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RNA 分析的最新进展加深了我们对生物组织中细胞状态的理解。然而，在将 RNA 表达数据与器官间的空间背景相结合方面仍然存在很大差距，这主要是由于在完整组织体积内检测 RNA 的挑战。在这里，我们开发了 Tris 缓冲液介导的透明器官中原位杂交链反应信号的保留 (TRISCO)，这是一种有效的组织透明化方法，专为全脑空间三维 (3D) RNA 成像而设计。TRISCO 解决了几个关键问题，包括保持 RNA 完整性、实现统一的 RNA 标记和增强组织透明度。我们使用各种细胞身份标记、非编码和活性依赖性 RNA，在不同大小和物种的不同器官内测试了 TRISCO。因此，TRISCO 成为单细胞、全脑、3D 成像的强大工具，可对整个大脑进行全面的转录空间分析。
细胞分辨率的全脑空间转录分析
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