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海洋微生物形成了相互作用的相互作用的复杂群落,这些群落影响了中央生态系统在海洋中的功能,例如主要的生产和营养循环。确定控制其组装和活动的机制是微生物生态学的主要挑战。在这里,我们整合了Tara Oceans Meta-Omics数据,以预测兴奋海洋中原核生物组合中的基因组规模社区相互作用。一个全球基因组分辨的共同活性网络揭示了各种系统发育距离之间存在显着数量的谱系关联。鉴定的共同活性群落包括显示较小基因组的物种,但编码更高的群体感应,生物膜形成和次生代谢的潜力。 社区代谢建模揭示了共同活性群落中相互作用的较高潜力,并指向保守的代谢交叉进食,特别是特定的氨基酸和B组B族维生素。 我们综合的生态和代谢建模方法表明,基因组的精简和代谢可营养噬菌体可能充当塑造全球海洋表面细菌群社区组装的联合机制。鉴定的共同活性群落包括显示较小基因组的物种,但编码更高的群体感应,生物膜形成和次生代谢的潜力。社区代谢建模揭示了共同活性群落中相互作用的较高潜力,并指向保守的代谢交叉进食,特别是特定的氨基酸和B组B族维生素。我们综合的生态和代谢建模方法表明,基因组的精简和代谢可营养噬菌体可能充当塑造全球海洋表面细菌群社区组装的联合机制。

基因组规模的社区建模揭示了表皮细菌群社区中保守的代谢交叉进食

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