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SHAPE 软件可以量化化学 3D 结构与理想几何结构或用户选定结构的偏差。7 在我们的案例中,我们用它来比较文献中先前描述的含 LBT 肽的形状(见表 S1)。SHAPE 软件确定一个连续形状参数 (SP),该参数的数学定义与系统大小无关。根据定义,当金属位点(问题结构,P)的实际坐标恰好显示出所需的理想形状时,SP 的结果值为零,并且随着结构的扭曲程度而增加。低于 0.1 的值表示结构中化学上无关紧要的扭曲。大于 3 的值表示重要的扭曲,通常遇到的最高值在 40 的数量级。
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