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胶质母细胞瘤 (GBM) 是一种侵袭性脑癌,患者预后不良。目前的治疗方法只能使患者平均存活 15 个月。在这项工作中,我们使用基因组规模代谢模型 (GEM) 与其他系统生物学工具来检查从癌症基因组图谱 (TCGA) 获得的 GBM 患者的整体转录组学数据。我们揭示了 GBM 背后的分子机制并确定了有效治疗患者的潜在治疗靶点。所介绍的工作由两个主要部分组成。第一部分将患者分为高存活率和低存活率两组,并比较他们的基因表达。第二部分使用 GBM 和健康脑组织 GEM 在 GBM 细胞模型中模拟基因敲除,以找到潜在的治疗靶点并预测它们在健康脑组织中的副作用。我们 (1) 发现存活率低的患者中上调的基因与胶质瘤侵袭过程的各个阶段有关;(2) 确定了胶质瘤的五个必需基因,抑制这些基因对健康脑组织无毒,因此有望作为治疗靶点进行进一步研究。

胶质母细胞瘤的基因组规模代谢模型揭示了有希望的药物开发目标

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