NCOA3是通过ESRRB招募到目标基因座的ERRE的。(a)使用先前描述的野生型(WT)或ERRE突变序列的DNA下拉测定法(Feng et al。2009)或Nanog(van den Berg等人 2008)。 生物素化探针(40–50-50碱基对[BP])与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育,并在链霉亲蛋白珠上回收,并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。 (b)ESRRB,KLF4,NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因(Inter。) 通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域,并相对于输入表示。 数据是三个生物学重复的平均6 SEM。 (c)ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。 在每个实验中,富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100%。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG(Santa Cruz Biotechnology)的背景富集。 (d)蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意,此时NCOA3和OCT4级别不变。 (E)使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析,该探针还包含相邻的OCT – SOX位点(Van Den Berg等人 2008),并从NCOA3,OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。2009)或Nanog(van den Berg等人2008)。 生物素化探针(40–50-50碱基对[BP])与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育,并在链霉亲蛋白珠上回收,并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。 (b)ESRRB,KLF4,NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因(Inter。) 通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域,并相对于输入表示。 数据是三个生物学重复的平均6 SEM。 (c)ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。 在每个实验中,富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100%。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG(Santa Cruz Biotechnology)的背景富集。 (d)蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意,此时NCOA3和OCT4级别不变。 (E)使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析,该探针还包含相邻的OCT – SOX位点(Van Den Berg等人 2008),并从NCOA3,OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。2008)。生物素化探针(40–50-50碱基对[BP])与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育,并在链霉亲蛋白珠上回收,并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。(b)ESRRB,KLF4,NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因(Inter。)通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域,并相对于输入表示。数据是三个生物学重复的平均6 SEM。(c)ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。在每个实验中,富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100%。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG(Santa Cruz Biotechnology)的背景富集。 (d)蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意,此时NCOA3和OCT4级别不变。 (E)使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析,该探针还包含相邻的OCT – SOX位点(Van Den Berg等人 2008),并从NCOA3,OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100%。数据是至少两个独立实验的平均6 SD。B和C中的虚线表示对照IgG(Santa Cruz Biotechnology)的背景富集。(d)蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。请注意,此时NCOA3和OCT4级别不变。(E)使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析,该探针还包含相邻的OCT – SOX位点(Van Den Berg等人2008),并从NCOA3,OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。
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