这些疫苗含有减毒病毒，与自然感染最为相似。这可以产生强大的终生免疫力，而不会对免疫系统健康的人群造成严重疾病。由于这些疫苗与自然感染相似，因此它们比非活疫苗更容易引起副作用，许多人会比非活疫苗经历更多的副作用。这些反应通常很轻微，可以自行消失或通过扑热息痛等简单的止痛药缓解。澳大利亚现有的减毒活疫苗包括麻疹-腮腺炎-风疹 (MMR) 疫苗、水痘 (水痘) 疫苗、带状疱疹疫苗、黄热病疫苗、轮状病毒疫苗、卡介苗、日本脑炎疫苗（仅限 Imojev）和口服伤寒疫苗。