摘要 濒危物种的低遗传变异和近亲繁殖是由于近期种群数量下降造成的。对濒危种群进行基因筛查有助于评估它们灭绝的脆弱性,并为保护工作制定明智的管理行动。豹(Panthera pardus)是一种高度通用的捕食者,目前有 8 个不同的亚种。然而,极度濒危的阿拉伯豹(P. p. nimr)的基因组数据仍然缺乏。在这里,我们对两只阿拉伯豹的全基因组进行了测序,并组装了迄今为止最完整的豹基因组数据集。我们的系统基因组学分析表明,豹分为两个截然不同的演化支:非洲豹和亚洲豹。保护基因组分析表明,种群数量长期下降,导致近亲繁殖和纯合性增加,从而清除了两个阿拉伯个体中的有害突变。我们的研究是首次尝试从遗传学角度为这种极度濒危亚种的圈养繁殖计划提供信息。