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计算药物重新定位旨在确定现有药物在治疗其并非针对的疾病方面的潜在应用。这种方法可以大大加快传统的药物发现过程,减少药物开发所需的时间和成本。张量分解使我们能够整合多种药物和疾病相关数据,以提高预测性能。在本研究中,提出了一种用于药物重新定位的非负张量分解 NTD-DR。为了捕捉药物-靶标、药物-疾病和靶标-疾病网络中的隐藏信息,NTD-DR 使用这些成对关联构建一个表示药物-靶标-疾病三重态关联的三维张量,并将它们与药物、靶标和疾病的相似性信息相结合以进行预测。我们将 NTD-DR 与最近的最先进方法在受试者工作特征 (ROC) 曲线下面积 (AUC) 和精确度和召回率曲线下面积 (AUPR) 方面进行了比较,发现我们的方法优于竞争方法。此外,五种疾病的案例研究也证实了 NTD-DR 预测的可靠性。我们提出的方法在前 50 个预测中识别出比其他方法更多的已知关联。此外,NTD-DR 识别的新关联通过文献分析得到验证。

用于药物重新定位的非负张量分解

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