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线虫C.秀丽隐杆线虫是一种精心研究的模型生物,用于表征完整神经系统的结构,连通性,8和功能。3D光学显微镜和9个单个神经元的9个荧光蛋白标记的最新技术突破使我们更接近捕获全脑分辨率的10蠕虫的神经动力学。然而,使用11个这些高分辨率录音捕获完整的神经动力学图需要解决三个特定的挑战:i)检测荧光视频中的12个神经元,ii)根据解剖学定义的13个类别识别这些神经元,以及iii)跟踪神经位置的时间。通过14个高灵敏度,特异性和吞吐量成功地解决了这些挑战,可以使我们能够分析大量的人口样本,从而在单神经元分辨率下对整个大脑的结构和功能提供15个前所未有的见解 - 16个以前在任何有机体中都没有实用的壮举。为了促进这一科学目标,我们已经在五个不同的实验室中的118个蠕虫中策划了17个可用的注释数据集,并建立了系统的18个基准,将整个目标分解为三个定义明确的任务:i)I)神经检测,II)19识别识别,以及III)spatiotal tracking。我们的初步分析揭示了相当大的20室,以改善现有的最新计算方法。我们使我们的基准结果可重现;我们的代码可公开使用24因此,我们设想,我们的21种蠕虫基准群催生了专门从事计算机视觉的广泛受众的努力,以开发22种强大而准确的方法,从而显着增强了产生带注释的全脑23个神经动力学数据集的吞吐量。

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