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描述传统的分阶段程序仅限于二倍体生物。我们的方法使用马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）方法修改了li和stephens算法，并构建了一个通用框架，该框架允许在多个感染设置中进行单倍型搜索。此软件包主要是PF3K项目的一部分，该项目是使用最新的测序技术的全球合作，可提供对疟疾寄生虫恶性疟原虫自然变化的高分辨率视图。寄生虫DNA，通常含有一个以上的寄生虫菌株，比例未知。此软件包用于反值使用混合单倍型，并报告每个样品中的混合物比例。
deploid.pdf
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