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Alu 是高拷贝数散在重复序列，在灵长类和人类进化过程中积累在基因附近。它们是现代人类结构变异的普遍来源。Alu 插入对基因表达的影响尚不明确，但有些影响与表达数量性状位点 (eQTL) 有关。在这里，我们直接测试多态性 Alu 插入与相同单倍型上的其他变体分离的调控作用。为了筛选具有此类影响的插入变体，我们使用了异位荧光素酶报告基因检测并评估了 110 种 Alu 插入变体，其中 40 多种可能在疾病风险中发挥作用。我们观察到了一系列效应，其中有显著的异常值会上调或下调荧光素酶活性。使用一系列报告基因构建体（包括 Alu 周围的基因组背景），我们可以区分 Alu 破坏另一个调节器的情况和 Alu 引入新调节序列的情况。接下来，我们重点研究了与乳腺癌相关的三个多态性 Alu 基因座，这些基因座在报告基因检测中表现出显著的影响。我们使用 CRISPR 修改内源序列，建立 Alu 基因型不同的细胞系。我们的研究结果表明，Alu 基因型可以改变与癌症风险有关的基因的表达，包括 PTHLH 、 RANBP9 和 MYC 。这些数据表明，常见的多态性 Alu 元素可以改变转录水平并可能导致疾病风险。
Alu 插入变异改变基因转录水平
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