摘要:图像解释对于临床微生物诊断至关重要。革兰氏阴性幻灯片的手动阅读是时间耗尽和复杂的。基于机器学习(ML)模型的人工视觉系统的使用可以加快感兴趣的微生物的检测,从而确保丢弃无关的图像,并考虑与诊断相关的图像。这种自动诊断过程大大减轻了微生物学家及其主观性的负担。可以通过鉴定酵母样细胞或指示念珠菌属的丝状结构来自动化晶体染色样品的形态学研究。已经实施了几种多类机器学习模型(XGBoost,人工神经网络和K-Nearest邻居),从图像中采取了相关的形态特征。使用目标函数对酵母和菌丝的特定检测,使用创新的元启发式算法优化了数据集维度。最佳优化模型的精度为0.821,精度宏为0.827,召回宏为0.790,F1宏的宏为0.806。
第四阶段NSCLC中的抽象治疗分层是通过鉴定癌基因驱动突变的指导。具有当前许可的治疗剂的可作用突变包括表皮生长因子受体(EGFR),变性淋巴结淋巴瘤激酶(ALK),ROS-1和BRAF V600的重排。除了小分子疗法的进展外,免疫检查点抑制剂(CPI)的发展已经改变了III期和IV期NSCLC的景观。CPI的成功导致在并发和顺序设置中使用小分子治疗进行了评估。在这篇综述中,我们总结了IV期NSCLC中CPI和酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的最新结果,并以并发和顺序方法详细介绍了显着的毒性及其潜在机制。由于发现越来越多的治疗靶标的临床医生越来越重要,可以纠正序列治疗以提供安全有效的治疗。除了第四阶段疾病外,我们还建议关键NSCLC驱动因素的全面分子分析,尤其是在第三阶段疾病中,将有助于告知最佳治疗测序并最大程度地减少潜在毒性。
该项目旨在通过鉴定新型生物标志物和新型技术的部署来推进护理点诊断,以开发针对其中独特的表位的纳米体,以实现最高特异性。将通过分析可用的“ OMICS数据”来识别相关的生物标志物,并且已经编制了初步候选名单。纳米体将在学术实验室中使用硅和抗体发现和优化的体外方法的结合。该项目将在Sormanni Lab中开发,探索和采用人工智能(AI)策略,以获取针对预先确定的表位的纳米构造,这些表位在已识别的生物标志物表面是独一无二的[1,2]。然后,将通过体外定向进化方法(例如酵母或核糖体显示)组合来优化此类纳米体的亲和力,这些方法已经在实验室中启动和运行,以及用于预测与亲密关系增加的外生序列的机器学习方法。此外,通过已建立的管道[3],将在计算上进一步优化稳定性和溶解度,因为这些分子特性对于能够开发合适的保质期的侧向流量设备至关重要。
近年来,RNA测序(简短的RNA-Seq)已成为一种非常广泛的技术,可以分析一个不断变化的细胞转录组,即一个细胞或一个细胞中的所有RNA分子的集合。RNA-seq最常见的目标之一是通过鉴定两个或多个生物学条件之间差异表达(DE)的基因或分子途径来填充基因表达。从RNA-seq数据中检测DE基因和途径的计算工作流量需要使用多种命令行工具和大多数用户可能无法访问的大量计算资源。Galaxy [1]是一个强大且易于使用的基于Web的平台,用于科学数据分析。分析中的步骤是通过运行Galaxy工具执行的,该工具描述了如何将命令行软件的参数转换为用户友好的Web界面。图形网络界面以及大量高质量,社区开发和维护的工具和培训材料,可以为新手和专家用户进行快速的交互式分析。对于分析的每个步骤,Galaxy捕获了几个元数据(例如,工具标识和版本,输入和参数)启用
数据和决策可追溯性是指数据生命周期的全面和可审计的文档,包括其起源,转换,移动和利用,以及使用该数据的决策背后的基本原理和影响因素。它代表了记录和链接数据元素和决策点的系统方法,创建了可验证的证据链。该链允许重建数据出处以及整个系统操作中做出的选择的理由。在复杂的系统中,尤其是涉及多个利益相关者或自动决策过程的系统中,可追溯性对于建立问责制,增强数据完整性,促进调试和优化以及支持遵守监管要求至关重要。e ff的可食用性机制可以识别数据血统,数据质量评估以及决策过程的分析,最终有助于提高透明度,信任和理解。此外,它通过鉴定潜在偏见,ffi ciencies和用于细化数据处理和决策算法的区域,为持续改进提供了基础。提供数据和决策可追溯性所需的信息包括两个主要共同点,如图3。对于系统中的每个过程,需要跟踪捕获的信息(输入)和生成(输出)。提供信息的可追溯性
1。引言确定治疗疾病的药物目标和开发新化合物,这些化合物可以通过药物目标相互作用诱导所需的效果,这对研究人员来说是一个非常漫长而昂贵的过程。近年来,除了批准的药物分子的适应症之外,通过鉴定不同和新的靶分子来使用这些药物以不同的指示使用的方法已获得重要性。最近,在计算机模式匹配中,软件被广泛用于识别小分子的新目标。连接图(CMAP)程序是一个基于网络的库,由Broad Institute(美国马萨诸塞州剑桥市)生产。CMAP包括来自各种细胞系(A375,A549,HCC515,HEPG2,HT29,MCF7,PC3,HA1E,VCAP)的150万个基因表达谱,这些基因表达谱是用〜5000个小分子化合物处理的(Lamb等,2006)。该软件是一个目录,比较了小分子引起的基因表达水平的变化的相似性,并评分了相似性。在1996年,Rho激酶(岩石)被确定为Rho A的下游效应子,它介导了许多细胞内信号传导机制(Kimura等,1996; Nakagawa等,1996; Nakagawa等,1996; Ark等,2010;Özdemir
抽象的机器学习已越来越多地用于获得个性化的神经影像学特征,以诊断,预后和对神经精神病和神经退行性疾病的治疗的反应。因此,它通过鉴定疾病亚型在各种大脑表型措施中存在显着差异,从而更好地理解疾病异质性。在这篇综述中,我们首先介绍了使用机器学习和多模式MRI进行研究的系统文献概述,以揭示各种神经精神疾病和神经退行性疾病的疾病异质性,包括阿尔茨海默氏病,精神分裂症,精神分裂症,主要抑郁症,主要的抑郁症,自闭症谱系疾病,多发性硬化症,以及他们的多种疾病以及跨性别的定义。随后,我们总结了相关的机器学习方法,并讨论了一种新兴的范式,我们称之为维度神经影像型内型(DNE)。dne将神经精神病学和神经退行性疾病的神经生物学异质性分解为低维但有益的,定量的脑表型表述,是一种强大的中间表型(即内型型),很大程度上反映了下属的遗传学和遗传学。最后,我们讨论当前发现的潜在临床意义,并设想未来的研究途径。
然而,由于该系统最初是为了更具体地针对已正式进入欧盟授权程序的转基因事件而开发的,因此在检测欧盟未经授权的转基因生物方面可能会遇到一些问题。首先,如果转基因生物不含有 qPCR 筛选分析中专门针对的转基因元件,则无法检测到。然而,最近的估计表明,当同时使用筛选标记 p35S 和 tNOS 时,这种情况发生在不到 10% 的欧盟未经授权的转基因生物中。10,12,13 其次,如果欧盟未经授权的转基因生物含有至少一种 qPCR 筛选分析针对的转基因元件,则可能出现两种情况。一方面,当样本由欧盟授权和未授权的转基因生物组成,且这些生物具有一些共同的转基因元件,例如 p35S 和 tNOS,qPCR 筛选试验通过鉴定欧盟授权的转基因生物而得出的阳性结果并不能保证不存在欧盟未授权的转基因生物。另一方面,如果无法在观察到的 qPCR 筛选信号与欧盟授权的转基因生物列表之间建立联系,则只能怀疑存在欧盟未授权的转基因生物。此外,qPCR 事件特异性方法通常不适用于欧盟未授权的转基因生物。4,10
抗DPPX(二肽基 - 肽酶样蛋白-6)在2013年发现的脑炎是一种罕见的影响中枢神经系统(CNS)的自身免疫性疾病,其特征是一系列神经系统和胃肠道症状。该疾病是由针对DPPX的抗体引起的,DPPX是KV4.2钾通道的调节亚基,这对于控制神经元兴奋性至关重要。dppx在包括海马和小脑以及胃肠道系统的骨髓丛中的各个大脑区域表达。受体的广泛分布解释了多灶性疾病的表现。通过抗DPPX抗体破坏了这些通道,导致一系列症状,它们本质上是神经系统和胃肠道的[1,2]。抗DPPX脑炎的早期迹象通常包括无法解释的体重减轻和胃肠道障碍,尤其是严重的腹泻。这些症状通常随后是一系列神经系统问题,包括认知功能障碍,躁动,幻觉和夸张的惊吓反应。除了这些神经精神症状外,患者还会出现运动障碍,例如静止震颤,僵硬,肌阵挛,甚至癫痫发作。睡眠迷惑(例如REM睡眠行为障碍)也很常见。大多数患者是中年患者,出现了C.52岁的中位年龄,男性似乎比女性更频繁。通过鉴定患者血液或CSF中的抗DPPX自身抗体来确认诊断[1,2]。
在发现所谓的CRISPR-CAS技术之后,基因组编辑技术引起了人们越来越兴趣。它引起了全球骚动,涉及其在人类中的使用,尤其是在2018年宣布中国科学家的宣布后,他使用CRISPR来编辑了双胚胎的基因。的确,尽管不是唯一的问题,但最大的关注点之一是使用基因组编辑技术来修改人类种系。在这种科学和技术背景下,法律在构建应允许或禁止的内容以及在哪些条件下起着关键作用,以确定安全和可访问的创新待遇与根据社会价值观和选择的基本权利之间的平衡。在欧盟内部,一些机构考虑了人类基因组编辑提出的问题,几个法律文本参与了适用于人类基因组编辑的欧洲监管框架的建立。然而,我们在本文中争辩说,既定的监管格局是在被分割,拆分或分段的意义上分散的。由于历史和技术原因,这种破碎化可能是不可避免的,它就适用于人类基因组编辑的当前监管框架的作用产生了影响。着眼于欧盟和法国治理层面,我们讨论了如何通过鉴定人类基因组编辑碎片监管景观的决定因素来进行这种分裂。我们认为,应该将其视为一个过程,该过程对人类基因组编辑的反应更具反应反映不断变化的政治和法律背景。