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蛋白质-DNA 凝聚物介导转录并调节基因表达以及 DNA 复制和修复。稳定凝聚物的分子间桥接力在这些过程中起着直接作用。在这里,我们使用光镊来测量桥接力。在鱼精蛋白存在的情况下,在两个微珠之间连接的 20.5 knt 单链 DNA (ssDNA) 上观察到单个凝聚物。拉伸产生具有锯齿状图案的力曲线,表明凝聚物是通过单个鱼精蛋白-ssDNA 桥的连续断裂而分解的。桥接力为 11.3 ± 4.6 pN,单个桥的展开长度为 1.3 ± 0.8 µm。相反,双链 DNA (dsDNA) 形成鱼精蛋白桥接缠结,可以承受足够高的力 (~55 pN) 以分离链。 ssDNA 通过在回缩时过度拉伸种子缠结形成,在 dsDNA 的缺口处追踪未剥离的部分,但初始凝聚物具有足够的 ssDNA 与 dsDNA 比率以呈现液体状,如随后拉伸中的锯齿状图案所示。dsDNA 的存在将桥接力提高到 34 ± 8 pN,在添加外部 ssDNA 后恢复到 ~10 pN。根据这些单分子结果,鱼精蛋白-dsDNA 混合物形成固体状聚集体,需要添加 ssDNA 才能变成液滴。相反,添加 dsDNA 会减慢鱼精蛋白-ssDNA 液滴的融合。这项工作展示了桥接力的首次测量,并表明 ssDNA 与 dsDNA 比率可以调整蛋白质-DNA 凝聚物中桥接力的大小。

测量蛋白质-DNA 凝聚物中的桥接力

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