而Fen1的抚养也将Fen1驱动到DPC位点。最后，使用末端ADP-ribose-MS方法的酶促标记，我们将FEN1的E285残基确定为主要的荷置位点，这似乎是FEN1迁移到DPCS所需的。综上所述，我们的工作不仅揭示了FA诱导的DPC的身份，而且还发现了前所未有的PARP1-FEN1核酸酶途径，是一种通用和势在必行的机制，可以修复其他DPC并防止DPC诱导的基因组不稳定。
IgG N-糖基化心血管年龄轨道轨迹超出日历年龄的心血管风险 肥胖和炎症升高对2型糖尿病的升高：一项前瞻性队列研究 血液基于血液的DNA甲基化生物标志物的16年纵向评估早期预测阿尔茨海默氏病 DNA甲基化作为衰老和阿尔茨海默氏病的生物标志物的实用性 使用DNA 的人脸预测的进步 “我的大脑是否会再次完全工作？”：与癌症相关的认知障碍持续的癌症幸存者的挑战和需求 动脉粥样硬化血症与炎症之间的时间关系及其对2型糖尿病发作的关节累积作用：一项纵向队列研究
在亚临床动脉粥样硬化和代谢性疾病中，已经报道了使用改变的免疫球蛋白G（IgG）N-聚糖模式作为炎症公制，这两者都是心血管健康的重要危险因素。然而，心血管疾病（CVD）的风险地层（CVDS）的IgG N-糖基化利润率的可用能力仍然未知。这项研究旨在开发一种心血管老化指数，用于使用IgG N-聚糖跟踪心血管风险。这项横断面调查招募了1465名来自Busselton健康和衰老研究的40-70岁的人。我们逐步选择了使用机器学习中的特征选择方法（递归功能消除和惩罚性回归算法）的变化N-聚糖的交汇处，并开发了IgG N-糖基化心血管年龄（GlyCage）索引，以反射来自日历年龄的偏差，从而使偏差归因于可产生的偏差。与糖基指数的最强贡献者是偶联糖基化的N-聚糖，其成分为N-乙酰基葡萄糖胺（GlCNAC）（GllcNAC）（Glycan Peak 6（GP6），FA2B，FA2B，）和digalactosy complactosy lated N-糖，含有双分裂的glcnac（glcnac）GLCNAC（GP13）（GP13，A2BG2）。A one-unit increase of GlyCage was significantly associated with a higher Framingham ten-year cardiovascular risk (odds ratio (OR), 1.09; 95% confidence interval (95% CI): 1.05–1.13) and probability of CVDs (OR, 1.07; 95% CI: 1.01–1.13) independent of calendar age.患有过度糖的人（超过3个日历年龄> 3岁）的心血管风险和CVD的概率增加，调整后的ORS分别为2.22（95％CI：1.41–3.53）和2.71（95％CI：1.25-6.41）。2022作者。曲线（AUC）区分高心脏风险的区域（AUC）值为0.73和0.65，对于日历年龄，在日历年龄为0.65和0.63。因此，本研究中开发的糖指数可用于使用IgG N-糖基化pro纤维来跟踪心血管健康。糖基与日历年龄之间的距离独立表明心血管风险，表明IgG N-糖基化在CVD的发病机理中起作用。观察到的关联的概括和高糖指数的预测能力需要其他人群的外部和纵向验证。由Elsevier Ltd代表中国工程学院和高等教育出版社有限公司出版。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
糖基化的代谢和分子特征......
从近几十年来尖端基因技术的出现将突变归因于癌症，到重新研究癌症内在代谢转变的古老理论（瓦伯格糖酵解），对转移性癌症精准灵丹妙药的探索仍在继续。本综述概述了晚期糖基化终产物 (AGE)-AGE 受体 (RAGE) 通路驱动的复杂致癌线索，从肿瘤细胞对代谢（糖酵解）的依赖开始，发展为恶性肿瘤的转移性出现。转移、化学抗性和癌症复发中强烈的 AGE-RAGE 共存会不利地刺激疾病进展和患者死亡。在癌症代谢和转移转变的结合处，是“糖酵解”产生的 AGE 和 AGE 激活的 RAGE，引发异常的分子通路，最终导致侵袭性恶性肿瘤。作为代谢叛乱的副产物，AGE 会改变代谢组、表观基因组和微生物组，此外还会胁迫细胞内、细胞间和细胞外微环境，从而有利于上皮间质转化 (EMT) 等致癌事件的发生。AGE-RAGE 协同引发 ATP 激增以获得过剩能量，引发自噬以逃避凋亡和产生化学抗性，引发胰岛素样生长因子 1 (IGF-1) 以引发元炎症和血管生成，引发高迁移率族蛋白 1 (HMGB1) 以引发免疫耐受，引发 S100 蛋白以引发转移，引发 p53 蛋白衰减以抑制肿瘤。据报道，AGE 在乳腺癌、前列腺癌、结肠癌和胰腺癌等侵袭性癌症中含量明显高于健康癌症患者，晚期癌症患者中含量高于局限性癌症患者。因此，可以提倡研究个体特有的 AGE、可溶性 RAGE 和 AGE 激活的 RAGE，将其作为诊断、预后和治疗目的的生物标记，以预测糖尿病、肥胖症、代谢综合征患者以及普通人群的癌症风险，监测癌症患者的预后和转移，并估计癌症幸存者的并发症。此外，关于癌症患者外源性（饮食）和内源性（内部形成）AGE 的临床报告以及涉及癌症中 AGE-RAGE 轴的当代临床试验具有治疗诊断意义。
酚类化合物作为糖尿病相关氧化应激，炎症，晚期糖基化终产物的预防和治疗剂的产生
糖尿病及其并发症代表了全世界对健康问题的极为问题。全球疾病发病率的非凡增加表明，新的，安全，有效和可抗性的治疗方法的发展需要挑战。这种复杂的疾病以高血糖水平为特征，涉及其病因中的许多致病过程。即使背后的分子机制尚不清楚，也广泛认识到，氧化应激，晚期糖化终产物（年龄）和炎症的积累与疾病的发育，进展和相关并发症有关。在这方面，酚类化合物代表了有价值的治疗视角。因此，本综述着重于酚类化合物在与糖尿病相关的氧化应激，年龄产生和炎症中的作用。，我们总结了酚类化合物的抗氧化和抗糖化特性的最新结果，以及在炎症和炎症相关途径上的活性调节与糖尿病相关的炎症和炎症相关途径，即核因子酸，核因子 - κB，核因子基酶/蛋白质蛋白酶氨基糖酶/磷脂酶氨基酶氨基酶氨基酶氨基糖酶（核因子蛋白酶），描述了激酶B信号通路。突出显示，酚类化合物在预防或治疗策略的发展中的抗糖尿病潜力及其相关的复杂性。
筛选小分子糖基化抑制剂并评估其对糖蛋白的影响
Bowdoin College生物化学系摘要：幽门螺杆菌是一种革兰氏阴性的，螺旋形的致病细菌，可在人类的胃中殖民。一旦建立了感染，还可能发生胃癌和消化性溃疡。抗生素一直是致病细菌治疗的强大工具。当前幽门螺杆菌的治疗方法是“三重治疗”，涉及至少两种不同的抗生素。第三种药物通常是质子泵抑制剂（PPI），以帮助胃愈合。但是，这尚未有效。过量使用广谱抗生素会导致细菌病原体中的抗生素耐药机制（Quintana，2022）。广谱抗生素也经常破坏正常的肠道微生物组（Quintana，2022）。需要替代方法来最大程度地减少负面副作用，并选择性地治疗关注的抗生素抗生素“优先病原体”。细菌聚糖由于其独特的单糖和在细菌致病性中的作用而引人注目的治疗靶标。先前的研究表明，细菌糖基化的破坏会导致对宿主细胞，生物膜形成，运动的粘附降低，从而降低了宿主定殖（Quintana，2022）。因此，杜贝实验室的研究重点是靶向覆盖细菌细胞表面的聚糖。伊莎贝拉·金塔纳（Isabella Quintana）最近的工作先前证明了基于稀有细菌单糖的S-糖苷抑制剂，可有效破坏聚糖生物合成和细菌适应性。我复制了一些实验以确认这些发现。我还使用碳水化合物结合蛋白探索了互补角，以确认S-糖苷抑制剂以浓度依赖性方式有效地阻碍了聚糖生物合成。总体而言，小分子抑制剂已证明可以选择性地靶向抗生素耐药性病原体，从而增加了我们治疗感染的工具。项目目标：这项研究旨在评估基于稀有细菌单糖的S-糖苷抑制剂在破坏聚糖生物合成中的有效性，通过测量糖蛋白生物合成和细胞表面聚糖结构的变化。使用的方法：小分子抑制剂 - 细菌单糖，BAC，DATDG和FUCNAC上的苄基 - 糖苷被用作细菌糖基转移酶的底物诱饵。这些细菌单糖是由于它们快速合成支架及其在优先病原体中的利用而选择的（Williams，2020）。目的是评估S-糖苷作为代谢抑制剂的有效性，以阻止细菌糖基化。这是通过1）确认抑制糖蛋白生物合成的抑制作用和2）确认细胞表面聚糖结构的变化。
在筛查妊娠糖尿病时，糖基化的血红蛋白和空腹血糖可以取代葡萄糖挑战测试吗？
引言妊娠糖尿病是指在怀孕期间开始或首先被诊断出的任何程度的葡萄糖不耐症（1）。各种因素在妊娠糖尿病的发生率中起作用，包括诊断方法，种族，身体成分和月经开始时的年龄（2-4）。产妇年龄，超重或肥胖，种族，糖尿病家族史以及妊娠糖尿病史（GDM）是GDM的一些建议的危险因素。研究表明，在妊娠糖尿病中，脂质过氧化产物可能会增加，并且抗氧化剂酶的活性可能会降低，这可能会对母体和胎儿健康产生副作用。类似于2型糖尿病，GDM患者的血糖水平与脂质过氧化物浓度有关（5）。妊娠糖尿病的患病率最近在世界和伊朗（6-8）上升。这种常见的妊娠代谢疾病与许多母体和胎儿并发症有关（9,10）。妊娠糖尿病通常是无症状的，因此必须进行早期筛查，诊断和治疗（11）。理想的筛查测试应确定尽可能多的患者并分开患者（即
演讲tm：揭示糖基化和免疫之间的甜蜜真理，每个细胞的每个细胞都覆盖在一个简单而综合的层
演讲tm：揭示糖基化和免疫之间的甜蜜真理，每个细胞的每个细胞都被称为聚糖的简单且复杂的碳水化合物覆盖（图1A），其中大多数通过称为糖基化的过程与蛋白质或脂质绑定。这些细胞表面蛋白的巨大结构多样性，进化和丰度取决于细胞类型和状态，因此被认为是反映不同细胞特征的“细胞特征”（1,2）。已知糖基化与免疫系统的不同方面有关，例如T细胞生物学，对于T细胞受体（TCR）的激活和功能至关重要。 TCR是T细胞表面上的蛋白质，识别并结合了异物物质，例如病原体或毒素，在激活T细胞中起关键作用。 糖基化可以通过改变其构象和稳定性以及调节其与其他蛋白质的相互作用来影响TCR的激活和功能（3）。 已知 t细胞代谢受聚糖调节。 经历克隆膨胀或增殖的 T细胞需要改变代谢，以承受通过有氧糖酵解和谷氨酰胺溶解的核苷酸，氨基酸和脂质合成的生物能量需求的增加（4）。 t细胞活化还上调了葡萄糖代谢的一个成分的己糖胺途径，以增加核苷酸糖供体底物UDP-GlcNAC。 此途径是N-糖基化，O-glcnacylation和糖氨基氨基聚糖的产生所必需的，这是功能性T细胞的要求（5）。糖基化与免疫系统的不同方面有关，例如T细胞生物学，对于T细胞受体（TCR）的激活和功能至关重要。TCR是T细胞表面上的蛋白质，识别并结合了异物物质，例如病原体或毒素，在激活T细胞中起关键作用。糖基化可以通过改变其构象和稳定性以及调节其与其他蛋白质的相互作用来影响TCR的激活和功能（3）。t细胞代谢受聚糖调节。T细胞需要改变代谢，以承受通过有氧糖酵解和谷氨酰胺溶解的核苷酸，氨基酸和脂质合成的生物能量需求的增加（4）。t细胞活化还上调了葡萄糖代谢的一个成分的己糖胺途径，以增加核苷酸糖供体底物UDP-GlcNAC。此途径是N-糖基化，O-glcnacylation和糖氨基氨基聚糖的产生所必需的，这是功能性T细胞的要求（5）。糖基化也是可能影响蛋白质的免疫原性的一个因素，该因素受到多种因素的影响，包括其结构和抗原决定因素的存在。将糖添加到蛋白质中时，可能会改变蛋白质的形状和电荷，从而可能影响免疫系统识别为异物。这可能会影响免疫系统对疫苗产生抗体和记忆细胞产生抗体和记忆细胞的能力，从而影响其有效性。T细胞表面蛋白糖基化的变化也会影响细胞因子的产生，信号分子有助于协调免疫反应（6）。免疫系统必须能够区分自我和非自我，以便正常运行。此过程失败会导致自身免疫性疾病的发展。这可能导致一系列症状，具体取决于被攻击的组织。自我抗原的糖基化模式的变化可以改变其抗原决定因素，这可能会导致自身免疫性，如鼠模型中所观察到的那样（7,8）。
通过MGAT5介导的N-糖基化对神经干细胞分化和脑发育的调节 生物文化多样性和作物改善。 miR-22基因疗法通过促进抗肿瘤免疫和增强代谢来治疗HCC
未分化的神经茎和祖细胞（NSPC）会遇到结合质膜蛋白和功能分化的细胞外信号。膜蛋白受N-连接的糖基化调节，从而使糖基化在细胞分化中起着至关重要的作用。我们评估了在NSPC中控制N-糖基化的酶，发现负责产生B 1,6的N-聚糖，N-乙酰氨基氨基氨基转移酶V（MGAT5）的酶的损失导致NSPC分化的体外和In Vivo的特定变化。MGAT5纯合子NULL NSPC形成更多的神经元和较少的星形胶质细胞。在脑大脑皮层中，MGAT5的损失导致神经元分化加速。快速的神经元分化导致NSPC生态裂细胞的耗竭，导致MGAT5 NULL小鼠的皮质神经元层的转移。糖基化酶MGAT5在细胞分化和早期大脑发育中起关键且先前未认识到的作用。
“人源化”N-糖基化途径
摘要 最近的 SARS-CoV-2 大流行给世界带来了惨痛的教训，不仅让世界认识到病毒性疾病爆发的灾难性后果，也让世界认识到疫苗接种在限制生命和经济损失方面的显著影响。接种乙肝病毒 (HBV) 疫苗仍然是实现到 2030 年消除病毒性肝炎的关键行动，HBV 是一种影响全球 2.9 亿人的主要人类病原体。为了实现这一目标，开发改良的 HBV 抗原对于克服对基于酵母产生的小 (S) 包膜蛋白的标准疫苗的无反应性至关重要。我们最近表明，将 S 和大 (L) HBV 蛋白的相关免疫原性决定簇结合在嵌合抗原中可显着增强抗 HBV 免疫反应。然而，对具有成本效益的高质量抗原的需求仍然具有挑战性。可以通过使用植物作为多功能且可快速扩展的蛋白质生产平台来解决此问题。此外，最近通过 CRISPR/Cas9 基因组编辑生成的缺乏 b -1,2-木糖基转移酶和 a -1,3-岩藻糖基转移酶活性 (FX-KO) 的植物，能够生产具有“人源化” N-糖基化的蛋白质。在本研究中，我们研究了植物 N-糖基化对野生型和 FX-KO 本氏烟中产生的嵌合 HBV S/L 候选疫苗免疫原性的影响。与野生型植物产生的对应物相比，防止 b -1,2-木糖和 a -1,3-岩藻糖附着到 HBV 抗原上显著增强了小鼠的免疫反应。值得注意的是，FX-KO 产生的抗原引发的抗体更有效地中和了野生型 HBV 和临床相关的疫苗逃逸突变体。我们的研究首次证实了糖工程改造的本氏烟可以显著改善植物生产糖蛋白疫苗的宿主。