自发染色体重排 (CR) 在物种形成、基因组进化和作物驯化中起着至关重要的作用。为了能够利用 CR 的育种潜力,人们开始通过 X 射线照射将染色体片段化,从而进行植物染色体工程。随着 CRISPR/Cas 系统的兴起,人们可以高效地在任意染色体位置诱导双链断裂 (DSB)。这使得预先设计的染色体工程达到了全新的水平。可以通过诱导染色体易位来打破特定基因之间的遗传连锁。可以恢复抑制遗传交换的自然倒位以进行育种。此外,人们已经开发出各种通过缩小常规标准 A 染色体或额外 B 染色体来构建微型染色体的方法,这些方法可以作为未来植物生物技术的载体。最近,人们可以构建一个功能性的合成着丝粒。此外,人们已经建立了不同的基因组单倍体化方法,其中一些方法基于着丝粒操作。未来,我们期望看到更复杂的重组,这些重组可以与重组酶等先前开发的工程技术相结合。染色体工程可能有助于重新定义遗传连锁群、改变染色体数量、在微型载货染色体上堆叠有益基因,或建立遗传隔离以避免杂交。