摘要：细菌基因组编辑包括一系列繁琐且多步骤的方法，例如自杀质粒。成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-Cas 技术的发现和应用因其简单性和可编程性而彻底改变了真核生物的基因组编辑。然而，该系统在细菌基因组编辑中并没有得到广泛的青睐。在这篇综述中，我们总结了 CRISPR-Cas 介导的细菌基因组编辑的主要方法和困难，并提出了一些规避这些问题的替代方法，包括 CRISPR 切口酶、Cas12a、碱基编辑器、CRISPR 相关转座酶、引物编辑、内源性 CRISPR 系统以及使用预制的 Cas 蛋白和向导 RNA 的核糖核蛋白复合物。最后，我们还讨论了基于荧光蛋白的方法来评估基于 CRISPR 的系统对细菌基因组编辑的有效性。CRISPR-Cas 仍然有望成为细菌中的通用基因组编辑工具，并且正在进一步优化以扩大在这些生物体中的应用。这篇综述提供了罕见的基因组编辑综合视角。它还旨在让微生物学界熟悉不断增长的细菌基因组编辑工具箱。