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微生物的目的是渗透宿主防御并殖民它。另一方面，宿主采用了几种物理和化学属性来防止感染。这些防御包括涵盖粘膜表面的分泌物中的抗菌因素；皮肤和粘膜上皮细胞的替代速度快速；吞噬细胞吞噬；白细胞介素，类花生素和补体系统的作用；炎症反应；等等，病原体试图逃避或克服这些机制，以帮助毒力因子的帮助。
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