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摘要 在感染巨牡蛎 (Crassostrea gigas) 的过程中,牡蛎疱疹病毒 1 (OsHV-1) RNA 会通过 A 到 I 的转化进行酶促修饰。与 OsHV-1 RNA 平行的 ADAR1 表达和超编辑活性的增加表明 dsRNA 编辑与抗病毒反应之间存在功能性联系。我们分析了 87 个 RNA 测序数据集,这些数据集来自暴露于 OsHV-1 的免疫致敏、抗性和易感牡蛎,以比较宿主和病毒转录本上的 ADAR 超编辑水平并追踪牡蛎基因上的超编辑。尽管在感染后期病毒 RNA 的编辑有所增加,但宿主 RNA 比病毒 RNA 更容易发生超编辑。一组占牡蛎转录组 0.5% 的基因(包括几个含三部分基序的序列)不断被超编辑。相反,我们鉴定出参与抗病毒反应、miRNA 成熟和表观遗传调控的基因,这些基因仅在特定条件下被过度编辑。尽管技术和生物学瓶颈阻碍了对双壳类“RNA 编辑组”的理解,但现有的工具和技术可以适用于双壳类软体动物。

牡蛎疱疹病毒 1 感染期间的 ADAR 编辑:事实与局限性

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