摘要 藜麦种质保留了有用且大量的遗传变异,但由于缺乏现代育种工具的实施,这一遗传变异仍未得到开发。我们整合了田间和序列数据,以表征藜麦的大量多样性。310 个种质的全基因组测序揭示了 290 万个多态性高置信度单核苷酸多态性 (SNP) 基因座。高地和低地藜麦聚集成两个主要群体,F ST 发散度为 0.36,连锁不平衡 (LD) 衰减分别为 6.5 和 49.8 kb。一项使用多年表型试验的全基因组关联研究发现了与 17 种性状稳定相关的 600 个 SNP。两个候选基因与千粒重相关,一个抗性基因类似物与霜霉病抗性相关。我们还确定了四种对适应性很重要的农艺性状的多效作用基因座。这项工作展示了使用部分驯化的孤儿作物重新测序数据来快速识别标记性状关联,并为基因组学支持的藜麦育种提供基础元素。
主要关键词